APOB、LIPC、LDLR和LPA基因多态性与2型糖尿病的关联研究
本文选题：2型糖尿病 切入点：APOB基因 出处：《广西医科大学》2017年硕士论文 论文类型：学位论文
【摘要】：目的:研究脂质消化、动员和转运通路(lipid digestion,mobilization and transport pathway)上的APOB基因rs679899、LIPC基因rs6078和rs6083、LDLR基因rs3826810、LPA基因rs3798220基因多态性与广西地区人群中2型糖尿病的关联性。方法:采用病例对照的研究方法,929例2型糖尿病患者和1044例健康对照作为研究对象。采集研究对象的外周静脉血,利用试剂盒法提取DNA,应用基质辅助激光解析电离飞行时间质谱技术(MALDI-TOF-MS)对5个SNPs(rs679899、rs6078、rs6083、rs3826810、rs3798220)进行基因分型。本研究中成组t检验和F检验用于计量资料的比较,χ2检验用于计数资料的比较;采用plink软件分析hardy-weinberg遗传平衡检验、SNPs等位位点频率及基因型分布;使用haploview4.2软件分析连锁不平衡检验(LD)和单倍体分析;多因子降维法(MDR)被用于不同SNPs之间交互作用模型的构建;二分类非条件logistic回归分析被用于基因-环境交互作用的分析。以上全部检验均采用双侧检验,检验水准α=0.05。结果:(1)一般人口学特征:经plink软件计算,剔除76例样本,最终,本次研究纳入2型糖尿病病例890例,对照组1007例,病例组的平均年龄64.79±10.03岁,对照组的平均年龄64.02±9.49岁。病例组和对照组在饮酒情况、BMI、TC、TG、HDL方面的分布差异有统计学意义(P0.05)。(2)不同SNPs与2型糖尿病的关联分析:所研究的5个SNPs的基因频率在对照组的分布符合hardy-weinberg平衡定律(P0.05)。在病例组和对照组间,APOB基因的rs679899位点的等位位点分布差异有统计学意义(P0.05);在女性人群中,LPA基因rs3798220位点在共显性模型中,CC基因型和TT基因型在病例组和对照组的分布差异有统计学意义(P0.05);在隐性模型中,TT+CT基因型和CC基因型在病例组和对照组的分布差异有统计学意义(P0.05)。(3)交互作用分析:采用MDR软件分析,发现rs679899、rs3798220、rs6078、rs6083四个位点组成的模型,可能存在基因-基因交互作用(P0.05)。基因-环境交互作用采用构建二分类logistic回归模型的方法,未发现基因-环境间存在交互作用。(4)单体型分析:应用haploview4.2软件进行单体型分析,并未发现分布有统计学差异的单体型(P0.05)。(5)不同SNPs与血清中脂质代谢指标的关联分析:在病例组中,LIPC基因rs6078位点基因多态性与血清中LDL、HDL、TC水平有关,LIPC基因rs6083位点基因多态性与血清中TC水平有关,LPA基因rs3798220位点基因多态性与血清中TG水平有关;在对照组中,LIPC基因上rs6083位点基因多态性与血清中TC水平有关(P0.05)。结论:(1)在女性人群中,LPA基因上rs3798220位点的CC基因型可能是2型糖尿病的易感基因型。(2)rs679899、rs3798220、rs6078、rs6083四个位点可能存在基因-基因交互作用。(3)在LIPC基因rs6078上,携带GA基因型可能与T2DM患者血清中LDL、HDL、TC高表达有关联;携带A等位位点可能与T2DM患者血清中HDL和TC高表达有关。(4)在LIPC基因rs6083上,携带AA基因型可能与T2DM患者血清中TC升高有关。(5)在LDLR基因rs3826810上,携带GG基因型可能与T2DM患者血清中TG升高有关。(6)在LPA基因rs3798220上,携带TT基因型与T2DM患者血清中TG升高有关。
[Abstract]:......
【学位授予单位】：广西医科大学
【学位级别】：硕士
【学位授予年份】：2017
【分类号】：R587.1
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，本文编号：1626699
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