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口腔鳞癌线粒体DNAD环区HVR Ⅰ突变的研究

发布时间:2021-11-17 23:03
  目的:研究口腔颌面部鳞状细胞癌的线粒体DNA(mitochonDria DNA, mtDNA)复制控制区(D-Loop,D环区)的高变Ⅰ区(hypervariable region I, HVRI)的突变情况。方法:7例口腔鳞状细胞癌患者,取癌组织、癌旁组织及正常口腔粘膜的新鲜标本,投入液氮中保存,所有标本均经HE染色病理学诊断证实。应用GENMED组织/细胞线粒体DNA萃取试剂提取各标本的线粒体DNA (mtDNA),应用巢式PCR对D环区HVRⅠ进行扩增,对扩增产物进行测序分析,寻找突变位点。与GENBANK人类同源线粒体序列对比,当肿瘤组织、癌旁组织与正常组织序列不同时定义为突变,当肿瘤组织、癌旁组织、正常组织基因序列相同而与GENBANK中的序列不同时定义为基因的多态性。结果:经过基因测序、比对,7例口腔鳞癌组织标本中3例出现mtDNA D环区HVRⅠ的突变,突变率为43%,共70个突变位点,大多位于16024-16383区域内。A/G或C/T为13个,A、G转换为C、T为39个;碱基缺失12个,插入突变为6个。以点突变为主,约占突变形式的74%,插入突变和碱基缺失发生率在26... 

【文章来源】:青岛大学山东省

【文章页数】:66 页

【学位级别】:硕士

【部分图文】:

口腔鳞癌线粒体DNAD环区HVR Ⅰ突变的研究


第2例癌旁组织HVRI区测序波形图

波形图,正常组织,区测,青岛大学


青岛大学硕士学位论文第2例正常组织HVRI基因序列GCTAGCAGGCAI…TAGGC『l’rl’『l’l,GGCCTGAAGTAGGAACCAGATGTCGG川叭CAGTTCACTTI’AGCTACCCCCAAGTGTTATGGGCCCGGAGCGAGGAGAGTAGCACTCTTGTGCGGGATATTGATTTCACGGAGGATGGTGGTCAAGGGACCCC1’A1,CTGAGGGGGGTCATCCAI,GGGGGCGAGAAGGGAI,TTGACTGTAATGTGCTATGTACGGTAA户LTGGTTTTAJ,GTACTATGI’ACTGTTAAGGGTGGGTAGGTTTGTTGGT幻,CCTAGTGGGTGAGGGGTGGCTTTGGAGTTGCAGTTGATGTGTG川陕GTTGAAGGTTGGTTGCTGTACTTGCTTGTAAGCATGGGGGGGGGGTTTTGAl’『l’『l’TGG户江,TGGGTTTTTATGTACCACAGGTGGTCAAGI’Al”l‘『1‘『l’『l,GGGACCCTACAA刀汀TCAI,GGGGGCTGGGA川rA产TGrl’ACAAAAAAC川rAACGGTTGTTGAI,GGGGGA户L1,CAAAACTTGGGGGGGACCCAA产JTTGCTTCCCCTGAAAAAAAAAAA叨C阳CS0‘0BD和G

波形图,舌癌,癌组织,青岛大学


青岛大学硕士学位论文第3例舌癌癌组织IIVRI基因序列TCIT’IAGGCATCAGGC’ffl“fGGCCTGAAGTAGGAACCAGATGTCGGATACAGTTCAC‘l‘1JlAGCTACCCCCAAGTAGTTATGGGCCCGGAGCGAGGAGAGTAGCACTCTTGTGCGGGATATTGATTTCACGGAGGATGGTGGTCAAGGGACCCCTATCTGAGGGGGGTCATCCATGGGGACGAGAAGGGAI’l‘『l’GACTGTAATGTGCTATGTACGGTAAATGGC’l”l一1’ATGTACTATGTACTGTTAAGGGTGGGTAGGTTTGTTGGTATCCTAGTGGCTGAGGGGTGGCI一l’l,GGAGTTGCAGTTGATGTGTGATAGTTGAGGGTTGATTGCTGTACTTGCTTGTAAGCATGGGGGGGGGGGGTTGATAGGGGAA’l’1注,GGflffl一ffGCAACCACCGGGGGCCAAGGfffl一fl’GGGACCCGAACAAATTTCTGGGGGGCGGGGATTATGTTCCAAATTCCTTACCG’l一l一l’GTTGAGGGGGGAATAAAACCrFTGGGGGGCCCCCAAATTTGCTCTCCCCCAAAAAAAAAA90盯406080

【参考文献】:
期刊论文
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本文编号:3501795

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