汉族人群银屑病和强直性脊柱炎易感位点的相关性研究
发布时间：2017-09-29 19:11
本文关键词：汉族人群银屑病和强直性脊柱炎易感位点的相关性研究
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【摘要】：研究背景： 银屑病（psoriasis, OMIM㥮177900）是一种常见的慢性炎症性皮肤病，以红斑、鳞屑为主要临床特征，具有明显的复发特性。据流行病统计结果发现，该病可发生于各人种，但是不同种族发生率有明显的差异。遗传因素和免疫介导在本病发生过程中扮演了重要角色，而且多种免疫调节剂对此病疗效显著，因此银屑病也被认为是一种自身免疫性疾病。13个银屑病易感位点已被OMIM收录，为：PSORS1，PSORS2，PSORS3，PSORS4，PSORS5，PSORS6，PSORS7，PSORS8，PSORS9，PSORS10，PSORS11，，PSORS12和PSORS13，分别位于6p21.3、17q25、4q、1q21、3q21、19p13、1p、16q、4q31、18p11、5q31.1、20q13和6p21。一些发现也证明银屑病和其他疾病如自身免疫系统疾病，如强直性脊柱炎（Ankylosingspondylitis, AS）、克罗恩肠病（Crohn’s Disease, CD）等，有着共同的易感基因。HLA-DR7在英国与幼年型AS有关，而其同时也与Ⅰ型银屑病相关。基因IL23R和ERAP1也已被证明同时与银屑病和AS相关，而且临床上10%的AS患者同时患有银屑病。病因上，二者也有一致性。AS是一种慢性进行性炎症性以脊柱关节受累为主的免疫性疾病，大量研究显示AS是一种遗传病。遗传因素在其发病过程中起主导作用,相关基因除HLA-B27外,尚有HLA区域内及HLA区域外的其他基因参与，已发现的基因和位点IL23R、ERAP1、rs4672495（2p15）、rs4333130（4q21）、rs2242944(21q22)、rs4552569（5q14.3）和非同义核苷酸多态性（non-synonymoussingle nucleotide polymorphism, nsSNP) rs4077515（9q34.3）和位于KIF21B的rs2297909（1q32）。国际单体图型计划（Human Haplotype Map, HapMap）的完成和廉价高效的高通量基因分型技术的出现，为全基因组水平搜寻复杂疾病易感基因的方法即全基因组关联研究（Genome-wide association study, GWAS）提供了支撑，全基因组关联研究（GWAS）在常见复杂疾病的遗传学研究中有更高的效力。为了更好地揭示银屑病和AS之间的关系，也为了更好地揭示银屑病的遗传学依据，本研究以欧美人群AS患者全基因组关联分析（GWAS）数据为基础，在中国汉族银屑病患者中（2208病例和2208对照）进行验证。 目的：研究欧美人群强直性脊柱炎易感位点在中国汉族人群银屑病中的作用，搜寻两种疾病之间的遗传共性和异质性。 方法：从欧美人群强直性脊柱炎患者的全基因组关联分析（GWAS）发现的易感位点中选择8个SNP位点，利用Sequenom Massarray验证平台在中国汉族人群2208例银屑病病例和2208例正常对照中进行验证，用Plink1.07软件进行统计分析。 结果：1.8个SNP位点等位基因的频率分布在病例组与对照组间的差异无统计学意义（P0.05）。2.将病例按照临床表型分组后进行分层比较，rs2297909等位基因频率分布在对照组和银屑病伴家族史病例组之间的差异有统计学意义（P=0.01），有无家族史组间的差异也有统计学意义（P=0.01）；在对照组和发病年龄40岁组间的差异有统计学意义（P=0.03），在发病年龄≤40岁和发病年龄40岁组间的差异也有统计学意义（P=0.0016）。3.rs6854711等位基因的频率分布在对照组与发病年龄40岁间的差异有统计学意义（P=0.049）。4.其余6个位点等位基因的频率分布在分层比较中的差异无统计学意义（P0.05）。 结论：本研究在中国汉族人群银屑病病例和对照中对欧美人群报道的AS易感位点进行关联分析。首次发现rs2297909（1q32）与银屑病家族史和发病年龄均相关，rs6854711（4q21）与银屑病发病年龄相关。在其余6个位点中未发现与中国汉族人群银屑病相关，提示在这两种疾病不同人群之间可能存在遗传异质性。
【关键词】：银屑病 强直性脊柱炎 全基因组关联分析 单核苷酸多态性
【学位授予单位】：安徽医科大学
【学位级别】：硕士
【学位授予年份】：2013
【分类号】：R758.63;R593.23
【目录】：
- 目录4-6
- 英文缩略词表6-7
- 中文摘要7-9
- Abstract9-11
- 1．引言11-17
- 2．材料和方法17-39
- 2.1 研究对象17-18
- 2.2 研究方法18-19
- 2.3 实验试剂19-20
- 2.3.1 DNA 提取试剂19
- 2.3.2 电泳用试剂19
- 2.3.3 标准化 DNA 用试剂19-20
- 2.3.4 基因分型用试剂20
- 2.4 实验仪器20-22
- 2.4.1 DNA 提取器材20-21
- 2.4.2 电泳的仪器21
- 2.4.3 DNA 标准化仪器21-22
- 2.5 分析软件和电子数据库查询信息22-23
- 2.6 实验方法和步骤23-39
- 2.6.1 全血标本采集23-24
- 2.6.2 基因组 DNA 提取及注意事项24-25
- 2.6.3 基因组 DNA 电泳25-26
- 2.6.4 DNA 浓度标准化26-27
- 2.6.5 Sequenom MassArray 系统基因分型27-39
- 2.6.5.1 SNP 点的选择27
- 2.6.5.2 引物设计及合成27-30
- 2.6.5.3 Sequenom 实验日程安排30-37
- 2.6.5.4 Plink1.03 软件进行统计分析37-39
- 3．结果39-44
- 4．讨论44-46
- 5．结论46-47
- 6．参考文献47-50
- 附录50-52
- 致谢52-54
- 课题综述54-60
- 参考文献57-60
【共引文献】
中国期刊全文数据库 前8条
1 常树霞;陈永锋;;Th17细胞与银屑病[J];皮肤性病诊疗学杂志;2010年01期
2 吴歆;徐沪济;吴宁;;IL-23R的研究现状[J];中国热带医学;2008年01期
3 李洪武;;地蒽酚蜡棒短程接触疗法联合窄谱中波紫外线治疗寻常型斑块状银屑病[J];实用皮肤病学杂志;2010年04期
4 李敏;唐先发;朱诚W
本文编号：943712
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