原发性肝癌合并糖尿病临床病理特征及全基因组甲基化分析

发布时间：2020-08-14 07:27

【摘要】：目的:研究原发性肝癌合并糖尿病患者的临床病理特征,并利用全基因组甲基化测序技术,筛选原发性肝癌合并糖尿病患者与原发性肝癌非糖尿病患者差异甲基化区域(Differential Methylation Region,DMR),以期为阐明糖尿病作为风险因素在肝癌发生发展过程中的作用,及原发性肝癌的早期诊断、预防和治疗提供依据。方法:收集2016年11月-2018年8月,就诊于泉州海峡医院肝病患者的临床信息,整理得到了40例原发性肝癌合并糖尿病患者与376例原发性肝癌非糖尿病患者的临床资料,并对其进行回顾性分析。收集得到7例原发性肝癌合并糖尿病患者和15例原发性肝癌非糖尿病患者的血液样本,提取全基因组DNA,通过全基因组甲基化测序分析,得到DMR,进行GO及KEGG富集分析,最后对富集结果分析并在公共数据库中进行验证。结果:1.分析原发性肝癌合并糖尿病组与原发性肝癌非糖尿病组临床信息显示年龄、BMI值、ALT水平均有统计学意义(P0.05),肿瘤标记物CA199有统计学意义(P0.05),且原发性肝癌合并糖尿病组均高于原发性肝癌非糖尿病组。2.全基因组甲基化测序结果发现,发生甲基化的位点主要集中CG序列上,在基因功能区域,CG序列的甲基化处于高水平状态,CGI区域甲基化水平最低;基因上下游2Kbp区域甲基化水平做统计,gene body区域甲基化水平最高。分析DMR在基因功能区域中的分布发现,DMR都主要集中在内含子区域。DMR相关基因GO及KEGG富集分析发现,主要涉及在细胞与神经等生物学过程及吗啡成瘾通路。3.根据富集结果筛选得到差异基因ADCY1和GNAO1,经验证其在肝癌组织中显著低表达,而在肝癌组织的启动子区域呈高甲基化水平。结论:1.糖尿病是年龄相关的疾病,联合检测相关指标能提高对早期原发性肝癌检出的准确率。2.构建了原发性肝癌合并糖尿病与原发性肝癌非糖尿病的全基因组范围内单碱基分辨率的DNA甲基化图谱,以吗啡成瘾通路为突破口,为原发性肝癌与糖尿病相互作用机制以及早期诊断与预防提供了思路。3.基因ADCY1和GNAO1为研究原发性肝癌与糖尿病的关系提供可能,同时为发现肝癌发生发展相关的生物标志物以及肝癌的治疗提供新靶点。
【学位授予单位】：华侨大学
【学位级别】：硕士
【学位授予年份】：2019
【分类号】：R735.7;R587.1
【图文】：

DNA文库构建流程图

测序过程图

甲基化测序分析流程图

【参考文献】

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本文编号：2792709