KRT6B在膀胱癌上的表达及其预后意义的研究

发布时间：2020-10-17 16:42

　　 研究目的:该研究在同领域者研究的基础上,目的在于:1.发现肌层浸润性膀胱癌患者不同临床病理特征与KRT6B表达水平的关系。2.评估肿瘤组织和癌旁正常组织中KRT6B表达的关系。3.探讨KRT6B表达与肌层浸润性膀胱癌患者预后的关系。4.寻找KRT6B在膀胱癌肿瘤细胞上表达的位置。希望通过该研究能够找到跟膀胱癌有关的新的标记物,以利于膀胱癌的诊断,以利于后期评估患者预后。给治疗新靶点的发现提供新的方向和思路。研究方法:膀胱癌患者肿瘤组织及癌旁正常组织的所有基因mRNA表达的原始数据来源于TCGA公共数据库。我们从中获得所需要的KRT6B mRNA原始表达数据。从Firehose上获取膀胱癌患者的所有临床资料信息。利用R软件和edgeR包标准化KRT6B mRNA表达谱原始数据。然后将数据与临床进行资料整合。经过排除,最终选定403例肌层浸润性膀胱癌病例和19例癌旁正常组织。定义KRT6B mRNA表达量≥中位数(35.80)为高表达。KRT6B mRNA表达量35.80为低表达。评定各临床病理特征与KRT6B mRNA表达水平的关系采用卡方检验。肿瘤组织与癌旁正常组织KRT6B mRNA表达量的关系用非参数检验。分析膀胱癌的预后采用Cox回归分析。采用Kaplan-Meier法绘制相关生存曲线。当P0.05时才认为具有统计学意义。为了观察KRT6B蛋白在膀胱癌的表达位置,我们采用免疫组化染色方法。研究结果:1.KRT6B mRNA在患者不同性别之间(P0.05)、不同肤色之间(P0.05)、不同病理分级之间(P0.05)、不同亚型之间(P0.05)以及淋巴结转移与否(P0.05)中差异均存在统计学意义。KRT6B mRNA在不同年龄、肿瘤浸润深度、淋巴管血管的侵犯情况、复发情况之间的差异均无统计学意义(均P值0.05)。2.KRT6B mRNA在肌层浸润性膀胱癌肿瘤组织和癌旁正常组织中的表达存在显著性差异(P0.05)。MIBC肿瘤组织中KRT6B mRNA的表达量较癌旁正常组织高。3.经COX单因素、多因素分析结果显示:MIBC患者的KRT6B mRNA的表达水平、年龄、复发情况、淋巴结转移情况和肿瘤的浸润深度都是影响MIBC患者总生存期的独立危险因素(P均0.05),MIBC组织学亚型与其预后也相关。然而MIBC的肤色、性别、脉管侵犯情况同MIBC患者预后的关系统计结果无明显统计学意义(P0.05)。4.免疫组化结果显示KRT6B蛋白在膀胱癌肿瘤细胞的胞膜和胞浆均可表达。结论1.KRT6B可能参与了MIBC的发生和进展。2.KRT6B的表达水平影响MIBC患者的预后。3.KRT6B蛋白在膀胱癌肿瘤组织中有表达,且细胞浆或细胞膜上表达。
【学位单位】：天津医科大学
【学位级别】：硕士
【学位年份】：2019
【中图分类】：R737.14
【部分图文】：

膀胱癌的表达及预后意义1.1 对象和方法1.1.1 研究对象1.1.1.1 KRT6B mRNA 表达数据及临床资料的来源本研究的所有数据均来源于 TCGA 公共数据库。进入 TCGA 官网（https://cancergenome.nih.gov/），登陆 GDC 数据门户。在“Repository”界面下设定检索条件，如图 1.1。其一、Cases 条件界面中 Primary Site 选定 Bladder；Program选定 TCGA；其它条件为系统默认选项。其二 Files 条件界面选项中选定Transcriptome Profiling，Gene Expression Quantification 和 HTSeq – Counts；Files中的其它条件为系统默认选项。最终从中共获取 433 个膀胱癌患者样本原始基因表达谱数据，其中包括 414 例膀胱癌肿瘤组织和 19 例癌旁正常膀胱组织的原始 mRNA 表达数据。

图1.2 FIREHOSE登陆界面1.1.1.2 入组标准纳入标准：①包含KRT6B mRNA原始表达数据的膀胱癌病例；②有基本资料和临床病理信息的病例；③被明确诊断为MIBC的病例；④已经死亡的病例且有明确死亡时间的病例；⑤膀胱癌癌旁正常组织病例。排除标准：①排除无临床基本资料和病理信息的病例；②排除被明确诊断为NMIBC的病例；③排除已死亡的却没有明确死亡时间的病例；④排除重复检测的病例。由于TCGA数据库中膀胱癌患者临床资料信息的收录存在不同程度的缺失，我们将各组内没有相关临床资料信息的病例予以剔除。所以最终纳入各临床特征下的病例总数不均相等。

T2、T3、T4期MIBC患者K-M生存曲线（P＜0.05）
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本文编号：2845054