白癜风6q27区域易感基因搜寻
本文关键词:白癜风6q27区域易感基因搜寻
【摘要】:研究背景白癜风(Vitiligo,OMIM:#193200)是一种常见的皮肤色素脱失性疾病,由后天获得而来,临床表现为受累区域出现进行性斑片状、多灶性色素脱失,境界清楚,表面光滑,皮肤、毛发或者是粘膜等部位都可能被累及,各年龄组(成人与儿童)都可以发病,而且无明显性别差异。种族人群不同,该病的患病率也不尽相同,从0.1%-2.9%不等。临床表现包括节段型和非节段型。迄今为止,白癜风的确切病因仍然不明。研究人员正试图用不同的假说加以解释,主要包括黑素细胞自毁学说、神经学说、自身免疫学说、遗传学说、病毒、细胞凋亡学说和细胞粘附紊乱等。当前,最流行的白癜风发病理论是多因素学说,在白癜风易感的遗传条件下,再加上特定的环境因素而发病,目前尚无特别有效的治疗方案。2010年,本课题组在6q27位点发现一个约200kb的区域与白癜风易感性显著相关(Pcom=9.72×10-17,OR=1.20)。本课题组通过对该区域SNP位点进行imputation和质量控制处理后,筛选出来24个SNP位点(rs968334、rs1012656、rs3093025、rs3093026、rs975822、rs2236313、rs76862907、rs3756838、rs1331299、rs3093024、rs117222308、rs9457258、rs55802221、rs6930998、rs968333、rs75278634、rs2023305、rs12526448、rs78870722、rs1855025、rs6931530、rs9364891、rs77577614、rs720325)进行精细定位研究。目的对6q27区域进行精细定位研究并搜寻白癜风易感基因。方法收集2,942例白癜风病例和2,850例正常人对照样本,用Sequenom Mass Arry进行基因型分型。然后采用Plink 1.07软件进行统计分析,设定P2.08×10-3(0.05/24)为显著性检验水平。将阳性SNPs进行连锁不平衡分析以及条件回归分析。结果1.统计学分析结果显示:SNPs点rs76862907、rs77577614、rs78870722、rs75278634分型不符合Hardy-Weinberg平衡(P-hwe0.05),rs117222308得率偏低(p=0.0421)。SNP点rs2236313、rs9457258、rs720325、rs968334、rs3093025、rs55802221、rs1012656、rs6930998、rs1331299的等位基因频率在病例组(2,942例)和对照组(2,850例)之间有显著性统计学差异,所有的P值均小于显著检验水平(2.08×10-3)。2.条件回归分析结果:控制SNP rs2236313后,rs720325、rs968334、rs9457258和rs3093025的P0.05,其他SNPs的P0.05,但是分别控制rs720325、rs968334、rs9457258和rs3093025后,rs2236313的P值都大于0.02。故提示没有独立信号存在。3.连锁不平衡分析显示:5个阳性SNPs(rs2236313、rs9457258、rs720325、rs968334、rs3093025)间有较强的连锁关系,所有的D'0.7,r20.4。结论本研究通过基因分型研究,成功地验证了SNP rs2236313与中国汉族人白癜风存在相关性。经连锁不平衡以及条件回归分析后没有发现相对独立的关联信号。
【关键词】:白癜风 6q27 易感基因
【学位授予单位】:安徽医科大学
【学位级别】:硕士
【学位授予年份】:2015
【分类号】:R758.41
【目录】:
- 英文缩略词5-6
- 中文摘要6-8
- Abstract8-10
- 1 前言10-14
- 2 实验材料与方法14-32
- 3 结果32-34
- 4 讨论34-37
- 5 结论37
- 6 参考文献37-42
- 附录42-44
- 致谢44-45
- 课题综述45-60
- 参考文献51-60
【共引文献】
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,本文编号:1020964
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