上海地区门诊儿童人副流感病毒的流行病学研究
发布时间：2020-08-07 13:39
【摘要】：第一部分：2009-2010年上海地区人副流感病毒流行病学研究及HPIV-3基因特征分析目的：研究上海地区上呼吸道感染患儿中人副流感病毒(Human Parainfluenza viruse, HPIVs)的流行病学规律,以及人3型副流感病毒(HPIV-3)的基因特征,为中国大陆地区人副流感病毒的分子流行病学研究积累数据。材料和方法：1.收集2009年6月7日至2010年6月5日在上海交通大学附属新华医院发热门诊就诊的有发热、咳嗽、流涕和咽痛等散发上呼吸道感染症状的患儿咽拭子标本164例。2.采用多重RT-PCR方法检测其包括HPIV1-4在内的多种常见呼吸道病原,并对HPIVs在婴幼儿呼吸道感染中所占的比例、性别、年龄和季节分布进行分析。3.选择检测出的HPIV-3阳性样本,用两对引物扩增出HPIV-3 HN基因的全长并测序,根据序列测定结果进行核苷酸和氨基酸的同源性分析,应用比邻法(Neighbor-Joining Tree)建立HPIV-3 HN基因的系统进化树。结果：1.164例患儿咽拭子标本均用Seeplex(?)RV15 ACE方法检测,共检测出病毒感染阳性病例129例,总检出率达78.7%,其中HPIVs检测总阳性率为42.7%(70/164),是检出率最高的呼吸道病毒。70例HPIVs阳性标本中,HPIV-1检出14例,阳性率为8.5%(14/164)；HPIV-2检出30例,阳性率为18.3%(30/164)；HPIV-3检出23例,阳性率为14.0%(23/164)；HPIV-4检出3例,阳性率为1.8%(3/164)。2.70例HPIVs阳性标本中,45.7%(32/70)存在混合感染。HPIVs感染在12-24月组患儿检出人数最多为74.1%(40/54),在0-12月组检出人数最低为9.7%(6/62), HPIVs在各年龄组间检出率差异具有统计学意义(χ2=50.408,P=0.000)。HPIVs感染患儿男女间检出率差异无统计学意义(χ2=1.844,P=0.204)。3.本地区HPIVs感染具有明显的季节性分布,春季(76.5%)和夏季(47.2%)的检出率高于秋季(32.3%)和冬季(22.2%),四个季节总检出率差异具有统计学意义(χ2=14.594,P=0.002)。4.基因同源性分析表明,5株HPIV-3上海株之间核苷酸和氨基酸的同源性分别为99.0-99.5%和99.7-100%,与11株国内代表株系的HPIV-3之间核苷酸和氨基酸的同源性分别为97.1-99.8%和99.0-100%；与日本(除去GP株)、印度和沙特阿拉伯这三个亚洲国家的HPIV-3之间核苷酸和氨基酸的同源性分别为96.0-98.7%和97.0-99.5%；与美国(除去俄克拉何马州)、加拿大和澳大利亚的HPIV-3之间核苷酸和氨基酸的同源性分别为94.4-95.4%和96.7-97.7%,同源性最低。5.系统进化树把5株HPIV-3上海株和36株代表株系共41株分为了A、B、C三个进化群,C群又进一步分为4个亚群C1-C4。C群主要由2002-2011年期间在亚洲国家发现的HPIV-3构成,传播范围较广,涉及日本、印度、沙特阿拉伯和中国,可能是现今亚洲地区HPIV-3流行的主要基因型。5株上海株和中国北京2008-2009年间的多个HPIV-3分离株都属于C3a株系,其中ShangHai.210与BJ001/08、ShangHai.1261与BJ001/08、ShangHai.1431与BJ005/08、ShangHai.1431与BJ270/09之间核苷酸的同源性分别为99.6%、99.4%、99.4%和99.1%,但是其氨基酸的同源性都为100%。结论：1.HPIVs在上海地区婴幼儿呼吸道感染中占有重要地位,42.7%的患儿HPIVs检测阳性,其中HPIV-2感染人数最多,HPIV-1和HPIV-3次之。2.HPIVS感染有明显的年龄分布特征,而无性别分布差异,在12-24月年龄组患儿检出人数最多。HPIVs感染也具有明显的季节性分布,流行高峰在春夏季。3.系统进化树把41株HPIV-3株系分为了A、B、C三个进化群,C群是现今亚洲地区流行的主要基因型。5株上海株和中国北京2008-2009年间的多个HPIV-3分离株都属于C3a株系,提示上海株可能是由北京株C3a亚群衍化而来。5株上海株与亚洲国家的多个HPIV-3株系均在同一亚群内,同源性也比较高,提示不同HPIV-3分离株之间的进化很可能具有地域相关性。第二部分：1996-2013年中国人群中副流感病毒感染流行病学的Meta分析目的：综合分析中国人群副流感病毒感染的流行状况,为PIVs感染的诊断和相关疾病的防治提供数据基础和科学根据。资料和方法：在Pubmed、相关期刊论文CNKI、维普中文科技期刊全文数据库、万方数据库中检索所有有关副流感病毒流行情况的文献,按照纳入及排除标准筛选出质量合格的文献,整理并制作成数据库进行Meta分析。结果：初选获得493篇文献,最终纳入文献52篇,总样本量为186,053例。我国急性呼吸道感染(ARI)患者中副流感病毒(PIVs)的综合感染率为6.8%：0-3岁组(≤1岁组7.7%和1-3岁组8.9%)PIVs综合感染率高于3岁组(6.8%),PIVs综合感染率在男女性别间差异无显著性；不同季节ARI患者PIVs的综合感染率分别为春季8.2%、夏季8.0%、秋季6.6%和冬季5.1%；上、下呼吸道感染中PIVs的综合感染率分别为7.2%和8.9%,PIVs感染较易引起支气管炎(9.3%)、肺炎(8.2%)和支气管肺炎(8.7%),毛细支气管炎的综合感染率稍低(7.1%)。结论：不同地区ARI患者PIVs的感染率各不相同；PIVs感染与患儿年龄呈负相关,与男女性别无关；PIVs的综合感染率春夏季偏高；PIVs感染以急性下呼吸道感染为主,主要为支气管炎、肺炎和支气管肺炎等。
【学位授予单位】：复旦大学
【学位级别】：硕士
【学位授予年份】：2014
【分类号】：R725.1;R181.3
【图文】：
产物１５份，阳性率为９．１％（１５／１６４），腺病毒（ＡＤＶ）和呼吸道合胞病毒Ｂ化ＳＶＢ）逡逑的阳性扩增产物均为］４份，阳性率均为８．５％邋（１４／１６４），其余病毒检出情况见逡逑表６，各病毒检出结果见图５。逡逑表６．１６４例患儿标本多重ＰＣＲ检测结果逡逑阳性数逦阳性率（0／0）逡逑ＨＲＶ逦３７逦７Ｘ６逡逑ＦｌｕＡ逦３２逦１９．５逡逑ＨＰＩＶ－２逦３０逦１８．３逡逑ＨＰＩＶ－３逦２３逦１４．０逡逑ＨＥＶ逦１５逦９．１逡逑ＨＰＩＶ－１逦１４逦８．５逡逑ＡＤＶ逦１４逦８．５逡逑民邋ＳＶＢ逦１４逦８．５逡逑２２邋化／ＮＬ６３逦８逦４．９逡逑ＨＢｏＶ逦６逦３．７逡逑民邋ＳＶＡ逦５逦３．０逡逑邮邋Ｂ逦５逦３．０逡逑ＨＰＩＶ－４逦３逦１．８逡逑ＯＣ４３／ＨＫＵ１逦２逦１．２逡逑ｈＭＰＶ逦１逦０．６逡逑总阳性样本数量逦１２９逦７８．７逡逑总阴性样本数量逦３５逦２１．３逡逑１９逡逑
复旦大学硕±学位论文逦第一部分逡逑（１１／５４），占ＨＰＩＶ－３感染总数的４７．８％邋（１１／２３），０－１２月年龄组检出率最低为４．８％逡逑（３／６２），各年龄组间检出率差异有统计学意义（片７．０３１，Ｐ＝０．０２９）。ＨＰＩＶ－４感染只发生在１２－３６月患儿，１２－２４月组和２４－３６月组的检出率分别为３．７％（２／５４）逡逑和２．１％（１／４８），各年龄组间检出率差异无统计学意义（护２．１８０，邋Ｐ＝０．２９０）。ＨＰＩＶｓ逡逑感染的年龄分布见图６－１０。逡逑表１０．不同年龄组册ＩＶｓ的检测情况由（。／训逡逑病毒邋０－１２月邋１２－２４月邋２４－％月逦统计学分析逡逑检出例数逦＾逦５４逦４８逡逑ＨＰｒＶｓ逦６（９．７）逦４０（７４．１）逦２４（５０．０）逦ｘ＾＝５０．４０８，逦Ｐ＝０．０００逡逑ＨＰＩＶ－１逦３（４．８）逦８（１４．刮逦３（６３）逦％￣＝４．１３３，逦Ｐ＝０．１３０逡逑ＨＰｌＶ－２逦０逦１９（３５．叫逦１１邋口２．９）邋ｘ＾＝３0－８８９，邋Ｐ＝０．０００逡逑ＨＰＩＶ－３逦３（４．８）逦１１（２０．４）逦９（１８．８）逦＾＝７．０３１，逦Ｐ＝０．０２９逡逑ＨＰＩＶ－４逦０逦２（３．７）逦１（２．１）逦Ｐ＝０．２９Ｑ逡逑
图１０．ＨＰＩＶ＂４年龄分布逡逑６．邋ＨＰＩＶｓ感染的季节分布逡逑２００９年６月到２０１０年６月研究期间，ＨＰＩＶｓ感染在１１个月中均有检出，逡逑但在０９年１２月未检测出病毒，１０年５月未收集到咽拭子标本，ＨＰＩＶｓ感染的逡逑时间的分布见图１１。由图ｎ可见，ＨＰＩＶｓ感染在２００９年７、８和９月呈现感染逡逑高峰，检出率分别为邋６０．０％邋（９／１５）、６１０％邋（１７／２７）、５２．２％邋（１２／２３）．邋１０邋月到逡逑２０１０年１月检出率逐渐降低，从２月到４月ＨＰＩＶｓ的感染又开始X椂啵斐雎叔义暇衷冢担埃埃ィ对轮匦鲁鱿至说诙龈腥靖叻濉１净龋校桑郑蟾腥揪哂忻飨藻义系募窘谛苑植迹杭荆ǎ罚叮担ィ┖拖募荆ǎ矗罚玻ィ┑募斐雎矢哂谇锛荆ǎ常玻常ィ┖湾义隙荆ǎ玻玻玻ィ母黾窘谧芗斐雎什钜炀哂型臣蒲б庖澹ㄆ保矗担梗矗澹校剑埃埃埃玻ｅ义希龋校桑郑痹谇铮幔叮唬欤ィ⒍ǎ罚矗ィ┝郊镜募斐雎示哂诖夯
本文编号：2784071
【学位授予单位】：复旦大学
【学位级别】：硕士
【学位授予年份】：2014
【分类号】：R725.1;R181.3
【图文】：
产物１５份，阳性率为９．１％（１５／１６４），腺病毒（ＡＤＶ）和呼吸道合胞病毒Ｂ化ＳＶＢ）逡逑的阳性扩增产物均为］４份，阳性率均为８．５％邋（１４／１６４），其余病毒检出情况见逡逑表６，各病毒检出结果见图５。逡逑表６．１６４例患儿标本多重ＰＣＲ检测结果逡逑阳性数逦阳性率（0／0）逡逑ＨＲＶ逦３７逦７Ｘ６逡逑ＦｌｕＡ逦３２逦１９．５逡逑ＨＰＩＶ－２逦３０逦１８．３逡逑ＨＰＩＶ－３逦２３逦１４．０逡逑ＨＥＶ逦１５逦９．１逡逑ＨＰＩＶ－１逦１４逦８．５逡逑ＡＤＶ逦１４逦８．５逡逑民邋ＳＶＢ逦１４逦８．５逡逑２２邋化／ＮＬ６３逦８逦４．９逡逑ＨＢｏＶ逦６逦３．７逡逑民邋ＳＶＡ逦５逦３．０逡逑邮邋Ｂ逦５逦３．０逡逑ＨＰＩＶ－４逦３逦１．８逡逑ＯＣ４３／ＨＫＵ１逦２逦１．２逡逑ｈＭＰＶ逦１逦０．６逡逑总阳性样本数量逦１２９逦７８．７逡逑总阴性样本数量逦３５逦２１．３逡逑１９逡逑
复旦大学硕±学位论文逦第一部分逡逑（１１／５４），占ＨＰＩＶ－３感染总数的４７．８％邋（１１／２３），０－１２月年龄组检出率最低为４．８％逡逑（３／６２），各年龄组间检出率差异有统计学意义（片７．０３１，Ｐ＝０．０２９）。ＨＰＩＶ－４感染只发生在１２－３６月患儿，１２－２４月组和２４－３６月组的检出率分别为３．７％（２／５４）逡逑和２．１％（１／４８），各年龄组间检出率差异无统计学意义（护２．１８０，邋Ｐ＝０．２９０）。ＨＰＩＶｓ逡逑感染的年龄分布见图６－１０。逡逑表１０．不同年龄组册ＩＶｓ的检测情况由（。／训逡逑病毒邋０－１２月邋１２－２４月邋２４－％月逦统计学分析逡逑检出例数逦＾逦５４逦４８逡逑ＨＰｒＶｓ逦６（９．７）逦４０（７４．１）逦２４（５０．０）逦ｘ＾＝５０．４０８，逦Ｐ＝０．０００逡逑ＨＰＩＶ－１逦３（４．８）逦８（１４．刮逦３（６３）逦％￣＝４．１３３，逦Ｐ＝０．１３０逡逑ＨＰｌＶ－２逦０逦１９（３５．叫逦１１邋口２．９）邋ｘ＾＝３0－８８９，邋Ｐ＝０．０００逡逑ＨＰＩＶ－３逦３（４．８）逦１１（２０．４）逦９（１８．８）逦＾＝７．０３１，逦Ｐ＝０．０２９逡逑ＨＰＩＶ－４逦０逦２（３．７）逦１（２．１）逦Ｐ＝０．２９Ｑ逡逑
图１０．ＨＰＩＶ＂４年龄分布逡逑６．邋ＨＰＩＶｓ感染的季节分布逡逑２００９年６月到２０１０年６月研究期间，ＨＰＩＶｓ感染在１１个月中均有检出，逡逑但在０９年１２月未检测出病毒，１０年５月未收集到咽拭子标本，ＨＰＩＶｓ感染的逡逑时间的分布见图１１。由图ｎ可见，ＨＰＩＶｓ感染在２００９年７、８和９月呈现感染逡逑高峰，检出率分别为邋６０．０％邋（９／１５）、６１０％邋（１７／２７）、５２．２％邋（１２／２３）．邋１０邋月到逡逑２０１０年１月检出率逐渐降低，从２月到４月ＨＰＩＶｓ的感染又开始X椂啵斐雎叔义暇衷冢担埃埃ィ对轮匦鲁鱿至说诙龈腥靖叻濉１净龋校桑郑蟾腥揪哂忻飨藻义系募窘谛苑植迹杭荆ǎ罚叮担ィ┖拖募荆ǎ矗罚玻ィ┑募斐雎矢哂谇锛荆ǎ常玻常ィ┖湾义隙荆ǎ玻玻玻ィ母黾窘谧芗斐雎什钜炀哂型臣蒲б庖澹ㄆ保矗担梗矗澹校剑埃埃埃玻ｅ义希龋校桑郑痹谇铮幔叮唬欤ィ⒍ǎ罚矗ィ┝郊镜募斐雎示哂诖夯
本文编号：2784071
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