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帕金森病患者外周血circRNA的测序研究

发布时间:2023-10-15 19:03
  目的:通过测序技术分析帕金森病患者与正常对照组在外周血中circRNA的表达,比较两者间的差异表达水平,探讨显著差异表达的circRNA及其可能的信号通路和对应的靶基因,深入了解circRNA在帕金森病发病机制中的作用,为寻找帕金森病的诊断标志物提供新的研究方向。方法:将帕金森病患者(n=4)与正常对照(n=4)作为研究对象进行分组,分别收集两组的外周静脉血,根据PAXgene Blood RNA Kit操作手册提取、纯化RNA,通过NanoDrop 2000和Agilent2100检测RNA浓度及完整性。利用RNA测序技术分析mRNA和circRNA的表达情况并进行筛选。通过使用热图、火山图呈现显著差异表达的mRNA和circRNA。GO和KEGG富集分析显著差异表达的mRNA,从中获取与帕金森病发生发展相关的信号通路和靶基因。用miRTarBase数据库软件预测circRNA与miRNA的结合位点,TargetScan数据库软件预测mRNA与miRNA的结合位点,以此构建ceRNA网络,探究circRNA在帕金森病中的生物学功能。同时,对显著差异表达的circRNA使用qRT-PC...

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