2型糖尿病易感候选基因在世界不同人群中的多样性比较分析

发布时间：2017-11-13 04:03

  本文关键词：2型糖尿病易感候选基因在世界不同人群中的多样性比较分析

  更多相关文章： 型糖尿病 易感基因 遗传多样性 单核苷酸多态性 世界人群

【摘要】：近10年来兴起的全基因组关联分析(Genome-wide association study,GWAS)相关研究结果获得了大量与2型糖尿病相关的候选易感基因,了解这些候选基因在正常人群中的遗传多样性程度以及在不同人群间的遗传差异,不但有助于阐明2型糖尿病的遗传机理,而且对于今后在特定人群中进行2型糖尿病发病机制的深入研究具有指导意义。本研究通过对GWAS数据库和相关文献的搜索和整理确定了170个与2型糖尿病相关的基因或基因区域;随后基于千人基因组计划的全基因组测序数据对这些候选基因在世界范围内14个人群间的遗传多样性进行了比较分析;进一步确定了在人群间存在显著差异的易感基因,并分析了这些基因的多样性特征。在所研究的14个世界人群中,2型糖尿病候选易感基因的遗传多样性与基因组范围的平均水平没有显著差异;但其中8个易感基因IL20RA、RNMTL1-NXN、NOTCH2、ADRA2A-BTBD7P2、TBC1D4、RBM38-HMGB1P1、UBE2E2和PPARD在群体间呈现显著差异,其中最明显的是IL20RA基因(FST=0.152),该易感基因在非洲人群和非非洲人群间存在显著等位基因频率和单倍型频率差异。14个人群中易感基因遗传结构差异的主要原因是由于非洲人群与非非洲人群之间的群体遗传结构的不同所造成的。进一步比较东西方人群间的2型糖尿病候选基因遗传结构差异,发现在东西方人群中同样存在明显的群体遗传结构差别,其中DGKB-AGMO(FST=0.173)和JAZF1(FST=0.182)是差异最显著的易感基因。本研究通过对群体间2型糖尿病易感基因遗传结构进行比较,鉴别出一些差异特别显著的易感基因,对今后2型糖尿病易感基因与不同人群间发病率和易感性差异的相关研究提供重要参考。
【作者单位】： 新疆医科大学基础医学院生物化学与分子生物学教研室;中科院?马普学会计算生物学伙伴研究所中国科学院计算生物学重点实验室;中国科学院大学;新疆医科大学第一附属医院医学检验中心;上海科技大学生命科学与技术学院;遗传与发育协同创新中心;
【基金】：国家自然科学基金项目(编号:91331204,31260263)资助~~
【分类号】：R587.1
【正文快照】： 1.新疆医科大学基础医学院生物化学与分子生物学教研室,乌鲁木齐830000;2.中科院?马普学会计算生物学伙伴研究所,中国科学院计算生物学重点实验室,上海200031;3.中国科学院大学,北京100049;4.新疆医科大学第一附属医院医学检验中心,乌鲁木齐830000;5.上海科技大学生命科学与技

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本文编号：1178986