五羟色胺转运体（5-HTT）基因与原发性失眠睡眠表型关系的研究

发布时间：2020-04-10 18:07

【摘要】：目的:研究表明原发性失眠(primary insomnia,PI)具有遗传特征,五羟色胺(5-hydroxy tryptamine,5-HT)参与了睡眠调节功能,而5-HT转运体(5-H T transporter,5-HTT)对5-HT的功能发挥起关键作用,本文从基因组水平出发探讨5-HTT基因多态性上的6个位点(rs2020936、rs3794808、rs140700、rs6352、5-HTTLPR、STin2 VNTR)与PI的相关性,旨在为获得原发性失眠相关的人群基因信息数据,为将来构建与PI相关的基因信息数据库打下基础,同时将5-HT T基因多态性检测作为PI诊断和治疗的重要临床指标。方法:本文研究共采集了112例PI患者和健康对照的外周血液标本,并提取收集的所有样本的全基因组DNA,利用HapMap、NCBI等网站和数据库选择5-HTT基因功能性SNP,选择了6个(rs2020936、rs3794808、rs140700、rs6352、5-HTTLPR、STin2 VNTR)多态性位点进行研究;采取飞行质谱的方法进行引物设合成、PCR扩增、基因分型及测序验证;利用SPSS20.0软件对基因分型的结果进行统计分析,并用在线SHEsis软件对数据进行连锁不平衡分析和单倍型分析。结果:1.临床样本特征分析两组样本在年龄(Χ~2=1.448,P=0.154)、体重(Χ~2=0.673,P=0.504)、受教育年限(Χ~2=-0.355,P=0.724)等临床基线资料之间相比较无明显差异,无统计意义(P0.05);而两组样本在量表评分方面相比有差异,有统计学意义(P0.05)。2.SNP位点Hardy-Weinberg(HWE)平衡检测HWE平衡检测示,两组在观察值和预期值方面均不存在差异,不具有显著性(P0.05),即两组都符合HWE法则。3.单个SNP位点与原发性失眠的关联分析5-HTT基因上的rs2020936位点在PI组和对照组中的差异,无统计意义(P=0.830,OR=0.912,95%CI=0.394-2.113);rs3794808位点在PI组和对照组中的差异,无统计意义(P=0.443,OR=0.566,95%CI=0.130-2.462);rs140700位点在PI组和对照组中的差异,无统计意义(P=0.469,OR=0.703,95%CI=0.270-1.831);rs6352位点在PI组和对照组中的差异,无统计意义(P=0.554,OR=2.043,95%CI=0.179-23.292);5-HTTLPR位点在PI组和对照组中的差异,无统计意义(P=0.659,OR=0.878,95%CI=00.494-1.563);STin2VNTR位点在PI组和对照组中的差异无统计意义(P=0.715,OR=1.236,95%CI=0.395-3.867)。4.基因连锁不平衡分析5-HTT基因上的6个位点(rs2020936、rs3794808、rs140700、rs6352、5-HTTLPR、STin2 VNTR)之间存在连锁不平衡,其中rs140700与rs6352(D'=1.000)、rs2020936与rs6352(D'=1.000)之间存在完全连锁不平衡;rs2020936与rs3794808(D'=0.942)、rs3794808与rs6352(D'=0.980)、rs6352与5-HTTLPR(D'=0.997)、rs6352与STin2 VNTR(D'=0.999)之间存在强连锁不平衡;rs140700与rs2020936(D'=0.687)之间存在中度连锁不平衡。5.基因单体型分析对5-HTT基因上这6个位点构建出二十种单体型,其中C G C T L 12这种单体型在PI组和对照组中的差异有统计意义(P=0.041)。6.部分基因型与临床心理特征分析C组与T组(rs140700);C组与T组(rs3794808);S组与L组(5-HTTLPR);10组与12组(STin2 VNTR)在抑郁、焦虑量表总评分方面的差异无统计意义(P0.05)。结论:1.5-HTT基因多态性位点与原发性失眠在基因型和等位基因频率方面未发现相关性,还需在扩大样本量继续探究其与该疾病的相关性。2.本文研究发现5-HTT基因单倍型的构建中C G C T L 12这种单体型在PI组和对照组中的差异有统计意义(P=0.041),这种单体型可增加群体失眠的风险。3.基因连锁不平衡分析发现rs2020936与rs3794808、rs3794808与rs6352、rs6352与5-HTTLPR、rs6352与STin2 VNTR之间存在强连锁不平衡,上述基因位点有可能可增加原发性失眠的发生风险,推测基因与原发性失眠有可能相关,后续有待于扩充样本量后做进一步证实。4.尚未发现4个位点(rs140700、rs3794808、5-HTTLPR、STin2 VNTR)与PI患者焦虑和抑郁相关性,提示我们所选择的SNP位点可能与原发性失眠患者焦虑和抑郁无相关性。
【图文】：

琼脂糖凝胶电泳,对照组,五羟色胺,质量检测

五羟色胺转运体基因(5-HTT)与原发性失眠睡眠表型关系的研究第三章结果与分析1.DNA 质量检测1.1 凝胶电泳检测对本实验所提取出来的样本的全血基因组 DNA，用 1%琼脂糖凝胶电泳进行纯度及浓度的检测，，并分析其是否合格，检测结果如下图 3-1-1。

基因连锁,染色体,单体型,同源片段

图 3-5-2 原发性失眠患者 5-HTT 基因连锁不平衡分析6.基因单倍型分析染色体在代代遗传中倾向于整体遗传，但在遗传中同源片段发生重组，遗传代后母源染色体原有的组合被打乱，而没有被打乱的片段被重组的片段隔开于染色体上这些没有被打乱的等位位点相关联的区域被称作单倍型（haploty-e)[11]。对这 6 个位点单体型分析，结果见表 3-6-1。6 个SNP 基因位点共构建出十种单体型：C AC G L10、C AC T L10、C AC T L12、C AC T S 10、C AC S 12、C A T G L 10、C A T T L 10、C A T T L 12、C A T T S 10、C A T T S 12 G C T L 12、C G C T S 12、T A C T L 12、T A C T S 12、T G C T L 12、T G C 10、C G C T S 10、C G T T L 10、T G C T L 10、T G C T S 12，其中 C A C G 0、C A C T S 10、C A T G L 10、T A C T S 12、T G C T L 12、C G C T S 10、C G
【学位授予单位】：甘肃中医药大学
【学位级别】：硕士
【学位授予年份】：2019
【分类号】：R741

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