基于miRNAs芯片的喉鳞状细胞癌致癌机制的初步分析

发布时间：2017-11-07 14:17

  本文关键词：基于miRNAs芯片的喉鳞状细胞癌致癌机制的初步分析

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【摘要】：目的 miRNA芯片筛选与喉鳞状细胞癌(1aryngeal squamous cell carcinoma,LSCC)形成相关的差异miRNA s,结合生物信息学分析确定并进一步验证具有诊疗价值的目标miRNAs。方法AffymetrixGeneChipmiRNAArray3.0芯片对5对LSCC组织及相应的癌旁组织行差异miRNAs的筛选,原始数据上传Gene Expression Omnibus数据库。采用Mev软件中配对方式t检验进行芯片探针的差异分析,经Affymetrix Analysis Center分析后将差异探针转换为差异表达的miRNAs;选择我们前期工作确定的微小染色体维持蛋白4(mini chromosome maintenance protein4,MCM4)作为核心基因,采用Mirfocus数据库生物信息学分析MCM4的调控miRNAs并结合相关文献确定目标miRNAs;采用RT-PCR在另外21对LSCC组织及相应的癌旁组织中验证目标miRNAs。结果经差异筛选分析,有127个差异表达的miRNAs,其中78个miRNAs在肿瘤组织中高表达,49个miRNAs在肿瘤组织中低表达;采用Mirfocus数据库生物信息学分析参与核心基因MCM4的调控miRNAs并结合相关文献,确定高表达的hsa-miR-183-5p、hsa-miR-24-3p为与MCM4调控作用相关的目标miRNAs;hsa-miR-30a-5p为另一个潜在的目标miRNA,且在肿瘤组织中低表达;通过RTPCR验证这3个差异表达的目标miRNAs与芯片筛选结果一致。结论基于miRNAs芯片筛选分析得到的hsa-miR-183-5p、hsa-miR-24-3p及hsa-miR-30a-5p对LSCC的发生发展具有重要调控作用,可作为潜在的诊疗靶点。
【作者单位】： 首都医科大学附属北京同仁医院耳鼻咽喉头颈外科 耳鼻咽喉头颈科学教育部重点实验室(首都医科大学);内蒙古自治区人民医院耳鼻咽喉科;首都医科大学附属北京同仁医院病理科 头颈部分子病理诊断北京市重点试验室;
【基金】：北京市医管局扬帆计划(XMLX201311) 北京市科委重点项目(Z141107002514003) 内蒙古自治区自然科学基金面上项目(2015MS0834)联合资助
【分类号】：R739.65
【正文快照】： 头颈肿瘤是世界范围内第6常见的恶性肿瘤。据统计,每年死于头颈肿瘤的患者全球约有200 000人,其中90%为上皮源性m。而喉鳞状细胞癌(laryngealx squamous cell carcinoma,LSCC)在头颈部上皮来源H ^ 的原发恶性肿瘤中排第2位,也是最为常见的头颈鳞状细!胞癌(head and neck squam

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