运用高通量RNA测序探讨阳离子多肽对气道上皮细胞的影响

发布时间：2023-04-16 22:27

　　研究背景及目的:主要碱性蛋白(MBP)是哮喘过程中嗜酸性粒细胞释放的主要毒性蛋白,对气道上皮细胞产生一定的损伤,从而加重哮喘。但MBP对气道上皮细胞损伤的具体分子机制仍然不是很清楚。MBP体外模拟剂阳离子多肽多聚左旋精氨酸(PLA)被广泛用来研究其对气道上皮细胞的生物学效应。本实验基于对PLA处理的气道上皮细胞NCI-H292的全转录组测序分析,探究阳离子多肽对气道上皮细胞基因表达的影响,通过分析差异基因表达,初步探究阳离子多肽对气道上皮细胞的损伤机制。材料与方法:NCI-H292细胞分为对照组(C)和PLA(P)组,每组三个重复。应用Illumina Hiseq 4000对样品进行测序,通过差异分析软件,选取倍数改变(29)1.5,P?0.05的基因作为差异表达基因(DEGs)。对DEGs进行基因体富集分析(gene ontology,GO)以及京都基因与基因组百科全书(kyoto encyclopedia of genes and genomes,KEGG)通路数据库分析以了解DEGs参与的相关功能和信号途径;挑选差异表达基因,运用qRT-PCR和Western Blot验证测序结...

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中文摘要
英文摘要
1.前言
2.实验材料
3.实验方法
4.统计学处理
5.结果
6.讨论
7.结论
8.参考文献
附录
致谢
综述
    参考文献



本文编号：3792004