基因SOD2、SOD3、HDAC9多态性与大理州汉族缺血性脑卒中患者相关性研究

发布时间：2020-06-18 13:53

【摘要】：研究背景及意义:脑卒中是一种多因素疾病,环境因素和遗传因素的交互作用在脑卒中发病中具有重要的作用。全球每年约有1500万脑卒中病人,其中20%是致死的,50%以上的病人失去了生活自理能力。缺血性脑卒中约占脑卒中的85%以上,在中国其所占比例逐年增加,并且出现年轻化的趋势。单核苷酸多态性是最常见的遗传变异类型,分子遗传学的最新进展使人们意识到单核苷酸多态性与脑卒中存在密切的关联。超氧化物歧化酶(Superoxide Dismutase,SOD)是唯一已知的直接清除自由基的酶,是保护细胞的必需的抗氧化酶。大量动物实验表明SOD与脑卒中存在密切关联。蛋白脱乙酰化酶9(Histone Deacetylase,HDAC9)基因通过染色质结构修饰对基因表达的调控,但不改变DNA序列,HDAC9被鉴定为迄今为止大血管卒中的最强风险基因。然而研究基因SOD2(rs2842960)、SOD3(rs7655372)、HDAC9(rs723296)位点多态性与脑卒中之间的相关性尚不清楚。本实验为了解大理州居民脑卒中的遗传风险因素破译其基本机制、促进新治疗靶点的识别和优化预防策略提供科学依据。研究目的:研究基因SOD2(rs2842960)、SOD3(rs7655372)、HDAC9(rs723296)多态性与大理州脑卒中患者之间相关性。方法:实验采用病例-对照方法,随机选取符合研究目的的汉族脑卒中患者155名及汉族健康者128名。实时PCR方法对DNA进行扩增,改良型Taqman荧光定量技术对每个SNP位点进行基因分型。采用t检验、卡方检验、Logistics回归统计学方法对脑卒中传统危险因素进行分析;利用哈迪-温伯格平衡定律对研究对象进行遗传平衡检测,Logistics回归分析校正传统危险因素分析各SNP位点多态性对脑卒中易感性影响;直线回归分析rs723296多态性与血脂水平的关联。多因子降维方法分析基因-基因交互作用对脑卒中的影响。结果:⑴传统危险因素:空腹血糖(p=0.00 OR=2.885,95%CI 1.86-4.41),胆固醇(p=0.00 OR=2.378,95%CI 1.55-3.66),甘油三酯(p=0.013 OR=1.657,95%CI1.11-2.47),低密度脂蛋白(p=0.013 OR=1.641,95%CI 1.11-2.42),白细胞(p=0.00 OR=1.515,95%CI 1.27-1.81),收缩压(p=0.03 OR=1.017,95%CI 1.00-1.03),红细胞(p=0.007 OR=0.477,95%CI 0.28-0.82),p均小于0.05。⑵基因SOD2(rs2842960)显性模型中基因型中CC/(CT+TT):p=0.383,OR=0.767,95%CI:0.423-1.392。⑶基因SOD3(rs7655372)加性模型中GG/GA:p=0.028,OR=3.188,95%CI:1.134-8.962。⑷基因HDAC9(rs723296)加性模型中TC/TT:p=0.021,OR=2.669,95%CI:1.046-4.923。⑸基因HDAC9(rs723296)与血脂在实验组中:低密度脂蛋白(β=0.171,p=0.456),胆固醇(β=-0.141,p=0.502),甘油三酯(β=0.035,p=0.865);在对照组中:低密度脂蛋白(β=0.364,p=0.301),胆固醇(β=-0.573,p=0.083),甘油三酯(β=0.340,p=0.337),p均大于0.05,无统计学意义。⑹基因SOD2(rs2842960)、SOD3(rs7655372)、HDAC9(rs723296)之间有较强的交互作用(交叉一致性为10),但对脑卒中发病并无显著影响(p㧐0.05)。结论:基因SOD3(rs7655372)、HDAC9(rs723296)多态性增加了大理州居民脑卒中患病风险,基因SOD2(rs2842960)多态性与脑卒中易感性无关。基因HDAC9(rs723296)位点多态性与血脂水平并无关联。基因SOD2(rs2842960)、SOD3(rs7655372)、HDAC9(rs723296)基因-基因交互作用对脑卒中发病并无显著影响。
【学位授予单位】：大理大学
【学位级别】：硕士
【学位授予年份】：2019
【分类号】：R743.3
【图文】：

纯合子,样本,等位基因,荧光探针技术

大理大学硕士学位论文第十一节改良型 TaqMan 荧光定量技术识别/检测单核苷酸多态性或突变的方法应具有高度的特异性和方面，聚合酶链反应（polymerase chain reaction ,PCR）为许多分子要的分析性能。本实验对 SNP 检测采用 TaqMan 荧光探针技术，在术基础上加入荧光标记探针，对 SNP 位点进行快速准确的分析。改荧光探针技术相比于传统酶切电泳法有一下几个优点：1、相比TaqMan 荧光定量技术检测环境封闭，避免了扩增产物人为因素污染性的产生；2、光谱技术提高了检测的灵敏性；3、荧光探针杂交，特异性；4、此过程均为一体化，这使得 SNP 检测更为简单和快捷。

完整性,电泳图,样本,完整性检测

图4 DNA样本纯度检测（浓度为268.7ng/l，OD260/OD280为1.76）第三节 DNA 完整性检测凝胶成像系统检测结果如图 5 所示。9 号泳道加入 DNA marker，其余 1-17 号泳道加入为 DNA 样本，其中 10、15号泳道出现拖带现象，说明次样本 DNA完整性较差，舍弃重新提取。DNA marker 跑出条带分子量大小由上到下依次为5000bp、3000bp、2000bp、1500bp、1000bp、750bp、500bp、250bp、100bp。1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 16 1750

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