尿液微生态及其对前列腺癌诊断价值的初步研究
发布时间:2022-02-14 11:20
目的:分析前列腺癌尿液微生态菌群的改变,明确前列腺癌及良性前列腺增生人群尿液微生态菌群的差异,筛选出能够特异性区分前列腺癌的尿液微生态指标。方法:本研究为前瞻性研究,研究纳入两组队列,前列腺癌组和良性前列腺增生对照组。前列腺癌组和良性前列腺增生对照组在年龄上严格匹配。前列腺癌组和良性前列腺增生对照组均是来自浙江大学医学院附属第一医院泌尿外科门诊以总前列腺特异抗原(total prostate specific antigen,tPSA)升高待查(前列腺癌可能)入院行经会阴前列腺穿刺活检的患者。经会阴前列腺穿刺前一天取所有患者的尿液,穿刺后依据病理结果进行分组。前列腺癌病理组织切片进行荧光原位杂交,前列腺癌组和良性前列腺增生对照组人群尿液样本通过对16S rRNAV3-V4区靶向扩增和PCR产物纯化后进行二代测序分析尿液微生态菌群情况。利用方差分析比较前列腺癌组和良性前列腺增生对照组之间的尿液优势菌群差异性,筛选前列腺癌相关的特异性尿液菌群;采用Pearson相关性分析,比较前列腺癌组主要差异微生态菌群与临床指标的相关性,建立指标模型,并将指标模型进行受试者工作特征曲线拟合检验分析,计算...
【文章来源】:浙江大学浙江省211工程院校985工程院校教育部直属院校
【文章页数】:121 页
【学位级别】:博士
【部分图文】:
图1.1细菌在前列腺癌组织的自发荧光照片??
菌群丰富度与良性前列腺增生对照俎相比无显著统计学差异。韦恩图表明在4,030??个OTUs中,两组共有OTUs为867个,1,726个OTUs为前列腺癌组独有,1,437??个OTUs为良性前列腺增生对照组独有(见图1.6)。Pearson相关分析表明前列腺??癌组和良性前列腺增生对照组的微生态多样性特征与年龄不具统计学意义(见表??1.6)。??表1.5前列腺癌组和良性前列腺增生对照组多样性参数比较??Benign?Prostate?cancer??P?Value??(n-30)?(n=30)??Observed?OTUs?217土248?230土?119?0.787??Chao?1?index?331?土318?356士?174?0.702??Shannon?index?3.28土?1.63?3.64土?1.23?0.344??Simpson?index?0.67士0.28?0.72土0??19?0.379??ACE?317±307?342士?164?0.694??OTUs:?the?operational?taxonomy?units,可操作分类单元定义为?97%—?致性;ACE:??Abundance-based?Coverage?Estimator,基于多度的物种估计量??20??
?NU??Group??图1.2?Shannon-Wiener曲线,用于比较两组尿液微生态多样性。红色代表前列腺??癌组,蓝色代表良性前列腺增生对照组。??21??
本文编号:3624456
【文章来源】:浙江大学浙江省211工程院校985工程院校教育部直属院校
【文章页数】:121 页
【学位级别】:博士
【部分图文】:
图1.1细菌在前列腺癌组织的自发荧光照片??
菌群丰富度与良性前列腺增生对照俎相比无显著统计学差异。韦恩图表明在4,030??个OTUs中,两组共有OTUs为867个,1,726个OTUs为前列腺癌组独有,1,437??个OTUs为良性前列腺增生对照组独有(见图1.6)。Pearson相关分析表明前列腺??癌组和良性前列腺增生对照组的微生态多样性特征与年龄不具统计学意义(见表??1.6)。??表1.5前列腺癌组和良性前列腺增生对照组多样性参数比较??Benign?Prostate?cancer??P?Value??(n-30)?(n=30)??Observed?OTUs?217土248?230土?119?0.787??Chao?1?index?331?土318?356士?174?0.702??Shannon?index?3.28土?1.63?3.64土?1.23?0.344??Simpson?index?0.67士0.28?0.72土0??19?0.379??ACE?317±307?342士?164?0.694??OTUs:?the?operational?taxonomy?units,可操作分类单元定义为?97%—?致性;ACE:??Abundance-based?Coverage?Estimator,基于多度的物种估计量??20??
?NU??Group??图1.2?Shannon-Wiener曲线,用于比较两组尿液微生态多样性。红色代表前列腺??癌组,蓝色代表良性前列腺增生对照组。??21??
本文编号:3624456
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