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桥本甲状腺炎患者的组蛋白甲基化及与碘的机制研究

发布时间:2021-02-15 21:36
  背景:桥本甲状腺炎(Hashimoto thyroiditis,HT),也被称为自身免疫性甲状腺炎(Autoimmune thyroiditis,AIT),是临床常见的内分泌系统疾病,其确切发病机制尚未完全明确,目前认为遗传背景和环境因素的交互作用共同导致了疾病的发生发展,而碘是其中最重要的环境因素之一。表观遗传修饰可以通过改变染色质结构、募集转录因子以及调控多种酶等来调节基因转录而不影响DNA碱基序列,是连接环境因素和遗传背景的桥梁。组蛋白甲基化及其相关修饰酶作为表观遗传修饰的重要调节机制与很多自身免疫疾病相关。然而目前尚没有探讨组蛋白甲基化与HT的系统研究。本研究主要从全基因组和整体蛋白水平探讨HT患者甲状腺细胞以及甲状腺组织组蛋白H3赖氨酸4三甲基化(H3K4me3)的变化,同时分析了高碘对甲状腺细胞H3K4me3和组蛋白H3赖氨酸27三甲基化(H3K27me3)的影响及在HT中的可能机制探讨。方法:1)HT患者甲状腺细胞和组织H3K4me3变化:利用免疫共沉淀测序(Chromatin Immunoprecipitation and Deep Sequencing,chip-se... 

【文章来源】:中国医科大学辽宁省

【文章页数】:121 页

【学位级别】:博士

【图文】:

桥本甲状腺炎患者的组蛋白甲基化及与碘的机制研究


甲状腺细胞H3K4me3全基因组分布和差异位点富集分布

富集,启动子区,位点,转录起始位点


3.2 HT 相关分子转录起始位点 H3K4me3 富集情况和转录表达转录起始位点 H3K4me3 富集增加与基因转录活化相关,为了探究与 HT 可能相关的基因转录起始位点 H3K4me3 的富集情况,基于 Mnorm 分析办法,在已经分析出的差异位点和相关基因中进行筛选,并将 track 导入基因可视化软件 IGV 进一步分析,发现 HT 患者甲状腺细胞基因趋化因子 CXCL8, CCL2, CXCL10, IL18 黏附分子ICAM1, ITGA4,凋亡相关分子 FASLG和TRAIL 的启动子区域H3K4me3显著增加,如图 3.21。另外 HT 患者甲状腺细胞 TG 基因转录起始位点 H3K4me3 富集增加,平均约为对照组的 2.45 倍,如图 3.22。为了探讨转录起始位点 H3K4me3 的富集情况是否与转录调控相关,进一步纳入 8 个 HT 患者和 8 个年龄匹配的对照人群进行甲状腺细胞原代培养并检测 mRNA 水平。发现 CCL2,CXCL8,ICAM1 在 HT患者原代培养细胞中转录表达增加,如图 3.23。

启动子区,富集,可视化,情况


图 3.22 TG 启动子区 H3K4me3 富集情况(IGV 可视化浏览)图3.23 启动子区H3K4me3富集增加的8个基因在HT患者甲状腺细胞中的mRNA水平(n=16)。CCL2,CXCL8,ICAM1 在 HT 患者原代培养细胞中 mRNA 表达增加。HT:桥本甲状腺炎患者;CON:对照人群。(* P<0.05,** P<0.01)

【参考文献】:
期刊论文
[1]启动子区H3K27me3修饰异常促使系统性红斑狼疮患者CD4+T细胞CREMα过表达[J]. 张庆,丁澍,张慧琳.  南方医科大学学报. 2017(12)



本文编号:3035577

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