GTF2I基因内含子上功能性SNP影响原发性干燥综合征易感性的研究

发布时间：2018-04-04 07:36

  本文选题：原发性干燥综合征　切入点：GTF2I　出处：《吉林大学》2017年硕士论文

【摘要】：原发性干燥综合征(primary Sj(?)gren's Syndrome,pSS)是一种常见的慢性系统性自身免疫病,主要由于T和B淋巴细胞浸润和损害外分泌腺体,引起口干、眼干、皮肤或者鼻腔干燥等症状;同时也可累及肾脏、肺、血管等其他重要器官,发生病变。该病确切的发病机制尚未阐明,研究表明遗传倾向是影响其发病的重要因素。2013年发表的一份全基因组关联分析(GWAS)报告指出:在pSS的易感基因中,GTF2IRD1-GTF2I基因区间是中国汉族人群特有的,并且通过精确作图(fine mapping)确定GTF2I基因内含子上的rs117026326位点为该区间与pSS相关最强位点。但GTF2I基因多态性影响原发性干燥综合征易感性的机制尚不清楚。本论文的目的旨在研究中国北方汉族人群中GTF2IRD1-GTF2I基因多态性与pSS易感性的关联程度,并且进一步探究GTF2I基因在pSS发病机制中的作用以及该基因影响pSS易感性的潜在机制。实验方法如下:通过Taq Man探针基因分型技术和Sanger Seqencing技术对603例pSS患者和1204例健康对照的rs117026326(GTF2I)、rs112502846(GTF2IRD1-GTF2I)和rs113066392(GTF2IRD1-GTF2I)位点进行基因分型,再通过连锁不平衡关系Imputed得到与这3个SNPs高度连锁的4个SNPs位点的基因分型结果,检测上述七个位点与pSS易感性间的相关性;同时结合临床检验的抗体结果,分析上述SNPs与pSS抗体情况的相关性。应用实时定量PCR技术,检测样本PBMC中总GTF2I和不同亚型GTF2I基因m RNA的表达情况,并探讨其与rs117026326位点多态性间的关联;本实验还进一步探究c-fos基因m RNA表达水平与rs117026326位点多态性的相关性,并在HEK-293T细胞系中分别过表达了不同亚型的GTF2I基因,研究不同亚型对c-fos基因的调控作用。以上实验得到如下结果:GTF2IRD1-GTF2I基因区间内包括rs117026326位点在内7个SNPs都与中国北方汉族人群pSS相关联(P5×10-5),且相互连锁,Conditional Assays证明这些连锁的SNP是此区间内唯一的单一遗传关联信号。这组相关联的SNPs,既与抗体阳性的pSS相关,也与抗体阴性的pSS有显著关联。pSS患者PBMC中,GTF2I基因m RNA表达量明显高于健康对照(P0.001),但其表达水平与rs117026326的基因型不相关(P0.05);GTF2I基因亚型GTF2Iγ和GTF2IΔ及其下游调控基因c-fos m RNA表达水平与SNP rs117026326基因型相关。与rs117026326T/T(risk allele)基因型相比,C/C基因型携带者c-fos基因m RNA的水平显著降低(P0.05)。将不同亚型的GTF2I基因瞬时转染到HEK-293T细胞系中,结果发现与GTF2IΔ相比,GTF2Iγ能够显著激活c-fos基因m RNA表达。实验结果证明,GTF2IRD1-GTF2I基因为中国北方汉族pSS易感基因;SNP rs117026326的基因型与GTF2Iγ和GTF2IΔm RNA表达水平的相关,为该位点参与调控GTF2I pre-m RNA剪切提供证据;当rs117026326携带T(risk allele)基因型时,GTF2Iγm RNA表达水平升高,激活c-fos基因而发生细胞内的慢性炎症反应,这可能是导致pSS发生的因素。
[Abstract]:Primary Sjogren Syndrome (PSS) is a common chronic systemic autoimmune disease, which is mainly caused by infiltration of T and B lymphocytes and damage of exocrine glands, causing dry mouth, dry eye, dry skin or nasal cavity.At the same time can also involve the kidney, lung, blood vessels and other important organs, pathological changes.The exact pathogenesis of the disease has not yet been clarified.Studies have shown that genetic predisposition is an important factor in the pathogenesis of pSS. A report published in 2013 on the whole genome association analysis (GWAS) showed that the GTF2IRD1-GTF2I gene interval in the susceptible genes of pSS is unique to Chinese Han population.The rs117026326 locus in the intron of GTF2I gene was determined to be the strongest site associated with pSS by precise mapping.However, the mechanism of GTF2I gene polymorphism affecting susceptibility to primary Sjogren's syndrome remains unclear.The purpose of this study was to investigate the association between GTF2IRD1-GTF2I gene polymorphism and pSS susceptibility in Han population in northern China, and to explore the role of GTF2I gene in the pathogenesis of pSS and the underlying mechanism of pSS susceptibility.瀹為獙鏂规硶濡備笅:閫氳繃Taq Man鎺㈤拡鍩哄洜鍒嗗瀷鎶，

本文编号：1708987