SOX10点突变致Waardenburg综合征2型一家系分析

发布时间：2021-07-08 20:57

　　目的对1例Waardenburg综合征2型先证者及其家系成员进行基因测序分析,探讨其可能的分子生物学病因,进一步探讨Waardenburg综合征2型的分子遗传学特征。方法对所收集家系进行临床诊断,提取家系成员的外周血DNA,目标基因进行区域捕获测序,扩增的PCR产物酶切后进行测序分析,利用软件及遗传学网站的信息分析数据。结果先证者存在SOX10基因杂合突变c.346C>T（p.Q116X）,该突变为无义突变,可能造成蛋白截短体,经家系验证分析,先证者父母该位点均无变异,此变异为新发突变,保守性分析提示具有高度保守性,多个物种氨基酸序列一致。结论 SOX10基因c.346C>T（p.Q116X）在此Waardenburg综合征2型一家系为一新发突变位点,该突变可能造成蛋白截短,进而影响SOX10基因功能,该结果为进一步深入研究Waardenburg综合征,了解SOX10基因功能提供了线索。 

【文章来源】：中华耳科学杂志. 2020,18(05)北大核心CSCD

【文章页数】：4 页

【部分图文】：

家系图谱

高通量测序结果显示先证者位于SOX10基因的2号外显子发生一处杂合突变，c.346C>T(p.Q116X），即编码区第346号核苷酸由胞嘧啶变异为胸腺嘧啶，造成氨基酸改变p.Q116X，即116位的谷氨酰胺转变为终止密码子，导致基因编码蛋白截断，从而丧失功能。HGMD数据库未有该位点的相关性报道，Clin Var数据库无该位点致病性分析结果；c.346C>T的CADD预测Raw Score为6.787656,PHRED分值为36，预测结果为“致病性”变异（图2）。生物信息学蛋白功能预测软件SIFT、Poly‐Phen＿2、Mutation Taster、GERP++、REVEL分别预测分别为未知、未知、有害、有害和未知(具体见表1)。根据ACMG指南[5,6]，该变异初步判定为致病性变异（Pathogenic），判定证据级别为PVS1+PS2+PM2。经家系验证分析，先证者父母该位点均无变异，此变异为新发突变（图3）。保守性分析提示具有高度保守性，多个物种氨基酸序列一致（图4）。

生物信息学蛋白功能预测软件SIFT、Poly‐Phen＿2、Mutation Taster、GERP++、REVEL分别预测分别为未知、未知、有害、有害和未知(具体见表1)。根据ACMG指南[5,6]，该变异初步判定为致病性变异（Pathogenic），判定证据级别为PVS1+PS2+PM2。经家系验证分析，先证者父母该位点均无变异，此变异为新发突变（图3）。保守性分析提示具有高度保守性，多个物种氨基酸序列一致（图4）。图4 p.Q116X在多个物种中具有高度的序列保守性

【参考文献】：
期刊论文
[1]SOX10基因在内耳发育中的作用[J]. 郝青青,侯琨,钟玲玲,任巍,郭维维,杨仕明.  中华耳科学杂志. 2017(02)
[2]SOX10基因在Waardenburg综合征发病中的作用研究进展[J]. 张华,冯永.  中华耳鼻咽喉头颈外科杂志. 2013 (12)



本文编号：3272322