杂合HTRA1突变致显性遗传性脑小血管病的临床特征
发布时间:2021-01-19 23:02
背景:伴皮质下梗死和白质脑病的常染色体隐性遗传性脑动脉病(cerebral autosomal recessive arteriopathy with subcortical infarcts and leukoencephalopathy,CARASIL)是一种罕见的遗传性脑小血管病,由HTRA1基因纯合或复合杂合突变导致,呈常染色体隐性遗传。然而,最近的研究发现杂合HTRA1突变也会引起脑小血管病(CSVD),并且呈常染色体显性遗传。目的:筛查中国CSVD患者的基因突变,重点探讨杂合HTRA1突变患者的基因突变谱及临床表型。方法:选择2015年3月至2019年7月收治的95例具有典型CSVD特征的患者,收集其相关临床资料、影像学资料和神经心理学评价结果,并应用全外显子测序技术(whole exome sequencing,WES)结合Sanger测序进行基因检测,用致病性预测软件对筛查到的变异进行致病性评估。分析并总结杂合HTRA1突变患者的基因突变谱及临床表型。结果:我们在95例CSVD先证者中检测出5个杂合HTRA1突变,且Sanger测序及家系共分离验证成功,其中3个是已知突...
【文章来源】:浙江大学浙江省 211工程院校 985工程院校 教育部直属院校
【文章页数】:61 页
【学位级别】:硕士
【部分图文】:
杂合HTRA1致病变异相关CSVD患者基因突变检测流程图
浙江大学硕士学位论文正文研究内容和方法9图2全外显子测序技术流程(引自祥音生物官网www.xiangyin.org.cn/)③变异位点筛选:去除变异频率在gnomAD、ExAc和1000Genomes数据库中大于0.05的变异位点,去除位于内含子等非编码区的全部变异及编码区的同义突变,保留下的变异位点根据其遗传模式、基因型-表型关系是否符合,再经PolyPhen2、SIFT、MutaionTaster、CADD和M-CAP等软件预测分析筛选,找到符合被检者表型的致病基因突变位点的初步数据。最后,根据ACMG指南,结合一代验证、家系共分离结果与Intervar自动判读证据,可将变异位点的性质划分为:致并可能致并良性、可能良性和不能确定[29-31]。
浙江大学硕士学位论文正文研究内容和方法11后分管备用。3、聚合酶链式反应(PCR)扩增目的序列使用2×TaqMix试剂盒(KT201,天根)进行PCR扩增反应,具体步骤按照说明书进行操作,PCR反应体系参见表3,PCR反应条件参见图3。表350μL反应体系成分名称浓度体积正向引物(Forward)10pmol/μL0.5μL反向引物(Reward)10pmol/μL0.5μL灭菌蒸馏水3μL模板DNA100ng/μL1μL2×TaqMix5μL总体积10μL图3PCR反应条件4、PCR产物检测操作步骤如上述DNA检测部分,配置1%的琼脂糖凝胶,电泳缓冲液为1×TAE,分别取5μLPCR产物加入1μL6×loadingbuffer充分混匀,逐孔上样,电泳时使用DNAmarkerD2000作为参照。
本文编号:2987856
【文章来源】:浙江大学浙江省 211工程院校 985工程院校 教育部直属院校
【文章页数】:61 页
【学位级别】:硕士
【部分图文】:
杂合HTRA1致病变异相关CSVD患者基因突变检测流程图
浙江大学硕士学位论文正文研究内容和方法9图2全外显子测序技术流程(引自祥音生物官网www.xiangyin.org.cn/)③变异位点筛选:去除变异频率在gnomAD、ExAc和1000Genomes数据库中大于0.05的变异位点,去除位于内含子等非编码区的全部变异及编码区的同义突变,保留下的变异位点根据其遗传模式、基因型-表型关系是否符合,再经PolyPhen2、SIFT、MutaionTaster、CADD和M-CAP等软件预测分析筛选,找到符合被检者表型的致病基因突变位点的初步数据。最后,根据ACMG指南,结合一代验证、家系共分离结果与Intervar自动判读证据,可将变异位点的性质划分为:致并可能致并良性、可能良性和不能确定[29-31]。
浙江大学硕士学位论文正文研究内容和方法11后分管备用。3、聚合酶链式反应(PCR)扩增目的序列使用2×TaqMix试剂盒(KT201,天根)进行PCR扩增反应,具体步骤按照说明书进行操作,PCR反应体系参见表3,PCR反应条件参见图3。表350μL反应体系成分名称浓度体积正向引物(Forward)10pmol/μL0.5μL反向引物(Reward)10pmol/μL0.5μL灭菌蒸馏水3μL模板DNA100ng/μL1μL2×TaqMix5μL总体积10μL图3PCR反应条件4、PCR产物检测操作步骤如上述DNA检测部分,配置1%的琼脂糖凝胶,电泳缓冲液为1×TAE,分别取5μLPCR产物加入1μL6×loadingbuffer充分混匀,逐孔上样,电泳时使用DNAmarkerD2000作为参照。
本文编号:2987856
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