基于互信息分析系统性红斑狼疮与乳腺癌的发病机理

发布时间：2017-12-14 21:37

  本文关键词：基于互信息分析系统性红斑狼疮与乳腺癌的发病机理

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【摘要】：系统性红斑狼疮(systemic lupus erythematosus,SLE)是一种免疫性性疾病。乳腺癌(breast cancer,BC)即乳腺恶性肿瘤,是女性常见的恶性肿瘤之一。乳腺癌患者体内众多免疫功能低下,其免疫系统无法识别并杀死癌细胞,然而,系统性红斑狼疮患者体内免疫系统反应过度强烈,产生大量抗体攻击自身细胞,可见两种疾病均与免疫系统息息相关但调控结果背道而驰,目前这一机制尚不明确。基于此,本研究从基因之间的关联性考虑,首先,利用互信息(mutual information,MI)方法筛选出1 250个SLE与BC共有显著基因;第二,将这些基因利用David分析,得到37个转录因子及其调控的378个靶基因,最后,采用快速网络成分分析算法(fast network component analysis,Fast NCA)分别预测SLE和BC发病过程中转录因子活性以及对靶基因调控强度的变化,并构建调控网络。经过两种疾病调控网络对比,发现AKT2、CCAR1、MTF2、RUFY2等基因在这两种疾病中活性变化明显相反,并且通过分子生物学分析,它们在有丝分裂,细胞凋亡,免疫反应以及炎症反应过程中的变化对SLE与BC的致病具有重要作用。
【作者单位】： 上海海事大学信息工程学院;美国罗文大学生物化学系;
【基金】：国家自然科学基金项目(61271446) 上海市教委科研创新项目(15ZZ079)共同资助
【分类号】：R593.241;R737.9
【正文快照】： Analysis of Pathogenesis between Systemic Lupus Erythematosus andBreast Cancer Based on Mutual InformationZhu Mengxing1Kong Wei1*Mou Xiaoyang21 Information Engineering College,Shanghai Maritime University,Shanghai,201306;2 Department of Chemistry and Bio

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