2011-2013年柳州市部分HIV-1毒株gag基因测定及亚型分析

发布时间：2017-10-29 12:20

  本文关键词：2011-2013年柳州市部分HIV-1毒株gag基因测定及亚型分析

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【摘要】：目的了解2011-2013年柳州市人类免疫缺陷病毒1(human immunodeficiency virus 1,HIV-1)亚型分布、流行毒株情况。方法从2011-2013年柳州市HIV-1毒株样本中采用单纯随机抽样方法抽取120株作为研究对象,将120份样本从血浆中抽提核酸RNA,扩增HIV-1 gag基因片段,送至北京六合华大基因科技股份有限公司测序。合格序列利用数据库分析亚型以及利用MEGA5构建系统进化树。结果得到合格的gag基因片段98条序列。来自gag基因片段的序列分析重组流行毒株(circulate recombinant forms,CRFs)的重组亚型CRF01_AE占95.9%(94/98),异性传播比例为79.8%(75/94);重组亚型CRF07_BC占4.1%(4/98)。样本1LZ022和1LZ032,1LZ025和3LZ029的bootstrap值分别为99.0%,100.0%,两两之间传播途径不同。结论 2011-2013年,柳州市HIV-1以重组亚型CRF01_AE为主。柳州市重组亚型CRF01_AE从吸毒人群向异性接触感染人群蔓延。利用系统进化关系结合传播途径,便于分析传染源,为艾滋病干预措施提供有力佐证。
【作者单位】： 柳州市疾病预防控制中心主任办公室;柳州市疾病预防控制中心微生物检验科;柳州市疾病预防控制中心性病与艾滋病防控科;
【关键词】： HIV- 基因 gag 获得性免疫缺陷综合征
【基金】：广西科学技术厅立项课题(1140003A-44)
【分类号】：R512.91
【正文快照】： (Chin J Dis Control Prev 2016,20(8):781-784)黎明强和黄萍为共同第一作者人类免疫缺陷病毒(human immunodeficiency vi-rus,HIV)是RNA逆转录病毒,它的一个重要特征为高度变异,原因是HIV在复制过程中逆转录酶的忠实性较差,缺乏3’-5’外切核酸的校读功能,从而导致RNA转录为D

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1 韩照中，杨佩英，秦鄂德，，于曼，徐品芳，司炳银;登革2型病毒43株膜蛋白前体基因片段的克隆与表达[J];中华微生物学和免疫学杂志;1994年05期

本文编号：1112970