DNA羟甲基化和组蛋白甲基化表观修饰的疾病关联性研究

发布时间：2023-01-30 20:18

　　绝大多数人类重大疾病的病因和发病机制极其复杂。近年来大量研究表明表观遗传在许多人类疾病的形成过程中起着重要的作用。最近研究发现,一种新的DNA修饰一一5羟甲基胞嘧啶（5hmC）在许多组织中广泛存在。5hmC作为一种新的表观遗传标记,与许多人类疾病的关联所知甚少。在本论文中,我们综合利用分子生物学、生物化学、基因组学和生物信息学交叉手段,探寻DNA羟甲基化和组蛋白甲基化与肺腺癌和男性不育症的关联性。 肺癌列居恶性肿瘤致死类型的首位,其中肺腺癌是常见的肺癌类型。与癌旁组织相比,我们发现5hmC在肺腺癌组织中出现大量缺失的现象。进一步利用化学标记和生物素亲和吸附方法富集了一例肺腺癌患者癌组织和癌旁组织含5hmC的DNA片段并应用于高通量测序,生物信息分析表明5hmC在肺腺癌基因组中主要以中等密度CpGs分布于基因的内含子和基因间区域。通过分析比较肺腺癌组织及对应的癌旁组织,我们发现肺腺癌的5hmC缺失与许多重要的癌症通路和癌症相关信号通路密切相关。我们的结果表明在肺腺癌的发生发展过程中,5hmC的丢失可能是肺腺癌的一种表观遗传标志。另一方面,我们还绘制了一例肺腺患者癌组织及其癌旁组织的... 

【文章页数】：51 页

【学位级别】：硕士

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致谢
摘要
ABSTRACT
专业词汇中英文对照表
1 引言
    1.1 表观遗传学
        1.1.1 DNA甲基化
        1.1.2 组蛋白修饰
    1.2 表观遗传学与癌症
    1.3 表观遗传学与不育症
    1.4 本论文的主要内容及研究意义
        1.4.1 选题依据和研究意义
        1.4.2 主要研究内容及技术路线
2 材料与方法
    2.1 病例样本获取及处理
    2.2 基因组DNA提取
        2.2.1 肺癌组织基因组DNA提取
        2.2.2 精子基因组DNA提取
    2.3 DNA斑点杂交
    2.4 5hmC DNA富集
    2.5 染色体免疫共沉淀
    2.6 文库构建及测序
    2.7 生物信息学分析
3 实验结果
    3.1 肺腺癌5hmC和组蛋白甲基化图谱及变化规律
        3.1.1 肺腺癌基因组5hmC水平变化
        3.1.2 肺腺癌5hmC DNA的富集及测序
        3.1.3 5hmC在肺腺癌中的分布及特征
        3.1.4 肺腺癌5hmC的缺失与重要癌症通路相关联
        3.1.5 肺腺癌组蛋白甲基化图谱
    3.2 精子5hmC DNA甲基化图谱及变化规律
        3.2.1 人正常和畸形精子提取和分离
        3.2.2 检测5hmC在精子基因组中的含量
        3.2.3 5hmC在精子基因组的分布及特点
        3.2.4 精子基因组5hmC功能富集分析
        3.2.5 5hmC与印记基因
4 分析与讨论
    4.1 5hmC DNA和组蛋白甲基化对肺腺癌发生发展的作用及机制
    4.2 5hmC DNA调控精子发育及其不育的作用及机制
参考文献
附录
作者简介及在学期间发表的学术论文与研究成果



本文编号：3733413