16SrRNA高通量测序研究有龋者唾液微生物群落结构及多样性

发布时间：2017-08-24 14:49

  本文关键词：16SrRNA高通量测序研究有龋者唾液微生物群落结构及多样性

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【摘要】：目的:通过16SrRNA高通量测序研究有龋和无龋者唾液的微生物群落结构及其差异。方法:在甘肃省康乐县景古镇居民口腔检查中随机选取14位汉族居民,其中,7例有龋(caries-active,CA组,DMFT≥4)、7例无龋(caries-free,CF组)。采取唾液样本,提DNA,PCR扩增,利用Illumina Miseq测序平台对16SrRNA V4区进行双端测序;利用Mothur、MEGAN4、Cluster 3.0和Java Treeview等软件进行细菌群落结构及多样性的差异分析。结果:共得到118151条优质序列,发现5738个OTUs,2795个物种,归属27个门,218个属。CA组和CF组唾液微生物群落结构有差异,其中,门水平上,Firmicutes和SR1在CA组显著低于CF组(P0.05)。属水平上,Rothia、Alistipes和Catonella在CA组显著低于CF组(P0.05),Scardovia在CA组显著高于CF组(P0.05);CA组和CF组OTUs分别为(550.2±26.48),(597.4±66.07),CA组和CF组Simpson多样性指数分别为(0.73±0.03),(0.49±0.01),均无统计学差异。结论:人类口腔唾液有复杂的微生物群落结构;在门水平和属水平上,有龋者的微生物种类较无龋者稍有减少;Firmicutes和SR1菌门,Rothia、Alistipes和Catonella菌属的存在与龋病呈负相关;相反地,Scardovia等菌属的存在与龋病呈正相关。
【作者单位】： 兰州大学口腔医学院修复科;西北民族大学口腔医学院;
【关键词】： 龋病 微生物群落结构 SrRNA高通量测序 唾液
【基金】：国家自然科学基金地区项目(编号:31160124/C0309、31360124/C0309) 甘肃省科技计划项目(编号:1204FKCA168、1308RJZA248)
【分类号】：R781.1
【正文快照】： 龋病是牙体硬组织的慢性感染性疾病,是口腔微生物菌群相互作用的结果,其严重危害着人类身心健康[1]。微生物、环境、宿主等因素共同影响着口腔群落结构,但微生物群落结构与龋病发病之间的关系尚不清晰[2]。利用传统微生物培养法目前已检测出很多龋病相关菌属,如Streptococcus,

【共引文献】

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