2型糖尿病的遗传易感基因研究
发布时间:2017-07-03 08:15
本文关键词:2型糖尿病的遗传易感基因研究
更多相关文章: 2型糖尿病 荟萃分析 关联分析 候选基因 糖尿病相关的数量性状
【摘要】:2型糖尿病(Type2diabetes,T2D)是一种常见的复杂性代谢性疾病,是以胰岛素抵抗和β细胞功能受损为主要特征。在中国,年龄在20岁及以上的2型糖尿病患者就有约9240万。随着全基因组关联分析(GWAS)技术的运用,揭示了多个与2型糖尿病相关的基因,例如:HHEX,WFS1,SLC30A8,EXT2,FTO,TCF2/HNF1B,CDKN2A/B,IGF2BP2,CDKAL1,PPARG,TCF7L2,KCNQ和KCNJ11。然而,这些基因与2型糖尿病的相关性,也因种族的不同而不同。基于这个原因,相关的荟萃分析也越来越被广泛的使用。 由于细胞周期蛋白依赖激酶抑制剂2A/B(Cyclin-dependent kinaseinhibitor-2A/B,CDKN2A/B)在染色体上的位置及其在β细胞功能与再生中起着重要的作用,使其成为了T2D重要的候选基因。但是,迄今为止,很多关于T2D和CDKN2A/B相关性的研究结果却不尽相同。为了解释这种矛盾,进行针对CDKN2A/B基因位点rs10811661和rs564398与T2D关系的荟萃分析就很有必要。为此,在PubMed、EMBASE和Medline数据库中系统地查阅了从2006年1月到2010年11月的相关文献,一共收集到了35篇相关报道,其中16篇文章(包括24,407病例和33,937对照)符合荟萃分析的纳入标准。研究的结果表明:CDKN2A/B基因的rs10811661-T等位基因(OR=1.28,95%CI=1.21-1.36, p=9×10~(-5))和TT基因型(OR=1.32,95%CI=1.22-1.43,p=9×10-5)都与增加T2D的风险有关;但是,rs564398-G等位基因与T2D的关系尚不明确(OR=0.96,95%CI=0.88-1.05, p=0.35);本研究提示rs10811661-T等位基因在欧洲(p=0.002)和亚洲人群(p=9×10~(-4))中均是T2D的风险因子。荟萃分析结果说明:CDKN2A/B基因位点rs10811661是T2D的易感基因位点;但是,这一结论仍然需要在更大样本量的不同种族群中做进一步的验证。 为了揭示最新报道的6个T2D易感基因位点是否也是中国T2D群体的风险因子,本课题在首次发病的中国汉族瘦人T2D群体中,对上述的6个新基因位点进行了实验研究。这6个新的T2D易感基因位点分别来自基因BCL11A,DUSP9,IRS1,CENTD2、ADRA2A和CDKAL1。研究对象包括:761名2型糖尿病患者以及在种族、年龄、性别等方面严格匹配的433名健康对照;通过采取其外周血液样本,分离出白细胞中DNA来进行基因分型;同时,探索了这6个新的T2D易感基因位点与体重指数(BMI)、空腹血糖(FPG)和口服葡萄糖耐量试验(OGTT)结果的关系。结果表明:CDKAL1基因rs7754840位点的等位基因C与T2D发病风险密切相关(OR=1.54,,95%CI=1.30-1.82,p=8.1×10-7);DUSP9基因rs5945326位点的等位基因G与T2D之间也存在着的轻度的相关性(OR=0.81,95%CI=0.70-0.93,p=0.02);在校正了年龄、性别和体重指数(BMI)后,上述的相关性仍然存在,分别是rs7754840(p1.0×10~(-4))和rs5945326(p=0.043)。然而,经过多重检验校正后,只有CDKAL1基因的单核苷酸多态性位点rs7754840与T2D的相关性仍然具有统计学意义(p1.0×10~(-4))。此外,本研究结果提示:CDKAL1基因rs7754840位点的等位基因C与空腹血糖浓度的升高有关(p=3.8×10~(-4)),这种相关性与CDKAL1基因具有调节胰岛功能的作用相吻合。
【关键词】:2型糖尿病 荟萃分析 关联分析 候选基因 糖尿病相关的数量性状
【学位授予单位】:重庆医科大学
【学位级别】:硕士
【学位授予年份】:2012
【分类号】:R587.1
【目录】:
- 英汉缩略语名词对照6-9
- 摘要9-12
- ABSTRACT12-15
- 第一部分 2 型糖尿病和 CDKN2A/B 基因相关性的荟萃分析15-23
- 引言15-16
- 1 材料和方法16-18
- 1.1 对象16
- 1.2 纳入标准16-18
- 1.3 发表偏倚18
- 1.4 统计学分析18
- 2 结果18-20
- 2.1 质量控制18-19
- 2.2 CDKN2A/B 与 T2D19-20
- 3 讨论20-23
- 第二部分 六个遗传风险位点与 2 型糖尿病关联性实验研究23-42
- 引言23-24
- 1 材料和方法24-33
- 1.1 对象24-25
- 1.2 全基因组 DNA 的准备25
- 1.3 SNPs 的选择25-27
- 1.4 SNPs 基因型分型27-32
- 1.5 统计学分析32-33
- 2 结果33-39
- 2.1 基因型分型质量控制33
- 2.2 关联性统计分析33-39
- 3 讨论39-42
- 全文总结42-44
- 参考文献44-52
- 附录 1:DNA 的提取流程52-53
- 附录 2:主要试剂配方53-55
- 附录 3:主要仪器55-56
- 附录 4:主要试剂56-57
- 文献综述57-68
- 参考文献64-68
- 致谢68-69
- 攻读硕士期间发表的论文69
【参考文献】
中国期刊全文数据库 前1条
1 黄青阳;程孟荣;姬森林;;2型糖尿病易感基因的连锁和关联研究(英文)[J];遗传学报;2006年07期
本文关键词:2型糖尿病的遗传易感基因研究
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本文编号:512909
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