中国汉族特发性肌萎缩侧索硬化全基因组关联分析

发布时间：2022-08-01 17:17

　　目的：肌萎缩侧索硬化是一种运动神经元变性性疾病，目前发病机制尚不明确，但遗传因素在发病机制中可能起很大作用。基因组筛查是一种有效寻找易感基因的方法，前期研究已发现了一些候选基因，但其研究对象多为欧美人群。为此，我们对中国汉族人群特发性肌萎缩侧索硬化（sALS）进行全基因组扫描，以期发现新的易感基因。方法：收集200名临床确诊中国汉族sALS患者和200健康中国汉族人血样，提取基因组DNA，每个试验亚组样品DNA等量混合，构建病例组和对照组DNA混合池，通过全基因组SNP芯片高密度杂交分型，比较分析病例/对照各位点的等位基因频率差异。找出与sALS相关差异有显著统计学意义的基因位点。结果：①经临床资料分析，病例组平均发病年龄（48.5±8.4）岁，40岁以前和80岁以后发病少见，男女发病比例1.5∶1；对照组平均年龄（59.8±11.6）岁，男女比例1.3:1；②通过质量控制的有基因诠释信息的SNPs位点859311个，无基因诠释信息的SNPs位点12670个；发现8个新的可疑sALS风险基因位点：INPP5B （kgp15327256）， IQCF5/IQCF1（rs1605070），... 

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【学位级别】：硕士

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摘要
ABSTRACT
中英文缩略词
第1章 引言
第2章 材料与方法
    2.1 材料
        2.1.1 临床实验对象来源
        2.1.2 主要试剂
        2.1.3 主要实验设备和仪器
    2.2 方法
        2.2.1 实验对象的分组及资料收集
        2.2.2 DNA 的提取
        2.2.3 DNA 质量检测
        2.2.4 基因芯片扫描
        2.2.5 临床资料统计学分析
        2.2.6 基因芯片扫描数据统计学处理
        2.2.7 计算假阳性结果报告率
第3章 结果
    3.1 实验对象
        3.1.1 样品构成
        3.1.2 多态位点的等位基因频率估计
    3.2 离群位点的确定
    3.3 样品 DNA 中 ALS 相关的风险基因与国内外已发现的 ALS 易感基因的对比
    3.4 通路分析
第4章 讨论
    4.1 临床资料分析
    4.2 本次研究新发现的最可能与中国汉族 sALS 发病相关的基因
        4.2.1 ITGA925
        4.2.2 ALCAM
        4.2.3 OPCML
第5章 结论
    5.1 结论
    5.2 进一步工作的方向
致谢
参考文献
附表 本次实验发现的 SNP 及基因
攻读学位期间的研究成果
综述
    参考文献



本文编号：3667858