大鼠牙周炎对肠道菌群多样性的影响
发布时间：2022-01-23 01:19
背景:人体肠道中定植了一百万亿的微生物,它们被称为肠道菌群。随着测序技术的快速发展,肠道菌群的研究也越来越多,很多人都认为肠道菌群更像是一个器官,因为肠道菌群可起到预防肠道致病菌感染的作用,可以从我们的饮食中提取营养和能量,并在正常的免疫功能中发挥作用。但如果出现了菌群失调的情况,也可能产生一些致癌物质,或者通过影响宿主的糖、脂肪、蛋白质、炎症因子等物质代谢和转化导致疾病或者产生不适,对人体健康造成不利的影响。牙周炎是与牙齿生物膜功能失调有关的复杂的发炎性疾病,可引起牙周支持组织的长期慢性炎症,牙周炎与其他疾病之间存在一种机制,即牙周病原体及其致病因子可以到达远处的器官,然后引起系统性炎症并影响宿主的免疫防御。近年来,关于牙周炎和系统性疾病的研究越来越多,但是有关肠道菌群和牙周炎之间的关系的研究很少,更缺少相关的基础研究。目的:因此本研究拟通过动物实验的方式,用16S rDNA测序技术探究牙周炎大鼠模型的肠道中菌群的数量和结构的变化,通过菌群的组成和丰度变化揭示牙周炎和肠道菌群的关系。方法:选取22只8周龄的SPF级SD大鼠,计算机随机分为牙周炎组和对照组。牙周炎组的大鼠经过适应性饲养...
【文章来源】：河南大学河南省
【文章页数】：90 页
【学位级别】：硕士
【部分图文】：
实验流程
大鼠牙周炎对肠道菌群多样性的影响10图2-2数据分析流程2.2.5.2测序数据处理原始的数据经过质量过滤和数据拼接后，将相似度在97%的以上的tags聚类为一个操作分类单元（OperationalTaxonomicUnits，OTU）。通过数据库的对比生成各样本OTU表，基于OTU数据绘制OTUVenn图、OTUPCA分析、OTUPLS-DA分析、OTU累积曲线图和OTURank曲线。采用RDPclassifier贝叶斯算法对OTU序列进行分类学分析，并通过绘制物种丰度柱状图、关键物种差异比较柱状图对比两组之间的物种变化情况。基于OTU数据进行单一样本的α多样性和样本间β多样性分析。2.2.6数据分析本研究的统计分析采用定量和定性两种方法，数据记录采用Excel2016，数据处理采用R软件。肠道菌群的分析主要采用USEARCH（v11.0.667）、UCHIME（v4.2.40）、FastTree（version2.1.3）、R（v3.1.1）、FLASH（v1.2.11）和RDPclassifier贝叶斯算法等进行统计学分析和图像绘制。正态分布的连续性数据用“均数±标准差（mean±SD）”表示，非正态的的连续性数据用“中位数，四分位数”表示，各组间两两比较用SNK-q检验，P<0.05认为具有统计学差异。
3结果113结果3.1牙周建模结果3.1.1Micro-CT扫描结果通过SkyScan1176活体小动物CT对大鼠实验牙牙槽骨进行扫描，扫描参数：以9um空间分辨率进行360o旋转，管内电压58KV-429uA，图像分辨率4000×2672。通过NReCon进行三维重构，CTvox软件获取3D图片。结果提示：未进行牙周实验的对照组的牙槽骨未发现明显吸收，而牙周炎组的第二磨牙近中、远中牙槽嵴顶、根分叉处均发生明显吸收。（结果见图3-1，图3-2）图3-1牙周炎组Micro-CT扫描结果图3-2对照组Micro-CT扫描结果
【参考文献】：
期刊论文
[1]《中国心血管病报告2018》概要[J]. 胡盛寿,高润霖,刘力生,朱曼璐,王文,王拥军,吴兆苏,李惠君,顾东风,杨跃进,郑哲,陈伟伟. 中国循环杂志. 2019(03)
[2]Association of Streptococcus bovis presence in colonic content with advanced colonic lesion[J]. Maya Paritsky,Nina Pastukh,Diana Brodsky,Natalya Isakovich,Avi Peretz. World Journal of Gastroenterology. 2015(18)
[3]Role of dental plaque,saliva and periodontal disease in Helicobacter pylori infection[J]. Pradeep S Anand,Kavitha P Kamath,Sukumaran Anil. World Journal of Gastroenterology. 2014(19)
[4]Leaky gut and the liver: A role for bacterial translocation in nonalcoholic steatohepatitis[J]. Yaron Ilan. World Journal of Gastroenterology. 2012(21)
[5]幽门螺杆菌口腔定植和胃肠疾病的关联性研究[J]. 陈骏,何祥一,吴凌莉,车团结. 华西口腔医学杂志. 2011(04)
[6]新疆哈萨克族正常血压人群和高血压人群肠道菌群中拟杆菌属、梭菌属结构特征分析[J]. 刘金宝,王烨,王长辉,胡梦颖,李建娥,刘晶,毛新民,李琳琳. 中国微生态学杂志. 2010(05)
本文编号：3603298
【文章来源】：河南大学河南省
【文章页数】：90 页
【学位级别】：硕士
【部分图文】：
实验流程
大鼠牙周炎对肠道菌群多样性的影响10图2-2数据分析流程2.2.5.2测序数据处理原始的数据经过质量过滤和数据拼接后，将相似度在97%的以上的tags聚类为一个操作分类单元（OperationalTaxonomicUnits，OTU）。通过数据库的对比生成各样本OTU表，基于OTU数据绘制OTUVenn图、OTUPCA分析、OTUPLS-DA分析、OTU累积曲线图和OTURank曲线。采用RDPclassifier贝叶斯算法对OTU序列进行分类学分析，并通过绘制物种丰度柱状图、关键物种差异比较柱状图对比两组之间的物种变化情况。基于OTU数据进行单一样本的α多样性和样本间β多样性分析。2.2.6数据分析本研究的统计分析采用定量和定性两种方法，数据记录采用Excel2016，数据处理采用R软件。肠道菌群的分析主要采用USEARCH（v11.0.667）、UCHIME（v4.2.40）、FastTree（version2.1.3）、R（v3.1.1）、FLASH（v1.2.11）和RDPclassifier贝叶斯算法等进行统计学分析和图像绘制。正态分布的连续性数据用“均数±标准差（mean±SD）”表示，非正态的的连续性数据用“中位数，四分位数”表示，各组间两两比较用SNK-q检验，P<0.05认为具有统计学差异。
3结果113结果3.1牙周建模结果3.1.1Micro-CT扫描结果通过SkyScan1176活体小动物CT对大鼠实验牙牙槽骨进行扫描，扫描参数：以9um空间分辨率进行360o旋转，管内电压58KV-429uA，图像分辨率4000×2672。通过NReCon进行三维重构，CTvox软件获取3D图片。结果提示：未进行牙周实验的对照组的牙槽骨未发现明显吸收，而牙周炎组的第二磨牙近中、远中牙槽嵴顶、根分叉处均发生明显吸收。（结果见图3-1，图3-2）图3-1牙周炎组Micro-CT扫描结果图3-2对照组Micro-CT扫描结果
【参考文献】：
期刊论文
[1]《中国心血管病报告2018》概要[J]. 胡盛寿,高润霖,刘力生,朱曼璐,王文,王拥军,吴兆苏,李惠君,顾东风,杨跃进,郑哲,陈伟伟. 中国循环杂志. 2019(03)
[2]Association of Streptococcus bovis presence in colonic content with advanced colonic lesion[J]. Maya Paritsky,Nina Pastukh,Diana Brodsky,Natalya Isakovich,Avi Peretz. World Journal of Gastroenterology. 2015(18)
[3]Role of dental plaque,saliva and periodontal disease in Helicobacter pylori infection[J]. Pradeep S Anand,Kavitha P Kamath,Sukumaran Anil. World Journal of Gastroenterology. 2014(19)
[4]Leaky gut and the liver: A role for bacterial translocation in nonalcoholic steatohepatitis[J]. Yaron Ilan. World Journal of Gastroenterology. 2012(21)
[5]幽门螺杆菌口腔定植和胃肠疾病的关联性研究[J]. 陈骏,何祥一,吴凌莉,车团结. 华西口腔医学杂志. 2011(04)
[6]新疆哈萨克族正常血压人群和高血压人群肠道菌群中拟杆菌属、梭菌属结构特征分析[J]. 刘金宝,王烨,王长辉,胡梦颖,李建娥,刘晶,毛新民,李琳琳. 中国微生态学杂志. 2010(05)
本文编号：3603298
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