尿毒症合并脑出血患者血清早期预警蛋白标记物的筛选

发布时间：2022-02-22 02:10

　　目的比较和鉴定尿毒症及尿毒症合并脑出血患者血清差异表达蛋白,筛选“特异性的蛋白质分子”作为尿毒症合并脑出血患者诊断及早期预警的生物标志物。方法收集南昌大学第一附属医院急诊科尿毒症患者血清及尿毒症合并脑出血患者血清各6例,另收集健康成人血清标本6例,将标本分为3组:（1）尿毒症患者组;（2）尿毒症合并脑出血患者组;（3）健康成人对照组。将各组患者血清进行蛋白提取及酶解,再将样品取适量肽段使用纳升流速Easy nLC 1200色谱系（Thermo Scientific）进行色谱分离,肽段分离后用Q-Exactive Plus质谱仪（Thermo Scientific）进行DDA（数据依赖采集）质谱分,最终得到的LC-MS/MS原始数据导入Proteome Discoverer软件（版本号2.2）中的搜索引擎Sequest HT进行数据库检索。利用生物信息学分析及其在尿毒症脑出血病理生理学机制中的作用,筛选并鉴定差异表达蛋白作为生物标记物的候选蛋白,通过PRM方法对所筛选差异蛋白质进行验证。结果通过显著性差异分析,共得出三组实验结果,其中尿毒症与正常对比组显著差异表达蛋白共77个,上调蛋白7... 

【文章来源】：南昌大学江西省211工程院校

【文章页数】：54 页

【学位级别】：硕士

【文章目录】：
摘要
abstract
第1章 引言
第2章 材料与方法
    2.1 材料
    2.2 仪器和试剂
    2.3 蛋白质提取及酶解
    2.4 LC-MS/MS分析
    2.5 数据库检索
    2.6 生物信息学分析
    2.7 靶向定量蛋白质组学
        2.7.1 样品制备
        2.7.2 LC-PRM/MS分析
        2.7.3 质谱数据统计分析
第3章 结果
    3.1 蛋白浓度的测定
    3.2 蛋白质鉴定结果统计
    3.3 蛋白质鉴定结果比较
    3.4 生物信息学分析
        3.4.1 差异蛋白质Gene ontology(GO)富集分析
        3.4.2 差异性蛋白质KEGG通路富集分析
        3.4.3 差异性蛋白质相互作用网络分析
    3.5 候选标记蛋白的确定
    3.6 候选标记蛋白的验证(PRM验证)
        3.6.1 质谱Basepeak图
        3.6.2 目标肽段结果
        3.6.3 目标蛋白质定量结果
第4章 讨论
第5章 结论
致谢
参考文献
附录
综述
    参考文献


【参考文献】：
期刊论文
[1]枸橼酸抗凝行连续肾脏替代治疗成功救治尿毒症并发脑出血1例[J]. 丁道银,胡泉,李雪,胡望平.  中国急救复苏与灾害医学杂志. 2019 (09)
[2]大鼠脑出血后72h脑组织的定量蛋白质组学分析[J]. 李晓芳,杨国锋,刘丽,王鲁宁.  转化医学杂志. 2017(02)
[3]脑出血中豆纹动脉出血易发点的流固耦合分析[J]. 许长兴,张华,胡文超.  重庆理工大学学报(自然科学). 2016(04)
[4]α-内收蛋白基因多态性与小动脉弹性的关系研究[J]. 蒋素华,李新立,张海锋,王震震,德伟,袁栎,黄峻.  中华心血管病杂志. 2004(04)



本文编号：3638480