延边朝鲜族和汉族ARL-15,TCF7L2和KCNJ11基因SNPs与2型糖尿病合并大血管病变相关性研究

发布时间：2017-07-17 05:17

  本文关键词：延边朝鲜族和汉族ARL-15,TCF7L2和KCNJ11基因SNPs与2型糖尿病合并大血管病变相关性研究

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【摘要】：目的：探讨ADP-核糖基化样因子15基因(ARL-15)、转录因子7-类似物2(TCF7L2)和内向整流神通道蛋白J亚单位11号成员基因(KCNJ11)的单核苷酸多态性(SNPs)与延边地区2型糖尿病(T2DM)及T2DM合并大血管病变(MA)的相关性研究。方法：采用病例对照设计,随机选择延边地区219例T2DM患者(朝鲜族171和汉族48)、36例T2DM合并MA(简称：合并MA)患者(朝鲜族3和汉族33)以及与年龄、性别匹配的50例葡萄糖耐量正常(NGT)对照人群(朝鲜族16和汉族34)作为研究对象。采用连接酶检测分型方法链接反应(LDR)方法检测三个基因的3个SNPs位点(rs26770.rs7903146.rs5219)的基因型。应用酶联免疫吸附法(ELISA)方法检测血清中脂联素(PA)、胰岛素(INS).ARL-15的水平,利用彩色多普勒测定颈动脉内膜-中膜厚度(IMT)方法来确定MA,使用SPSS进行生理生化指标分析及基因联合作用分析。结果：1.3个SNPs的等位基因频率和基因型频率分布比较：rs5219的基因型频率在T2DM组与NGT组之间存在显著性差异(p=0.028),等位基因频率无显著性差异；rs7903146、rs26770的等位基因频率和基因型频率在各组间均不存在显著性差异(p＞0.05)。3个SNPs等位基因频率和等位基因型频率在朝汉族间、T2DM组与NGT组间分布比较差异无统计学意义(p＞0.05)。2.联合基因型GG-CC-CT组合在合并MA组频率显著性高于NGT组,两组差异具有统计学意义(p=0.04)；联合基因型AA-CC-CT组合在T2DM组频率显著性低于NGT组,两组差异具有统计学意义(p＞0.041)；在朝鲜族中,联合基因型GG-CC-CT组合在合并MA组频率显著性高于NGT组与T2DM组(p=0.032,p=0.018),差异具有统计学意义。3.T2DM组PA.ARL15蛋白水平显著低于NGT(p0.05),其它均与NGT组无显著性差异(p0.05)；合并MA组FPG显著高于NGT组(p0.05),PA水平显著低于NGT(P0.05),其它均与NGT组无显著性差异(p0.05)。4.rs7903146CT基因型个体INS水平显著性低于CC基因型个体(p=0.010.05),ARL-15水平CT基因型个体高于CC基因型个体,但差异不具有统计学意义(p0.05)。rs26770位点的三个基因型个体SBP、DBP、INS、PA水平有降低趋势,均不存在显著性差异(p0.05)。rs5219多态三个基因型个体与其他临床指标均不存在显著性差异(p0.05)。结论：1.ARL-15、TCF7L2和KCNJ11基因3个SNP的联合基因型GG-CC-CT为延边朝鲜族罹患T2DM合并MA的危险性联合基因型。2.ARL-15、TCF7L2和KCNJ11基因3个SNP的联合基因型CT-CC-AA可能是延边朝鲜族T2DM保护基因组合。
【关键词】：ADP-核糖基化样因子15基因(ARL-15) 转录因子7-类似物2(TCF7L2) 内向整流钾通道蛋白J亚单位11号成员基因(KCNJ11) 单核苷酸多态性(SNPs) 2型糖尿病 大血管病变
【学位授予单位】：延边大学
【学位级别】：硕士
【学位授予年份】：2016
【分类号】：R587.1;R543
【目录】：

• 摘要5-7
• Abstract7-11
• 第一章 前言11-17
• 1.1 概述11-12
• 1.2 ARL-15、TCF7L2和KCNJ11基因的研究现状12-14
• 1.3 单核苷酸多态性(SNP)和基因的联合作用14-17
• 第二章 实验材料17-21
• 2.1 实验仪器17-18
• 2.2 主要试剂18-19
• 2.3 溶液的配制19-21
• 第三章 实验方法21-32
• 总体技术路线图21-22
• 3.1 对象和分组22
• 3.2 查找TCF7L2,ARL15,KCNJ11三种基因生物信息22-24
• 3.3 临床指标测定24-28
• 3.3.1 生理生化指标的测定24
• 3.3.2 公式和界定范围24-25
• 3.3.3 空腹血浆脂联素(PA)、胰岛素(INS)和ADP-核糖激化因子15蛋白(ARL15)检测25-28
• 3.4 外周血全基因组DNA提取28-29
• 3.4.1 血液样本采集28
• 3.4.2 人类基因组DNA提取28-29
• 3.4.3 DNA浓度及纯度测定29
• 3.5 PCR29-30
• 3.5.1 PCR引物设计合成29-30
• 3.5.2 PCR反应体系的优化30
• 3.5.3 PCR产物及延伸产物的纯化30
• 3.6 基因型检测30
• 3.7 统计学处理30-32
• 第四章 实验结果与分析32-44
• 4.1 基因组DNA提取结果32
• 4.2 PCR结果32
• 4.3 测序结果32-33
• 4.4 样本临床特征指标分布33-34
• 4.5 等位基因频率和基因型频率分析34-36
• 4.5.1 群体均衡性检验34-35
• 4.5.2 T2DM组、合并MA组与NGT组等位基因频率及基因型频率分析35
• 4.5.3 朝鲜族和汉族等位基因频率及基因型频率分析35-36
• 4.6 ARL15、TCF7L2、KCNJ11三个基因联合作用36
• 4.6.1 ARL15、TCF7L2、KCNJ11三个基因3个SNP位点的联合作用分析36
• 4.6.2 朝鲜族和汉族ARL15、TCF7L2、KCNJ11三个基因3个SNP位点的联合作用分析36
• 4.7 ARL15、TCF7L2、KCNJ11三个基因3个SNPs基因型与全部样本临床指标关联分析36-44
• 4.7.1 ARL15、TCF7L2、KCNJ11三个基因3个SNPs基因型与全部样本临床指标关联分析36-37
• 4.7.2 朝鲜族和汉族ARL-15、TCF7L2、KCNJ11三个基因3个SNPs基因型与全部样本临床指标关联分析37-44
• 第五章 讨论44-47
• 第六章 结论47-48
• 参考文献48-51
• 致谢51-52
• 缩略语52

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