深龋微生物碳水化合物活性酶的特征性研究

发布时间：2022-01-02 18:14

　　目的:了解深龋微生物碳水化合物活性酶特征。方法:收集第一恒磨牙深龋浅层和深层样本共16份,提取DNA后基因组高通量测序。测序结果比对NCBI nr及CAZy数据库,分析深龋微生物组成及碳水化合物活性酶特点。结果:深龋微生物在CAZy库中注释的酶家族主要为糖苷水解酶（47.28%）,其次为糖基转移酶（35.37%）,辅助氧化还原酶最少（0.38%）。相对丰度前10的活性酶主要集中在GH13和GH1家族。拟杆菌门包含相对比例最多的活性酶基因,且深龋浅层和深层微生物碳水化合物活性酶模式无明显差异（P>0.05）。结论:深龋浅层及深层微生物碳水化合物活性酶特征相似,基因组的酶谱分布提示其代谢蔗糖和淀粉类植物源性碳水化合物有遗传优势。拟杆菌门具有更广泛的碳水化合物底物。 

【文章来源】：临床口腔医学杂志. 2020,36(07)

【文章页数】：4 页

【部分图文】：

深龋微生物基因组比对CAZy库注释不同活性酶家族结果

在门水平分类层级上,深龋样本注释相对丰度位于前10的微生物种类,分别是放线菌(Actinobacteria)(35.85±21.05)%,厚壁菌(Firmicutes)(31.20±25.00)%,拟杆菌(Bacteroidetes)(13.58±13.06)%,变形菌(Proteobacteria)(3.58±3.83)%,梭杆菌(Fusobacteria)(2.54±3.83)%,螺旋体(Spirochaetes)(1.32±1.18)%,互养菌(Synergistetes)(1.02±2.37)%,暂定糖化菌(Candidatus Saccharibacteria)(1.01±1.41)%,子囊菌(Ascomycota)(0.09±0.23)%,衣原体(Chlamydiae)(0.05±0.04)%(图3)。排名前5的微生物种类包含CAZymes基因的比例分别为:放线菌25.18%;厚壁菌28.17%;拟杆菌30.15%;变形菌5.58%及梭杆菌3.78%。结果提示,拟杆菌门的细菌基因组检测出相对较多的CAZymes基因。图3 深龋微生物基因组于门分类水平前10位物种的注释结果

深龋微生物基因组于门分类水平前10位物种的注释结果

【参考文献】：
期刊论文
[1]基于高通量测序技术研究儿童龋病口腔微生物群落结构[J]. 隋文,朱宏,高文丽,洪咏龙.  临床口腔医学杂志. 2019(12)



本文编号：3564648