DMARDs治疗类风湿关节炎前后肠道菌群的变化

发布时间：2020-06-13 14:08

【摘要】：目的:探讨改善病情抗风湿药(Disease modifying antirheumatic drugs,DMARDs)治疗类风湿关节炎(Rheumatoid arthritis,RA)患者前后,患者肠道菌群的变化情况。方法:2017年10月至2018年6月在遵义医科大学附属医院肾病风湿科门诊及病房收集初次诊断为RA患者15例,在患者应用DMARDs治疗前和治疗4周时,收集其新鲜粪便标本,将其分为治疗前组(C组)及治疗后组(S组)。在应用DMARDs治疗的15例初诊RA患者中,8例患者接受甲氨蝶呤+羟氯喹+来氟米特治疗,为MHF组,5例患者接受甲氨蝶呤+来氟米特治疗,为MF组,其中2例患者羟氯喹或来氟米特,故未参与分组。粪便标本统一进行16S r DNA扩增子测序,检测RA患者治疗前后肠道菌群的丰富度及相对百分比,结合生物信息学分析出RA患者治疗前后肠道菌群变化情况。结果:α多样性分析显示RA患者经DMARDs治疗后肠道菌群物种多样性及丰富度均较治疗前降低。β多样性分析示RA患者在治疗后肠道菌群群落的主成分发生了一定变化,组内样本间菌群群落数量及结构存发生了变化,但无明显统计学差异(R=0.066,P=0.058)。肠道菌群数量上的变化示:与RA治疗前相比较,DMARDs治疗后,RA患者肠道菌群中所占比例较高的厚壁菌门(Firmicutes)、拟杆菌门(Bacteroidetes)、变形菌门(Proteobacteria)、放线菌门(Actinobacteria)相对丰富度无明显统计学差异(P0.05),所占比例稀少的酸杆菌门(Acidobacteria)、生氧光菌门(Oxyphotobacteria)、芽单胞菌门(Gemmatimonadetes)菌群相对丰富度明显增加(p0.05)。在属结构水平,RA患者肠道中相对丰度低的菌属如Coprobacter、蛙颤螺菌属(Oscillospira)、Coprobacillus、Howardella、Lactonifactor、Candidatus_Stoquefichus、乳球菌属(Lactococcus)、葡萄球菌属(Staphylococcus)等菌属明显减少(P0.05)。排名前30的优势菌属中链球菌属(Streptococcus)相对丰富度明显增加(P0.01),Holdemanella明显下降(P0.05)。在种结构水平,RA患者肠道微生物中Streptococcus_salivarius较前明显上升(P0.05),Ruminococcus_bicirculans、Staphylococcus_equoru较前明显下降(P0.05),而Lactobacillus_mucosae、Lactobacillus_sanfranciscensis、Prevotella_copri无明显差异(P0.05)。而RA患者在不同的DMARDs治疗4周后两组间比较,肠道菌群也出现了差异。MHF组患者治疗后拟杆菌属及相应菌种Bacteroides_plebeius明显下降,而MF组患者拟杆菌属及Bacteroides_plebeius上升,组间差异有统计学意义(P0.05)。MHF组及MF组治疗后链球菌属均升高,MHF组患者链球菌属升高较MF治疗组明显,但组间比较无明显差异(P=0.079)。结论:RA患者经DMARDs治疗后肠道菌群数量及种类均发生了变化。而不同DMARDs联合用药组方案也可导致肠道菌群各分类水平数量的差异。
【图文】：

图 1 稀释性曲线图注: 不同颜色代表每个不同样本，图 1A 为多样性指数 Observed species 构建；图 1B 为多样性指数 Shannon 构建。2.2.2 α多样性指数分析根据α多样性指数分析发现，相比较于 RA 患者治疗前，RA 患者经 DMARDs 治疗后反应物种丰富度指数的 Chao1 指数及 Observed species 指数明显下降（P<0.050），而反应物种多样性指数的 Shannon 指数有下降趋势，差异无统计学意义（5.96vs5.30，P=0.061），Simpson 指数明显下降（P<0.05），，提示 RA 患者经 DMARDs 治疗后肠道菌群丰富度及多样性下降，（见图 2 及表 7）。

图 2 α多样性指数箱式图注： *代表 P<0.05，与 C 组比较。表 7 RA 患者治疗前后多样性指数比较多样性指数 C 组 S 组 P 值Observed species 439（407~452） 389（351~403）* 0.020Chao1 461.06（431.57~493.39） 410（369.32~451.67）* 0.041Shannon 5.96（5.72~6.05） 5.30（5.22~5.87） 0.061Simpson 0.961（0.947~0.969） 0.938（0.906~0.959）* 0.027注：*代表 P<0.05，与 C 组比较 。
【学位授予单位】：遵义医科大学
【学位级别】：硕士
【学位授予年份】：2019
【分类号】：R593.22

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本文编号：2711292