欧美人群白癜风易感基因与汉族人群相关性研究

发布时间：2017-03-19 00:08

  本文关键词：欧美人群白癜风易感基因与汉族人群相关性研究，由笔耕文化传播整理发布。

【摘要】：研究背景：白癜风是最常见的原发性，局限性或泛发性的皮肤黏膜色素脱失疾病。其表现为色素脱失斑，皮损分布于皮肤表面，最常见于面，颈，手等部位。皮损处皮肤色素脱失而呈瓷白色，严重影响美观，给患者带来巨大的精神痛苦。目前，白癜风的病因仍然不十分明确，遗传因素，神经精神因素，黑素细胞自毁学说以及细胞因子因素等被发现可能导致疾病的发生。但均不能单独或完全解释白癜风的发病机制。近年来，为了搜寻和定位参与白癜风易感基因和发病机制的确切的基因，许多学者做了大量的研究，包括基因表达研究，候选基因关联研究，全基因组连锁分析和全基因组关联研究(genome-wide associationstudies(GWAS))。GWAS是目前发现复杂疾病遗传易感基因的最热门的方法。这种研究方法是对全基因组范围的SNP进行总体分析，这样就能更容易发现和疾病发生有关联的基因。白癜风易感基因GWAS研究始于2010年，在欧洲和中国，目前有两个研究组应用了GWAS的研究方法，发现了一些与白癜风相关的易感基因，其中部分基因在不同的人群中得到了验证。2010年，Spritz等人首先对孤立的罗马尼亚人群中的32个白癜风病例和50个对照采用GWAS研究，发现SMOC2可能是白癜风一个易感基因。同年，Richard等人在欧美人群(1514个病例813个对照)中进行了一项白癜风易感基因的GWAS研究，发现了PTPN22，RERE，UBASH3A，C1QTNF6，GZMB等基因上的SNP点与白癜风易感性相关。 目的：探讨与欧美人群白癜风相关的易感基因PTPN22，RERE，UBASH3A，C1QTNF6，，GZMB上的易感位点与中国汉族人群白癜风是否存在相关性，以搜寻不同种族之间白癜风共同的易感基因。 方法： 1.采用统一设计的白癜风遗传流行病学调查表和正常对照调查表，由经过专门培训的流行病学调查员以问卷调查的形式，收集白癜风病例1977例和正常对照2024例； 2.以Richard等在2010年的研究为依据，共挑选了分别位于基因RERE、PTPN22、GZMB、UBASH3A和C1QTNF6上的8个SNP：RERE rs301819(P=8.85×10~(-9),OR=1.32(1.21 1.45))；rs4908760((P=3.48×10~(-7),OR=1.28(1.17 1.41))；rs11121194(P=3.00×10~(-7),OR=1.28(1.17 1.41))；PTPN22rs2476601(P=9.82×10~(-9),OR=1.54(1.33 1.78))；GZMB rs8192917(P=5.54×10~(-6),OR=1.28(1.15 1.42))；UBASH3A rs2839511(P=1.17×10~(-8),OR=1.36(1.23 1.51))；rs11203203(P=1.72×10~(-7),OR=1.30(1.18 1.42))；C1QTNF6rs5756546(P=4.34×10~(-7),OR=1.33(1.19 1.48))； 3.利用Sequenom Massarray系统，将这些SNP位点在中国汉族人群中进行分型； 4.应用PLINK1.07和SPASS16.0软件进行相关的数据分析，了解这些位点是否为中国汉族人群和高加索人群共同的易感位点（P≤0.05具有统计学意义）。 结果： 1.经统计学分析结果显示，在中国汉族人群中，PTPN22，RERE，UBASH3A，C1QTNF6，GZMB基因上的8个SNP位点（rs301819, rs4908760,rs11121194, rs2476601, rs11203203, rs2839511， rs8192917，andrs5756546）的等位基因频率在病例组(1977例)和对照组(2024例)之间差异无统计学意义（P0.05）。 2.分层分析结果显示：分别以性别，发病年龄≤20岁和发病年龄20岁，有家族史和无家族史进行分层分析，rs4908760在有白癜风家族史的患者中，其等位基因频率在有家族史和无家族史患者之间有差异（P=0.0244, OR=1.346,95%CI=1.038-1.745），基因型频率在有家族史和无家族史患者之间有差异（P=0.012），但对上述组别间的比较进行校正后，其差异无统计学意义。 结论：通过统计学分析，位于基因RERE、PTPN22、GZMB、UBASH3A和C1QTNF6上的8个SNP位点（rs301819, rs4908760, rs11121194, rs2476601, rs11203203,rs2839511，rs8192917，andrs5756546）可能与中国汉族人群白癜风患者发病无相关性，不同人群可能存在一定的遗传异质性。
【关键词】：白癜风 易感基因 关联分析
【学位授予单位】：安徽医科大学
【学位级别】：硕士
【学位授予年份】：2013
【分类号】：R758.41
【目录】：

• 英文缩略词表6-7
• 中文摘要7-10
• Abstract10-12
• 1 引言12-14
• 2 材料与方法14-31
• 2.1 研究对象14-16
• 2.2 临床资料收集及录入16-17
• 2.2.1 调查表的特点16
• 2.2.2 临床表型划分16-17
• 2.2.3 SNP 点的选择17
• 2.3 实验试剂17-19
• 2.3.1 DNA 提取试剂17-18
• 2.3.2 电泳用试剂18
• 2.3.3 标准化 DNA 用试剂18
• 2.3.4 Sequenom MassArray 系统基因分型用试剂18-19
• 2.4 实验仪器19-21
• 2.4.1 DNA 提取器材19-20
• 2.4.2 电泳的仪器20
• 2.4.3 DNA 标准化仪器20-21
• 2.4.4 Sequenom MassArray 系统基因分型用仪器21
• 2.5 实验方法和步骤21-31
• 2.5.1 全血标本采集21
• 2.5.2 基因组 DNA 制备21-23
• 2.5.3 基因组 DNA 电泳23-24
• 2.5.4 基因组 DNA 标化24
• 2.5.5 Sequenom MassArray 系统基因分型24-31
• 2.6 统计学方法31
• 2.6.1 Hardy-Weinberg 平衡检31
• 2.6.2 频数分布(Frequencies)31
• 2.6.3 描述(Descriptives)31
• 3 结果31-36
• 4 讨论36-41
• 5 结论41
• 参考文献41-45
• 附录45-47
• 致谢47-48
• 课题综述48-60
• 参考文献56-60

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  本文关键词：欧美人群白癜风易感基因与汉族人群相关性研究，由笔耕文化传播整理发布。

本文编号：255245