艾滋病患者ART半年后血液和精液HIV-1的基因特点及生物学特性研究

发布时间：2017-10-05 05:27

  本文关键词：艾滋病患者ART半年后血液和精液HIV-1的基因特点及生物学特性研究

  更多相关文章： HIV ART 血液 精液 C2V5 基因特点 生物学特性

【摘要】：目的我们通过检测ART半年后艾滋病患者外周血及精液中HIV-1的含量,扩增env序列构建基因进化树、预测辅助受体和顶端四肽等。以期发现ART半年后MSM艾滋病患者血液及精液中HIV-1的特点和变异规律。方法实验入组经ART半年后艾滋病患者19例,留取血液和精液标本,将标本处理为血浆、PBMC、精浆和精液细胞四种标本。分别检测其HIV RNA或DNA含量,利用套式PCR选择性扩增血浆和精浆中的HIV RNA及PBMC和精液细胞中HIV DNA的C2V5区序列。将得到的C2V5区序列连接至T载体,导入JM109感受态细胞,LB固体培养基培养,分别挑取单克隆验证后每个患者每种标本送10个单克隆测序。测序结果利用ContigExpress和BioEdit软件进行校正及比对,之后一方面用Mega6软件构建系统进化树和计算组内基因离散率,另一方面利用Geno2pheno和PSSM系统预测病毒亚型、辅助受体、顶端四肽类型等。结果1.ART半年后19例患者血液中可检测到HIV RNA者仅2例,但精液中可检测到HIV RNA者16例。全部患者的PBMC和精液细胞中都可以检测到总的、2LTR环状和整合型HIV DNA。2.19例患者的四种标本,最终成功扩增C2V5区的血浆2例、精浆16例、PBMC 11例,精液细胞9例,共38例,最终成功测序380个单克隆。3.血浆、精浆、PBMC和精液细胞的基因序列分析19例患者HIV亚型:12例B亚型,7例C亚型。构建基因进化树和计算组内基因离散率,结果可以看出,血浆中的病毒变异度大于PBMC中的,精液细胞中病毒的变异度大于精浆中的;精液中病毒的变异则大于血液中病毒的变异。4.辅助受体预测血液和精液使用的受体(R5/X4)差异极大。CCR5和CXCR4在血浆各50%,精液中分别为54.4%和45.6%,在PBMC中分别为22.7%和77.3%,在精细胞分别为14.4%和85.6%。5.V3环顶端四肽在血浆、PBMC及精液细胞中,顶端四肽的类型以GPGQ为主,比例分别为100%,72.8%和81.1%,然而在精浆中,顶端四肽的类型以GPGR为主,比例是86.4%,精液中还有一些血液中没有的顶端四肽类型。6.V3环氨基酸所带电荷数血浆和PBMC中的V3环氨基酸所带电荷数没有明显差异。而精液中V3环氨基酸所带电荷数明显高于血液中的。结论经ART半年后血液中HIV RNA已达检测不到水平的艾滋病患者中,大部分患者的精液中仍可检测到HIV RNA和HIV DNA。不同患者不同标本各病毒的进化情况有明显的差异,而且辅助受体的利用、顶端四肽及电荷数也有明显的不同。
【关键词】：HIV ART 血液 精液 C2V5 基因特点 生物学特性
【学位授予单位】：首都医科大学
【学位级别】：硕士
【学位授予年份】：2016
【分类号】：R512.91
【目录】：

• 缩略语一览表4-6
• 摘要6-8
• Abstract8-10
• 1、前言10-13
• 2、材料与方法13-19
• 3、结果19-37
• 4、讨论37-40
• 5、结论40-41
• 参考文献41-46
• 文献综述46-56
• 参考文献52-56
• 致谢56-57
• 论文发表情况57-58
• 个人简历58

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2 ;艾滋病诊疗指南 抗逆转录病毒治疗(ART)(4)[J];中国临床医生;2006年04期

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5 黄学锋;;ART中精子优选[A];2011中国妇产科学术会议暨浙江省计划生育与生殖医学学术年会暨生殖健康讲习班论文汇编[C];2011年

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1 杜培伟;艾滋病患者ART半年后血液和精液HIV-1的基因特点及生物学特性研究[D];首都医科大学;2016年

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4 占炜;ART退火和轧制条件对中锰钢微观组织及力学性能的影响[D];华中科技大学;2013年

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本文编号：975047