FCGR2A基因和TBXAS1基因多态性与中国汉族人群缺血性脑卒中的相关性研究

发布时间：2020-07-26 15:33

【摘要】：目的:在我国,脑卒中的发病率和死亡率均明显高于心血管疾病,其中约70%为缺血性脑卒中(Ischemic stroke,IS)。现有研究显示遗传因素在IS发病中起重要作用,提出IS是遗传因素和环境因素共同作用的复杂性疾病。近年来,国内外学者通过基因多态性关联分析、全基因组扫描等方法已经报告了一些与IS有关的新的易感基因,但针对这些候选基因在不同地区、针对不同种族的关联性研究尚未得到有效的重复和肯定。动脉粥样硬化的形成是IS的重要病理基础,而炎症反应可损伤动脉内膜、参与粥样斑块的形成和破裂过程,促进动脉管腔内血栓的形成。炎症反应在动脉粥样硬化的过程中起着关键作用。因此,本研究着眼于中国北方汉族人群,选择了炎症相关的FCGR2A基因和参与动脉粥样硬化形成的TBXAS1基因作为候选基因,采用病例-对照研究的方法,比较FCGR2A基因的多态性位点(rs6427595、rs6696854、rs7512140)及TBXAS1基因的多态性位点(rs2267682、rs6962291、rs10487667)的基因型、等位基因及单倍型在IS组和对照组中的频率分布差异,从而探讨FCGR2A基因和TBXAS1基因多态性与中国北方汉族人群IS之间的关联,以期为寻找IS相关的易感基因提供一定的分子遗传学方面的证据。研究方法:病例组选自2010年10月-2011年3月就诊于中国医科大学附属第一医院神经内科、辽宁医学院附属第一医院神经内科的中国北方汉族IS患者,均无亲缘关系,纳入研究370例,其中男220例,女150例,年龄47-81岁,依据TOAST分型标准分为2个亚组:大动脉粥样硬化性脑梗死组(Large-artery atherosclerosis,LAA)和小动脉闭塞性脑梗死组(Small-artery occlusion,SAO);对照组来自中国医科大学附属第一医院体检中心,共计340例,其中男性193例,女性147例,年龄、性别与病例组相匹配,均为汉族,彼此无亲缘关系。选取FCGR2A基因rs6427595、rs6696854、rs7512140及TBXAS1基因rs2267682、rs6962291、rs10487667位点为候选SNP,应用多重单碱基延伸SNP分型技术(Multiplex SNaPshot)检测上述位点多态性,以期明确这两个基因与中国北方汉族人群缺血性卒中的关联。通过?~2拟合优度检验验证每个位点SNP的基因型在抽样群体中的分布是否符合Hardy-Weinberg平衡。应用?~2 Fisher’s精确概率法检验各SNP位点的基因型、等位基因在IS组与对照组中的频率分布差异及风险度,采用条件Logistic回归方法排除传统混杂因素的干扰,P0.05有统计学差异。应用SHEsis在线软件完成上述基因的连锁不平衡和单倍型分析。结果:1、本研究所选取SNP位点的基因型在抽样群体中的分布均符合Hardy-Weinberg平衡(P0.05),说明该样本具备人群代表性。2、FCGR2A基因(rs6427595、rs7512140、rs6696854)位点基因型和等位基因频率分布在IS组与对照组间无统计学差异.。3、IS各亚组与对照组相比较,FCGR2A基因(rs6427595、rs7512140、rs6696854)的多态性频率分布亦无统计学差异。4、单倍型分析显示对照组AGC和AGT单倍型频率明显高于IS组,携带AGC和AGT单倍型的个体发生IS的风险分别降低0.337和0.349倍(OR=0.337,95%CI:0.185-0.616,P0.001;OR=0.349,95%CI:0.155-0.785,P=0.007)。在男性IS组与男性对照组构建的4个单倍体,男性IS组AAC单倍型分布频率明显高于对照组,携带AAC单倍型的男性个体罹患IS的风险率增加至1.452倍(OR=1.452,95%CI:1.030-2.049,P=0.032)。在女性IS组与女性对照组构建出4个单倍型,在女性IS组中GAC单倍型的分布频率明显高于对照组(OR=3.899,95%CI:1.112-13.669,P=0.022),AGC单倍型在女性IS组中的分布频率明显低于对照组(OR=0.172,95%CI:0.060-0.498,P0.001)。AGC单倍型在LAA组的分布频率明显低于对照组(OR=0.241,95%CI:0.095-0.611,P=0.001),在SAO组的分布频率也明显低于对照组(OR=0.422,95%CI:0.208-0.852,P=0.013)。5、IS组TBXAS1基因rs2267682位点的TT基因型和T等位基因的频率明显高于对照组(P=0.026,P=0.021)。携带TT基因型的个体发生IS的危险是GG+GT基因型的1.8倍(OR=1.800,95%CI:1.162-2.786,P=0.008),校正各种混杂因素后发病的相对危险度为1.943(OR=1.943,95%CI:1.134-3.329,P=0.016)。6、不同IS亚型的TBXAS1基因rs2267682位点基因型与等位基因的频率分布:在LAA组中rs2267682位点TT基因型和T等位基因明显高于对照组(P=0.004,P=0.015)。携带TT基因型的个体发生LAA的危险是GG+GT基因型的2.157倍(OR=2.157,95%CI:1.299-3.582,P=0.003),校正各种混杂因素后发病危险度为2.199倍(OR=2.199,95%CI:1.158-4.177,P=0.016)。rs2267682位点基因型与等位基因的频率分布在SAO组和对照组间比较无统计学差异(P=0.269,P=0.154)。7、IS组与对照组比较,TBXAS1基因(rs6962291、rs10487667)位点基因型和等位基因频率分布均无统计学差异。8、TBXAS1基因单倍型在IS组与对照组中频率分布:由rs2267682、rs6962291、rs10487667组建单倍型,在IS组与对照组共构建出7个单倍型,TAT单倍型在IS组中的分布频率明显高于对照组,携带TAT单倍型的个体罹患IS的风险增加至1.737倍(OR=1.737,95%CI:1.128-2.675,P=0.011)。结论:1、在中国人群中,FCGR2A基因rs6427595、rs6696854、rs7512140位点的多态性与该地区IS的发病无相关性。2、FCGR2A基因AGC单倍型、AGT单倍型可能是IS的保护性单倍型,携带上述单倍型可能降低中国北方汉族人群罹患IS的风险。3、FCGR2A基因AAC单倍型可能使中国北方汉族男性罹患IS的风险增加。4、FCGR2A基因GAC单倍型可能增加中国北方汉族女性罹患IS的风险。5、TBXAS1基因rs2267682位点TT基因型和T等位基因可能增加中国北方汉族人群罹患IS的风险,尤其是大动脉粥样硬化脑梗死的风险。6、TBXAS1基因rs6962291、rs10487667位点多态性与中国人群IS发病无相关性。7、TBXAS1基因TAT单倍型可能是预测中国北方汉族人群IS发病的风险单体型。
【学位授予单位】：中国医科大学
【学位级别】：博士
【学位授予年份】：2018
【分类号】：R743.3
【图文】：

基因,上游区,分型,多重

中国医科大学博士学位论文表 2.1 FCGR2A 基因 SNP 位点SNPs Locus Chr. Position Allelers6427595 5’上游区域 Chr1(q23) G/Ars6696854 5’上游区域 Chr1(q23) C/Trs7512140 5’上游区域 Chr1(q23) G/A2.4 多重单碱基延伸 SNP 分型技术检测 FCGR2A 基因各位点的多态性2.4.1 确定 SNP 和 Multiplex SNaPshot 技术rs6427595、rs6696854 和 rs7512140 的详细序列信息见图 2.1-2.3。这三个位点均位于 FCGR2A 的 5’上游区域，为了更准确的进行基因分型，我们选择了准确度仅亚于直接测序的多重单碱基延伸 SNP 分型技术（Multiplex SNaPshot）进行目的基因多态性的检测。

基因,分型,多重,多态性

2.4 多重单碱基延伸 SNP 分型技术检测 FCGR2A 基因各位点的多态性2.4.1 确定 SNP 和 Multiplex SNaPshot 技术rs6427595、rs6696854 和 rs7512140 的详细序列信息见图 2.1-2.3。这三个位点均位于 FCGR2A 的 5’上游区域，为了更准确的进行基因分型，我们选择了准确度仅亚于直接测序的多重单碱基延伸 SNP 分型技术（Multiplex SNaPshot）进行目的基因多态性的检测。图 2.1 rs6427595 的二等位基因

基因,基因图,分型,多重

仅亚于直接测序的多重单碱基延伸 SNP 分型技术（Multiplex SNaPshot）进行目的基因多态性的检测。图 2.1 rs6427595 的二等位基因图 2.2 rs6696854 的二等位基因

【参考文献】