ⅢA型CP/CPPS患者精液中ncRNA表达谱鉴定及miRNA差异筛选

发布时间：2020-12-21 19:27

　　目的：检测ⅢA型CP/CPPS患者精液中ncRNA的表达谱,并对健康男性和ⅢA型CP/CPPS患者精液中miRNA进行筛选。方法：筛选ⅢA型CP/CPPS患者,留取精液作为疾病组,以健康成年男性精液作为对照,分别提取总RNA。通过胶回吸收方法收集ncRNA,引入3’和5’adaptor接头,RT-PCR方法建立ncRNA cDNA文库,采用solexa高通量测序技术分析两组患者精液中ncRNA表达情况,并对比分析患者精液与正常精液中miRNA差异表达,筛选出主要差异表达的miRNA分子。结果：1、疾病组中的特有序列与Genbank中ncRNA进行比对,发现1341489个序列中rRNA117574个、scRNA7300个、snRNA4347个、snoRNA889个、tRNA49431个、其他1161948个；疾病组的公共序列与Genbank中ncRNA进行比对,发现39833420个序列中rRNA13484159个、scRNA1017352个、snRNA328085个、snoRNA5364个、tRNA5245222个、其他19753238个。2、最终纳入差异分析的miRNA共486个,... 

【文章来源】：兰州大学甘肃省 211工程院校 985工程院校 教育部直属院校

【文章页数】：54 页

【学位级别】：硕士

【文章目录】：
中文摘要
Abstract
缩略词表
前言
一、材料与方法
    1 材料
        1.1 试剂及仪器
    2 研究方法
        2.1 标本选择
            2.1.1 标本来源
            2.1.2 常规检查及专科问诊
            2.1.3 纳入及排除标准
            2.1.4 知情同意及科研伦理报告
        2.2 标本收集
            2.2.1 前列腺液检查标准
            2.2.2 前列腺液收集
        2.3 精液处理
            2.3.1 精液留取
            2.3.2 精液分离处理
            2.3.3 混合后精液的处理
        2.4 RNA的处理
            2.4.1 提取RNA
            2.4.2 RNA质量的检测
        2.5 胶分离及回收ncRNA
            2.5.1 胶分离ncRNA
            2.5.2 回收ncRNA
        2.6 5'端及3'端adaptor连接
            2.6.1 5'端adaptor连接
            2.6.2 纯化回收5端adaptor连接产物
            2.6.3 3'端adaptor连接
            2.6.4 3'端adaptor连接纯化回收连接产物
        2.7 ncRNA cDNA文库建立
            2.7.1 RT-PCR扩增
            2.7.2 PCR产物回收纯化
            2.7.3 Small RNA已制备产物经Agilent2100检测
        2.8 Solexa检测
        2.9 统计分析
二、结果
    1 参与者基本信息
    2 ncRNA质量及长度分布
    3 疾病组与对照组公共特有序列
    4 疾病组与对照组标准信息分析
        4.1 疾病组与对照组基因组比对
        4.2 sRNA重复序列比对
    5 Genbank中ncRNA的小RNA统计
    6 匹配内含子、外显子的sRNA统计
    7 sRNA的分布
    8 差异分析
        8.1 聚类分析
        8.2 主要差异表达分子
三、讨论
四、结论
五、参考文献
六、附综述
    参考文献
七、在学期间的研究成果
致谢


【参考文献】：
期刊论文
[1]不同类型慢性前列腺炎前列腺液锌含量的分布及意义[J]. 周任远,张燕宾,马凤宁,何家扬.  临床泌尿外科杂志. 2004(03)



本文编号：2930367