云南省外环境中人类埃柯病毒7型分子流行病学分析

发布时间：2018-11-12 13:19

【摘要】：为掌握云南省外环境中肠道病毒流行和进化趋势,对从云南省外环境标本中分离到的4株病毒进行VP1基因序列测定。用肠道病毒通用引物187、188、189/011扩增病毒VP1区,直接对聚合酶链反应产物进行测序。所得序列在基因库进行广泛搜索,并与所有EV基因的相同区域进行比较。结果4株病毒为ECHO7。运用Mega软件与从GenBank中搜索到的68个ECHO7VP1区基因序列进行同源性分析,发现云南省外环境和人际间ECHO7病毒位于不同的分支。说明不同ECHO7病毒流行有地域特点和时间流行特点,同一时间同一个地区内存在不同的传播链,中国云南省同一时间内外环境和人际间ECHO7病毒有不同的传播链且进化速度不同,值得关注。利用分子生物学方法持续对云南省外环境中肠道病毒进行监测,可为肠道病毒病的预警提供有力支持。
[Abstract]:In order to understand the trend of enterovirus epidemic and evolution in Yunnan Province, the VP1 gene sequences of 4 strains of enterovirus isolated from the samples of Yunnan province were sequenced. The VP1 region of enterovirus was amplified by 1878 1889 / 011, and the PCR products were sequenced directly. The sequences were searched extensively in the gene bank and compared with the same regions of all EV genes. Results the four viruses were ECHO7.. The homology analysis of 68 ECHO7VP1 gene sequences from GenBank by Mega software showed that the ECHO7 virus was located in different branches in Yunnan province. The results showed that different ECHO7 viruses had different regional and temporal characteristics, and different transmission chains existed in the same area at the same time, and ECHO7 viruses in Yunnan Province had different transmission chains and different speed of evolution at the same time. It deserves attention. Continuous monitoring of enterovirus in the environment outside Yunnan Province by molecular biological methods can provide strong support for early warning of enterovirus disease.
【作者单位】： 云南省疾病预防控制中心;
【基金】：国家自然科学基金(项目编号:81160198) 2010年云南省社会发展科技计划(2010CD118)
【分类号】：R181.3

【参考文献】

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【共引文献】

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【二级参考文献】

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本文编号：2327235