钦州市钦南区HIV-1流行亚型及基因变异特征研究

发布时间：2019-12-01 15:35

【摘要】：目的调查流行于钦南区的HIV-1亚型种类并分析其基因变异特征。方法抽取100例未抗病毒治疗的HIV-1感染者,从血样中提取病毒RNA或前病毒DNA,采用聚合酶链反应(PCR)扩增HIV-1gag基因和pol基因片段并测序,用系统进化树分析其亚型,并计算gag和pol区的基因离散率。结果 97份血样获得gag基因序列或pol基因序列,4份血样的gag与pol分型不一致,其他93份分型明确,其中CRF01_AE重组型、CRF07_BC重组型、CRF08_BC重组型及G亚型分别占76.34%(71/93)、9.68%(9/93)、12.90%(12/93)和1.07%(1/93)。CRF08_BC的gag基因离散率为0.059±0.005,高于CRF07_BC的0.053±0.005(P0.01)和CRF01_AE的0.049±0.004(P0.01)。CRF01_AE的pol基因离散率为0.044±0.003,高于CRF07_BC的0.035±0.004(P0.01)和CRF08_BC的0.033±0.003(P0.01)。结论钦南区HIV-1存在至少3种流行亚型,其中CRF01_AE是最主要的亚型,不同基因区的变异程度有所不同。

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本文编号：2568420