多发脑胶质母细胞瘤的全基因组、表观基因组分析及分子概况
本文关键词： 胶质瘤 核磁共振 多发胶质瘤 细胞色素b5还原酶2 基因组 出处：《天津医科大学》2016年博士论文 论文类型：学位论文
【摘要】：百分之十到二十的新发胶质母细胞瘤发病时存在多发病灶,称为多灶性胶质母细胞瘤或多中心性胶质母细胞瘤(M-GBM)。这些病人的预后要比单发胶质母细胞瘤差。但是目前还不清楚多发胶质瘤是否有着独特的基因组、表观基因组或分子基础。我们从TCGA数据库中203例有术前核磁共振图像的新发胶质母细胞瘤病人中,鉴定出30例多发胶质瘤,然后综合分析了这30例病人的全基因组基因突变、全基因组拷贝数变化、全基因组启动子甲基化及基因表达情况,并与173例单发胶质母细胞瘤的相应数据进行对比。我们发现多发胶质母细胞瘤缺乏IDH1、ATRX或PDGFRA突变,多发胶质母细胞瘤病人中间质型常见。同时,我们还发现CYB5R2在多发胶质母细胞瘤病人中表达水平升高、而且CYB5R2的启动子甲基化水平在多发胶质母细胞瘤中降低。CYB5R2的表达水平在两个大型胶质瘤病人数据库,共超过700例胶质瘤病人中与预后负相关,CYB5R2表达水平高的病人预后差。IDH1突变与CYB5R2启动子甲基化明显相关,但CYB5R2表达水平对预后的影响却独立于IDH1突变。CYB5R2的表达与抗原成熟及分解过程以及免疫调节密切相关。这些结果表明,多发胶质母细胞瘤有着一些独特的基因组、表观基因组特征,并且多发胶质母细胞瘤病人预后较差,CYB5R2是一个新的表观基因组标志物。
[Abstract]:Between 10% and 20 of the newly developed glioblastoma had multiple lesions. Known as multifocal glioblastoma or multicentric glioblastoma, the prognosis of these patients is worse than that of single glioblastoma, but it is not clear whether multiple gliomas have a unique genome. Epigenome or molecular basis. We identified 30 patients with multiple gliomas from a TCGA database of 203 newly developed glioblastoma patients with preoperative MRI images, and then comprehensively analyzed the gene mutations in the entire genome of these 30 patients. The whole genome copy number, methylation and gene expression of the whole genome promoter were compared with the corresponding data of 173 cases of single glioblastoma. We found that multiple glioblastoma lacks IDH1T ATRX or PDGFRA mutation. The expression of CYB5R2 in patients with multiple glioblastoma is higher than that in patients with multiple glioblastoma. Moreover, the promoter methylation level of CYB5R2 decreased in multiple glioblastoma. CYB5R2 expression level was found in two large glioma patient databases. In more than 700 glioma patients, the prognosis of patients with high CYB5R2 expression was negatively correlated with the prognosis. IDH1 mutation was significantly associated with methylation of CYB5R2 promoter. However, the effect of CYB5R2 expression on prognosis is independent of the expression of IDH1 mutation. CYB5R2 is closely related to antigen maturation, decomposition and immunomodulation. These results suggest that multiple glioblastoma has some unique genomes. The prognosis of patients with multiple glioblastoma is poor. CYB5R2 is a new apparent genomic marker.
【学位授予单位】：天津医科大学
【学位级别】：博士
【学位授予年份】：2016
【分类号】：R739.41
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，本文编号：1504811
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