SAH时蛛网膜细胞极化状态的研究

发布时间：2020-06-17 03:11

【摘要】：目的:本研究通过收集a SHA(原发性蛛网膜下腔出血)患者发病后D1,D3,D5,D7脑脊液标本,通过提取m RNA并基因组测序,筛选出差异基因并分析差异表达基因通过生物信息学技术了解差异表达基因的生物学功能,推测SAH后Ar细胞的极化状态。方法:通过收集a SAH患者发病后D1,D3,D5,D7脑脊液标本,提取m RNA并基因测序,通过测序基因数据质量统计、参考基因组比对分析、转录本组装和新转录本预测、已知基因的差异表达、差异基因功能分析,筛选出差异基因并分析差异表达基因所富集的生物学功能,检测SAH发生后不同时间差异基因表达水平,推测出Ar细胞极化状态。结果:通过对m RNA基因组测序我们发现,同一患者D1,D3两个样本的reads数目,经过筛选得到差异基因987个,其中上调基因752个,占77%,下调基因235个,占23%;D3,D5两个样本的reads数目,经过筛选得到差异基因1210个,其中上调表达基因859个,占71%,下调表达基因351个,占29%;D5,D7两个样本的reads数目,经过筛查得到了差异表达基因2016个,其中上调表达基因1226个,占61%,下调表达基因790个,占39%。通过对以上3对差异表达基因进一步筛选,我们挑选出与a SAH后Ar细胞极化状态相关的差异表达基因,并通过生物学蛋白质技术推测差异表达基因的功能信息发现,IL-12(白细胞介素-12)、IL-18、IL-27、TGF-β等与M1极化相关的细胞因子伴随着疾病发展时间的推移而表达量出现增长的变化,而IL-10则表现为低表达水平。结论:1.Ar细胞作为蛛网膜下腔固有单核巨噬细胞,在a SAH后Ar细胞会功能性的出现不同的极化状态,参与后期的炎症反应。2.在a SAH后Ar细胞趋向于MI极化状态。
【学位授予单位】：蚌埠医学院
【学位级别】：硕士
【学位授予年份】：2019
【分类号】：R743.35
【图文】：

D1序列每个碱基位置的质量分数分布图

D3序列每个碱基位置的质量分数分布图

【参考文献】

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1 张建民;;动脉瘤性蛛网膜下腔出血诊治热点问题及展望[J];浙江大学学报(医学版);2015年04期

2 尚茹茹;张锦;袁锋;温婷;刘晓红;;M1和M2型巨噬细胞经ox-LDL刺激后细胞内脂质含量及分泌TNF-α、IL-10的浓度差别与意义[J];中西医结合心脑血管病杂志;2014年12期

本文编号：2716988