基于转录组测序数据构建脑胶质瘤Cox比例风险回归模型
发布时间:2021-03-15 00:52
目的基于肿瘤基因组图谱(TCGA)计划数据库构建脑胶质瘤Cox比例风险回归模型,并在中国脑胶质瘤基因组图谱计划(CGGA)数据库中验证,探讨该模型对预后的评估价值。方法回顾性分析TCGA数据库中668例脑胶质瘤患者(试验组)、CGGA数据库中619例脑胶质瘤患者(验证组)的临床资料及其胶质瘤组织RNA测序数据,同时选取5例来源于TCGA数据库的正常脑组织样本的RNA测序数据作为对照。筛选TCGA数据库中脑胶质瘤与正常组织间的差异基因。在试验组中应用Cox回归方法建立风险模型。分别在试验组和验证组中,采用Kaplan-Meier法绘制生存曲线、Log-rank法检验高、低风险患者的生存差异,采用单因素、多因素Cox回归分析法分析影响脑胶质瘤患者预后的因素;将独立预后因素纳入分析,绘制列线图。高风险组中高表达的基因用于基因本体(GO)功能富集分析。结果试验组与验证组的年龄(<40岁或≥40岁)、性别、生存期差异均无统计学意义(均P>0.05),但世界卫生组织(WHO)肿瘤分级、病理类型分布、异柠檬酸脱氢酶1/2(IDH1/2)突变率等差异均有统计学意义(均P<0.05)。...
【文章来源】:中华神经外科杂志. 2020,36(05)北大核心
【文章页数】:7 页
【参考文献】:
期刊论文
[1]WHOⅡ级脑胶质瘤患者无进展生存期的影响因素分析[J]. 张东旭,曲彦明,张明山,任铭,谷春雨,王浩然,宁威海,郭玉铎,齐雪岭,张宏伟. 中华神经外科杂志. 2019 (05)
[2]胶质瘤基因分型和主要标志基因的研究进展[J]. 申大川,冷基勇,王若雨. 中华神经外科杂志. 2018 (10)
本文编号:3083266
【文章来源】:中华神经外科杂志. 2020,36(05)北大核心
【文章页数】:7 页
【参考文献】:
期刊论文
[1]WHOⅡ级脑胶质瘤患者无进展生存期的影响因素分析[J]. 张东旭,曲彦明,张明山,任铭,谷春雨,王浩然,宁威海,郭玉铎,齐雪岭,张宏伟. 中华神经外科杂志. 2019 (05)
[2]胶质瘤基因分型和主要标志基因的研究进展[J]. 申大川,冷基勇,王若雨. 中华神经外科杂志. 2018 (10)
本文编号:3083266
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