白癜风免疫易感基因与汉族人群白癜风伴自身免疫病相关性研究

发布时间：2017-12-20 13:14

  本文关键词：白癜风免疫易感基因与汉族人群白癜风伴自身免疫病相关性研究　出处：《安徽医科大学》2015年硕士论文　论文类型：学位论文

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【摘要】：研究背景白癜风是一种常见的原发性皮肤黏膜色素脱失性疾病,其发病机制尚不十分清楚,主要涉及黑素细胞自毁学说、生物学说、神经学说、自身免疫学说和遗传学说等,且自身免疫学说被越来越多研究所证实。近几年,GWAS被广泛用于研究复杂疾病的易感基因。在欧洲和中国,已有两个团队运用了GWAS的研究方法,发现了一些与白癜风相关的易感基因,并且在不同的人群中得到了验证。主要包括SMOC2,PTPN22,RERE,C1QTNF6,GZMB等基因上的SNP点,这些免疫易感位点与白癜风密切相关,其中某些易感基因可调节免疫应答,并与其他自身免疫性疾病(如桥本氏甲状腺炎、类风湿性关节炎)高度相关。截止目前,运用GWAS发现总共70多个与白癜风相关的易感位点,其中一些免疫易感位点尚未在汉族人群白癜风伴自身免疫性疾病中获得验证。目的探讨白癜风相关的免疫易感基因位点与汉族人群白癜风伴自身免疫性疾病的相关性,以搜寻不同种族人群间白癜风共同的免疫易感基因。方法收集白癜风伴自身免疫性疾病病例552例和正常对照1,656例;在前期GWAS发现的易感基因的数据基础上,共挑选了分别位于基因ATP8B1,CLNK,LPP,GZMB,IKZF4,RPGRIP1L,CASP7,CD80,IL2RA的10个点rs10503019at 18q21.31,rs11940117 at 4p16.1,rs1464510 at 3q28,rs2273844 at 14q12,rs2456973at 12q13.2,rs3213758 at 16q12.2,rs4353229 at 10q25.3,rs59374417 at 3q13.33,rs706779和rs7090530 at 10p15.1验证。利用Sequenom Massarray系统,对所选标本进行基因分型;应用PLINK 1.07对数据进行分析,了解这些位点是否为汉族人群和外国人群共同的易感位点(P≤0.05具有统计学意义)。结果1.关联分析显示:ATP8B1,CLNK,LPP,GZMB,IKZF4,RPGRIP1L,CASP7,CD80,IL2RA的10个点rs10503019 at 18q21.31,rs11940117 at 4p16.1,rs1464510 at 3q28,rs2273844 at 14q12,rs2456973 at 12q13.2,rs3213758 at 16q12.2,rs4353229 at 10q25.3,rs59374417 at 3q13.33,rs706779和rs7090530 at 10p15.1。rs2456973和rs11940117的等位基因频率在病例组(552例)和对照组(1,656例)之间差异有统计学意义(P=0.003,P=0.01)。分别进行校正后,rs2456973在病例组和对照组之间差异有统计学意义(P=0.0030.05/10),但是rs11940117在两组间的差异无统计学意义(P=0.010.05/10)。2.分层分析显示:将白癜风患者按发病类型、严重程度以及伴发疾病类型等亚临床表型进行分层分析,显示rs2456973在有白癜风发病年龄的患者中,其等位基因频率在早发型和对照组之间、早发型和晚发型患者之间有差异(P=0.0001,OR=1.72,95%CI=1.30-2.28;P=0.01,OR=0.67,95%CI=0.49-0.91)。Rs11940117在有白癜风伴发自身免疫性疾病的患者中,其等位基因频率在白癜风伴类风湿性关节炎患者和对照组之间、白癜风伴类风湿性关节炎和白癜风不伴类风湿性关节炎患者之间有差异(P=0.005,OR=0.55,95%CI=0.35-0.84;P=0.04,OR=0.63,95%CI=0.40-0.98)。结论IKZF4基因上SNPs位点rs2456973与汉族人白癜风伴发自身免疫性疾病易感性相关,而且与早发型白癜风伴自身免疫性疾病相关。CLNK上的SNPs位点rs11940117是白癜风伴发自身免疫性疾病的一个提示易感位点。不同人种间、白癜风与自身免疫性疾病可能有共同的易感基因。
【学位授予单位】：安徽医科大学
【学位级别】：硕士
【学位授予年份】：2015
【分类号】：R758.41

【参考文献】

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1 Tao Wang;Chang-Liang Zhu;Shuai Wang;Li-Wen Mo;Guo-Dong Yang;Jun Hu;Fan Zhang;;Role of NLRP3 and NLRP1 inflammasomes signaling pathways in pathogenesis of rheumatoid arthritis[J];Asian Pacific Journal of Tropical Medicine;2014年10期

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本文编号：1312214