MMPBSA I E方法在HLA体系中的应用研究
发布时间：2021-07-09 14:58
随着计算机技术的迅速发展,计算模拟已成为研究物理学、化学、生物学等诸多学科的重要手段。在生命科学中,针对生物大分子、疾病机理、药物研发方面的实验工作量通常过于庞大,而计算模拟能很好的弥补这一缺点。本文通过结合Amber的焓计算（MM/PBSA）,和本课题组发展的熵计算（IE）,通过丙氨酸扫描（AS）来确定蛋白-蛋白相互作用界面的热点残基。HLA（Human Leukocyte Antigen）是人体细胞免疫中的重要组成部分,与多种疾病相关,如强直性脊柱炎、反应性关节炎、乳糜泻。HLA分为HLAI型蛋白和HLA II型蛋白,分别通过两种免疫途径参与人体免疫反应,本文的前两个课题分别涉及了这两种HLA。第二章的课题研究的是HLA-II型蛋白对小肠乳糜泻的作用机理。从来自3个不同患者的4个蛋白晶体结构出发,通过分子动力学模拟和自由能计算,详细分析了 HLA II结合Peptide时的重要相互作用,以及TCR在识别HLA II Peptide过程中,TCR与HLA II以及TCR与Peptide的相互作用。通过分析TCR识别HLAIIPeptide的过程得出,尽管每个人体内TCR序列不完全相同...
【文章来源】：华东师范大学上海市 211工程院校 985工程院校 教育部直属院校
【文章页数】：99 页
【学位级别】：博士
【部分图文】：
图１．１－１人体兔疫系统
有部分病原体进入细胞，进入细胞后的病原体则??会启动第三道免疫防线。??有颌的脊椎动物，如人类，有一个适应性的免疫系统，使它们能够产生特定??的免疫反应［１４］，这就是由免疫器官（胸腺、淋巴结和脾脏等）和免疫细胞（淋巴细??胞）组成的第三道防线，能特异性的识别病原体９这是人体在出生以后根据病．原??体类型特异性建重起来的，国此叫特异性免疫或获得性免疫这种免疫在对??特定病原体做出免疫反应后会产生免疫记忆區迎，从而增强在下次遇到同＾病??．原体时的免疫反应，这也是接种疫苗的基矗??图１．１－２人体免疫系统。??ｈｔｔｐｓ：／／ａｓｋｔｈｅｓｃｉｅｎｔｉｓｔｓ．ｃｏｍ／ｗｐ－ｃｏｎｔｅｎｔ／ｕｐｌｏａｄｓ／２０１７／０９／ｉｍｍｕｎｅ－ｓｙｓｔｅｍ．ｉｐｇ??与特异性免疫有关的细胞主要是Ｂ细胞和Ｔ细胞，它们都源于骨髓中的造??血千细胞■?１３，?Ｂ细胞主要参与体液免疫应答，在抗原刺激下会分化为衆细胞，??浆细胞再合成并分泌抗体执行机体的体液免疫＠］。而Ｔ细胞是细胞免疫的主要??细胞，因其功能不同分为若千亚群，有细胞毒性Ｔ细胞（Ｃｙｔｏｔｏｘｉｃ?Ｔ?ｃｅｌｌｓ，ＣＴＬ），??辅助?Ｔ?细胞（Ｈｅｌｐｅｒ?Ｔ?ｃｅｌｌｓ，Ｔｈ），效应?Ｔ?细胞（Ｅｆｆｅｃｔｏｒ?Ｔ?ｃｅｌｌｓ，Ｔｅ），记忆?Ｔ?细胞??２??
华东师范大学博士学位论文???（Ｍｅｍｏｒｙ?Ｔ?ｃｅｌｌ，Ｔｍ），调节／抑制?Ｔ?细胞（Ｒｅｇｕｌａｔｏｒｙ／Ｓｕｐｐｒｅｓｓｏｒ?Ｔ?ｃｅｌｌ）奪．等Ｐ??人体细胞总数釣在４０－６０万亿之间，在众多细胞中每天因物理、化学、病毒??等囡素诱导原痛基因或抑癌基因突变后产生的癌细胞有数千个，Ｓ免疫系统正常??工作时，会启动免疫反应消灭＿这些癌细胞，维持人体健康平衡。但．当免疫系统不??正常工作时，就会打破人体的健康平衡。??Ｓ免疫系统的活性低于正常水平时将导致免疫性缺陷疾病，如图１．１－３左所??示，ＳＴ细胞识别能力减弱或受感染细胞抵抗识别的能力较强时，将导致ｔ细??胞无法说别受感染的细胞，导致受感染细胞得不到及时抑制，Ｈ此可能会导致更??多的细胞受到感染，甚至可能会导致组织或器官受感染，形成癌症或肿瘤等。而??自免疫系统过于活跃时，则会导ｉｃ自身免疫性疾病，如图１．１－３右所示，Ｓｔ细??胞错误识别正常细胞时，会启动免疫系统攻击自身正常组织而导致过度免疫，如??类风湿性关节炎＿、系统性红斑狼疮＾＾］。??■＇ｘ?Ｗｊ??ｍ一＇?ｗ??图１．１－３?（左）Ｔ细胞无法识别癌变或受感染细胞，癌变细胞无法激活Ｔ细胞；（右）Ｔ??细胞错误识别正常细胞，Ｔ细胞被正常细胞激活。??在细胞免疫中，为了攻击入侵的病原体，免疫系统必须能够区分‘４自我”和“非??我”成分。因此未成熟的Ｔ淋巴细胞在骨髓中产生后，就迁移到胸腺中发育在??胸腺内，为保证Ｔ细胞的多样性，Ｔ细胞基因的随机重排产生超过１０１１种Ｔ细??胞，但因为它们是随机产生的，许多Ｔ细胞可能会结合自身抗原导致自身免疫??性疾病，因此Ｔ细胞进入外周血液循环之前需经过
【参考文献】：
期刊论文
[1]Age-related differences in celiac disease: Specific characteristics of adult presentation[J]. Santiago Vivas,Luis Vaquero,Laura Rodríguez-Martín,Alberto Caminero. World Journal of Gastrointestinal Pharmacology and Therapeutics. 2015(04)
[2]Clinical and diagnostic aspects of gluten related disorders[J]. Francesco Tovoli,Chiara Masi,Elena Guidetti,Giulia Negrini,Paola Paterini,Luigi Bolondi. World Journal of Clinical Cases. 2015(03)
本文编号：3273964
【文章来源】：华东师范大学上海市 211工程院校 985工程院校 教育部直属院校
【文章页数】：99 页
【学位级别】：博士
【部分图文】：
图１．１－１人体兔疫系统
有部分病原体进入细胞，进入细胞后的病原体则??会启动第三道免疫防线。??有颌的脊椎动物，如人类，有一个适应性的免疫系统，使它们能够产生特定??的免疫反应［１４］，这就是由免疫器官（胸腺、淋巴结和脾脏等）和免疫细胞（淋巴细??胞）组成的第三道防线，能特异性的识别病原体９这是人体在出生以后根据病．原??体类型特异性建重起来的，国此叫特异性免疫或获得性免疫这种免疫在对??特定病原体做出免疫反应后会产生免疫记忆區迎，从而增强在下次遇到同＾病??．原体时的免疫反应，这也是接种疫苗的基矗??图１．１－２人体免疫系统。??ｈｔｔｐｓ：／／ａｓｋｔｈｅｓｃｉｅｎｔｉｓｔｓ．ｃｏｍ／ｗｐ－ｃｏｎｔｅｎｔ／ｕｐｌｏａｄｓ／２０１７／０９／ｉｍｍｕｎｅ－ｓｙｓｔｅｍ．ｉｐｇ??与特异性免疫有关的细胞主要是Ｂ细胞和Ｔ细胞，它们都源于骨髓中的造??血千细胞■?１３，?Ｂ细胞主要参与体液免疫应答，在抗原刺激下会分化为衆细胞，??浆细胞再合成并分泌抗体执行机体的体液免疫＠］。而Ｔ细胞是细胞免疫的主要??细胞，因其功能不同分为若千亚群，有细胞毒性Ｔ细胞（Ｃｙｔｏｔｏｘｉｃ?Ｔ?ｃｅｌｌｓ，ＣＴＬ），??辅助?Ｔ?细胞（Ｈｅｌｐｅｒ?Ｔ?ｃｅｌｌｓ，Ｔｈ），效应?Ｔ?细胞（Ｅｆｆｅｃｔｏｒ?Ｔ?ｃｅｌｌｓ，Ｔｅ），记忆?Ｔ?细胞??２??
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【参考文献】：
期刊论文
[1]Age-related differences in celiac disease: Specific characteristics of adult presentation[J]. Santiago Vivas,Luis Vaquero,Laura Rodríguez-Martín,Alberto Caminero. World Journal of Gastrointestinal Pharmacology and Therapeutics. 2015(04)
[2]Clinical and diagnostic aspects of gluten related disorders[J]. Francesco Tovoli,Chiara Masi,Elena Guidetti,Giulia Negrini,Paola Paterini,Luigi Bolondi. World Journal of Clinical Cases. 2015(03)
本文编号：3273964
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