银屑病易感基因RUNX3与SLE及其临床表型的相关性研究
本文关键词:银屑病易感基因RUNX3与SLE及其临床表型的相关性研究,由笔耕文化传播整理发布。
【摘要】:研究背景:系统性红斑狼疮(Systemic Lupus Erythematosus, SLE),作为一种多脏器和多系统受累的自身免疫性疾病,其临床表现复杂并具有多样性。其发病机制尚不完全清楚,多以为该病是由多种遗传因素和环境因素协同作用下并通过免疫途径导致疾病的发生。自2008年,多个人群的SLE全基因组关联研究已经确定了40多个与SLE相关的基因/位点,同时还发现这些易感基因同时也与其他免疫性疾病相关,如银屑病、类风湿性关节炎、克罗恩肠病等。银屑病(Psoraisis,Ps)以红斑和鳞屑为主要临床表现,是一种慢性、炎症性、复发性自身免疫性皮肤病。两者都属于自身免疫性疾病,发病机制相似,有共享易感基因,其中已发现的银屑病与SLE共同易感基因有TNFAIP3,TNIP1,PTTG1,TRAF6,TYK2,TRAF3IP2,NFKBIA,IL28RA等。近年Nature Genetics杂志报道了RUNX中部分基因与银屑病等免疫性疾病的相关,并且所报道SNP位点全部位于RUNX1蛋白的结合位点。以上研究结果表明RUNXs家族成员与免疫疾病相关,但是RUNX3基因是否也与SLE相关还不明确,这也是开展本课题的目的。 目的:1.研究银屑病易感基因RUNX3基因多态性与SLE是否相关;2.进一步分层分析,探讨中国汉族人群SLE临床表型与该基因单核苷多态性rs7536201、rs4649038、rs11249215的相关性。 方法:本研究从银屑病的易感基因RUNX3中选出3个SNP点,利用SequenomMassarry验证平台在2208个SLE病例和2208个健康对照样本中进行验证,,用Plink1.07软件进行统计分析。对SLE分类标准11项表型(1997年美国风湿协会修订)、发病年龄、血管炎、C3进行分层;进行病例阳性-病例阴性分析(如有盘状红斑和无盘状红斑患者),确定与RUNX3单核苷酸多态性相关的临床表型,表型阳性/阴性-对照分析(如有盘状红斑/无盘状红斑患者和健康对照),探讨SNPs对不同临床表型所贡献的风险大小。 结果:1. SNP rs4649038等位基因频率的分布在病例和健康对照组之间的差异有统计学意义(P=0.029,P<0.05)。 2.基因型-表型分析结果: 1)SNP rs7536201在病例阳性-病例阴性分析结果中显示该SNP点在盘状红斑和抗核抗体的差异有统计学意义(P<0.05),在其他临床表型差异无统计学意义(P>0.05)。在表型阳性/阴性-对照分析结果中只显示了该SNP点等位基因频率在临床表型ANA中有明显差异(P<0.05),而在其它表型中无差异(P>0.05)。 2)SNP rs4649038在病例阳性-病例阴性分析结果中显示该SNP点在面部蝶形红斑、盘状红斑和神经系统异常的差异有统计学意义(P<0.05),在其他临床表型的差异无统计学意义(P>0.05)。在表型阳性/阴性-对照分析结果中显示了该SNP点等位基因频率分布在大多数表型的分布中有明显差异(P<0.05),在发病年龄、口腔溃疡、抗RNP抗体和免疫学异常的分布无差异(P>0.05)。 3)SNP rs11249215在病例阳性-病例阴性分析结果中显示该SNP点与面部蝶形红斑和盘状红斑的差异有统计学意义(P<0.05),与其他临床表型的差异无统计学意义(P>0.05)。在表型阳性/阴性-对照统计分析结果中显示了该SNP点等位基因频率在所有表型分布中无差异(P>0.05)。 结论:结果显示银屑病易感基因RUNX3SNP rs4649038与SLE相关,并且与SLE多种表型相关,另两个SNP点只与SLE某些表型相关。
【关键词】:系统性红斑狼疮 RUNX3 单核苷酸多态性 易感基因
【学位授予单位】:安徽医科大学
【学位级别】:硕士
【学位授予年份】:2014
【分类号】:R758.63
【目录】:
- 英文缩略词表5-6
- 中文摘要6-8
- 英文摘要8-11
- 1 引言11-13
- 2 试验方法13-26
- 2.1 研究对象13-15
- 2.2 实验试剂15-16
- 2.3 实验仪器及耗材16-17
- 2.4 一般试验方法17-20
- 2.5 基因分型20-25
- 2.6 数据统计分析25-26
- 2.7 临床表型的评定26
- 3 结果26-36
- 3.1 研究对象的一般临床资料26-27
- 3.2 SLE 患者的临床表现情况27-28
- 3.3 SNP rs7536201、rs4649038、rs11249215 的验证实验结果28-29
- 3.4 基因型-表型分析结果29-36
- 4 讨论36-39
- 5 结论39
- 6 参考文献39-44
- 附录44-46
- 致谢46-48
- 综述48-60
- 参考文献56-60
【共引文献】
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本文关键词:银屑病易感基因RUNX3与SLE及其临床表型的相关性研究,由笔耕文化传播整理发布。
本文编号:280641
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