大连地区HIV-1 CRF01_AE亚型株基因特征分析

发布时间：2017-11-11 08:32

  本文关键词：大连地区HIV-1 CRF01_AE亚型株基因特征分析

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【摘要】：目的了解大连地区HIV-1 CRF 01_AE亚型株的基因特征及其可能传播链。方法对2008—2012年新确认144份全血标本进行血浆分离和HIV RNA提取,巢式PCR扩增Env基因并进行序列测定,并对CRF 01_AE亚型毒株序列进行生物信息学分析。结果得到的HIV感染者有效基因序列中,CRF 01_AE亚型占62.14%(64/103),所有病例均为性接触途径传播。系统进化树分析大连CRF 01_AE存在2个簇,分别以男男同性传播和异性传播毒株为主,其中男男同性性接触人群(MSM)簇组内平均基因离散率小于异性性接触者(Hetero)簇;与其他地区的CRF 01_AE亚型株构建的系统进化树显示2簇内均无其他国家序列,MSM簇与辽宁(除大连地区,下同)、北京和吉林MSM人群的CRF 01_AE亚型株位于同一分支,Hetero簇毒株则与辽宁、北京的MSM流行株及东南沿海地区异性传播CRF 01_AE亚型株遗传距离相近。结论大连市HIV-1 CRF 01_AE株主要通过性接触传播,男男同性传播毒株占主导优势,毒株传入大连时间晚于异性性接触者簇流行株;MSM存在2个以上传播链,与北方部分地区MSM人群中CRF 01_AE亚型株存在多次传播。
【作者单位】： 大连市疾病预防控制中心;
【分类号】：R512.91
【正文快照】： 人类免疫缺陷病毒(human immunodeficiencyvirus,HIV)是引起艾滋病(acquired immune defi-ciency syndrome,AIDS)的唯一病原[1-2],根据对病毒的全基因序列分析以及艾滋病病毒系统分类标准可以分为HIV-1和HIV-2型,目前流行全球的HIV-1分为M(main)、O(outlier)和N(non-M-non-O)3

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1 金奇;病毒的进化分析[J];中华实验和临床病毒学杂志;1997年02期

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本文编号：1170624