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MicroRNA-148a通过靶向调控GADD45促进神经胶质瘤的迁移和侵袭

发布时间:2020-07-22 15:29
【摘要】:目的:本课题拟通过寻找mir-148a的靶基因,验证mir-148a与靶基因之间的相互作用并研究其对神经胶质瘤细胞迁移和侵袭能力的影响。方法:1、运用生物信息学预测软件TargetScan、miRanda、PicTar、PITA筛选和预测mir-148a的靶基因;2、运用生物素标记的RNApull down筛选mir-148a的靶基因;3、运用荧光素酶报告基因验证mir-148a的靶基因;4、运用荧光定量PCR和Western Blot的方法检测GADD45在mir-148a过表达和抑制表达稳定细胞系中的基因和蛋白表达水平;5运用transwell迁移和侵袭实验、划痕实验来验证mir-148a通过靶向调控GADD45促进神经胶质瘤的迁移和侵袭作用。结果:1、生物信息学预测软件TargetScan、miRanda、PicTar、PITA分别预测mir-148a的靶基因434个、7402个、434个、1847个,根据预测网站的评分及同源序列对比和互补,初步预测MEOX2-1、MEOX2-2、GADD45A-1、GADD45A-2、AG04、DLGAP1 为 mir-148a 的潜在靶基因。2、生物素标记的RNApull down结果表明,以DNMT1为阳性对照,初步筛选只有GADD45A-2是mir-148a的靶基因。3、荧光素报告基因活性检测的结果证实,mir-148a能与GADD45 3'UTR区结合,抑制其报告基因的荧光强度,这些结果确证,miR-148a通过GADD45A基因3'UTR上的该位点来调控基因的表达,GADD45是mir-148a的靶基因。此外,qRT-PCR和Western Blot实验的结果表明,与正常神经胶质细胞相比,GADD45在神经胶质瘤细胞系的表达明显下调,且差异具有统计学意义(P0.05)。4、通过构建GADD45过表达慢病毒载体(pLent-GADD45),感染神经胶质瘤U251、U87细胞系,建立了 GADD45过表达稳定细胞系。5、利用荧光定量PCR和Western Blot分析,验证了 mir-148a过表达下调GADD45基因和蛋白表达,mir-148a抑制表达时结果相反。这些结果证明mir-148a对GADD45存在调控作用。6、构建过表达GADD45慢病毒载体(pLent-GADD45),感染神经胶质瘤U87、U251细胞系后进行transwell迁移和侵袭实验、划痕实验,发现过表达GADD45减弱U87、U251的迁移和侵袭能力。结论:1、GADD45 是 mir-148a 的靶基因;2、mir-148a通过靶向调控GADD45促进神经胶质瘤细胞的迁移和侵袭。
【学位授予单位】:湖南师范大学
【学位级别】:硕士
【学位授予年份】:2018
【分类号】:R739.4
【图文】:

电泳图,琼脂糖,电泳,神经胶质细胞


逦:邋LogScaie逦Temperature,邋Celsius逡逑图1-2:逦RT-PCR的扩增曲线和融解峰。逡逑60-1邋*逡逑c逦J,逡逑0邋*逡逑'l逡逑?40_逦_r.逡逑S-逡逑①邋*逡逑TO逡逑芽邋20-逦[31,逦*逡逑^逦姦l逡逑0N0——M——M——M——M—逡逑HA邋1800逦BT325逦U251逦U87逦SW038逡逑图1-3:逦mir-148a在神经肢质瘤细胞系中的表达与神经胶质细胞HA1800比较.?邋><0.05。逡逑9逡逑

分布情况,硕士学位论文,预测软件,生物信息学


逦硕士学位论文逦逡逑DLGAP1为mir-148a的潜在耙基因(见图2-1)。其中在TargetScan中我们查询逡逑了邋GADD45邋(NM001924.3)邋3’UTR邋处有邋8mer邋大小片段和邋mir-148a邋结合(见图逡逑2-2)。逡逑己验证个数逡逑*

靶基因,凝胶电泳,产物


从而与其他成分分离。复合物洗脱后,检测特定的RNA结合蛋白是否与RNA逡逑相互作用。逡逑图2-3、图2-4数据所示为存在有统计学意义的Input值的靶基因,即总RNA逡逑中检测到的RNA。DNMT1作为阳性对照,结果表明了图示基因中只有逡逑GADD45A-2邋是邋mir-148a邋的靶基因。逡逑DNMT1邋MEOX2-1邋MEOX2-2逦AG04邋GADD45A-1邋GADD45A-2逡逑bp邋M/,癌//"/"/"/"逡逑&邋三i逡逑200—逡逑1C.:—i逦。逦…、…厂逡逑DLGAPt逡逑bP邋/,/逡逑500_r:逡逑403邋一k逦:邋?逡逑100逡逑图2-3:待测靶基因RNA邋PULL邋DOWN产物的凝胶电泳图。逡逑s邋-|逡逑■邋conlrd逡逑^逦*邋miF-l4Sa-3p逡逑t邋6-逡逑%逡逑^逦4-逦?逡逑s邋S逡逑量d邋i‘'气逦,逡逑□逡逑se逡逑s,逡逑0.0-1一"逦T逦T-*邋邋,邋逡逑图2-4:以DNMT1为对照,GADD45A-2的input值有阳性反应:><0.05。逡逑21逡逑

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