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高LDL-C人群血清miRNA表达谱分析及相关机制研究

发布时间:2021-08-29 08:12
  背景:心脑血管疾病已经成为威胁居民健康的首要原因,动脉粥样硬化引起的血管狭窄、闭塞以及粥样斑块破裂脱落导致的血管栓塞是组成心脑血管疾病的重要类型。脂质代谢紊乱是动脉粥样硬化性心血管疾病的重要危险因素,循环LDL-C升高与动脉粥样硬化的起病及发展有着直接联系,巨噬细胞吞噬过多的氧化型低密度脂蛋白形成泡沫细胞是动脉粥样硬化发病的病理基础。循环LDL-C已经成为临床上评价降脂效果的最重要指标。miRNA参与脂代谢的调控,循环miRNA已经被证明可以用于疾病的诊断、治疗效果的评估以及预后评价,从临床样本(血清或病变组织)中筛查差异的miRNA表达已经成为研究miRNA与疾病关系的重要方向。目的:从临床样本探索脂代谢紊乱相关的miRNA,如能取得预期效果,或有助于进一步揭露脂代谢紊乱的潜在机制,为ASCVD疾病的早期诊断以及治疗提供新的思路。方法:1.收集从2017年3月至2017年12月在中国扬州大学附属医院就诊的门诊/住院病人及健康体检者。根据受试者血LDL-C水平,分为高脂组(n=30)及健康对照组(n=30)。分别从高脂组和健康对照组中按完全随机原则各抽取5例血清样本进行miRNAs血清... 

【文章来源】:扬州大学江苏省

【文章页数】:72 页

【学位级别】:硕士

【部分图文】:

高LDL-C人群血清miRNA表达谱分析及相关机制研究


图1-1:散点图中每一个点代表芯片上的探针点,该点在二维平面中的位置由其X轴坐标和Y轴坐??标确定:X轴:该点在样品芯片中标准化以后的信号值

分布情况,组内,二维空间,重复性


23??8.4?PCA分析通过PCA分析,观察样品的分布情况,验证实验设计的合理性以及生物学??重复样品的均一性。(图1-2)显示实验组与对照组样本分别集中在二维空间内不同的区??域,提示样品分组相对合理,组内重复性相对较好。??S?/?J33]?\??^?J7]??I?〇■?#?^??I?J81?J58]??I?P??—I?1?1?1?1?1?1—??-150?-100?-50?0?50?100?150??Component?1?(90.19%)??图1-2:?case?(红点)和control?(绿点)分别集中分布在二维空间内不同的区域,说明该样品分姐相??对合理,组内重复性良好??8.5差异筛选和火山图??8.5.1差异筛选??在筛选差异miRNA之前,先使用探针进行过滤。对于有生物学重复的分析,利用T??检验得到的P值和标准化信号值的差异倍数进行筛选,筛选标准为:Fold?change值>=2.0??且P值<=0.05。对于没有生物学重复的分析,仅利用差异倍数Fold?change值进行筛选,??标准为:Fold?change值>=2.0。使用这种方法我们共筛选出22种差异表达的miRNA,其??中

绿色,红色,灰色,绝对值


?m?今*??图1-4:聚类分析热图,每列代表一个样本,4、5、9、7、8为健康对照姐,27、33、35、57、58代??表高脂组。毎行代表一个miRNA,在分层聚类归纳之后,将具有相似表达倾向的miRNA组合在一??起,红色代表上调的表达量,绿色代表下调的表达量,黑色代表无差异,差别越大,颜色饱和度越??高。??

【参考文献】:
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本文编号:3370261

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