RP11-169D4.1-001、AC026166.2-001在喉癌中的表达及其临床意义分析

发布时间：2017-05-06 21:15

  本文关键词：RP11-169D4.1-001、AC026166.2-001在喉癌中的表达及其临床意义分析，，由笔耕文化传播整理发布。

【摘要】：目的喉癌是最常见的头颈部肿瘤之一,其分子机制仍未明确,因此,从分子水平上进行喉癌发生、发展机制的研究将为喉癌的诊治提供新的方向。最近的研究表明,lnc RNA在肿瘤发生、发展过程中扮演重要角色。既往有研究发现lnc RNA与头颈部肿瘤关系密切,但缺乏喉癌相关lnc RNA的研究,尤其喉癌相关的lnc RNA表达谱仍是空白。发现并鉴定与喉癌相关的lnc RNA对于提高我们对喉癌发病机制的认识将有重要的意义。本研究拟先揭示喉癌相关lnc RNA表达谱,并探索RP11-169D4.1-001、AC026166.2-001在喉癌中的表达及其临床意义。方法1.用基因芯片技术比较喉癌组织、癌旁正常组织中lnc RNA的表达谱,通过lnc RNA表达芯片,获得喉癌相关lnc RNA表达图谱并进行基因本体(Gene Ontology,GO)分析。2.采用实时定量逆转录-聚合酶链式反应(quantitative reverse transcription-polymerase chain reaction,q RT-PCR)检测87对喉癌患者的喉癌组织和癌旁正常组织、淋巴结组织中lnc RNA RP11-169D4.1-001、AC026166.2-001的表达情况。3.通过克隆测序技术证实PCR产物中lnc RNA RP11-169D4.1-001、AC026166.2-001的存在。4.分析lnc RNA RP11-169D4.1-001、AC026166.2-001表达水平与喉癌患者临床病理因素、生存时间的关系,揭示其可能的临床意义。结果1.通过基因芯片分析喉癌相关lnc RNA表达谱,我们发现了684种lnc RNA在喉癌组织中表达上调差异2倍,747种lnc RNA在喉癌组织中表达下调差异2倍。2.RP11-169D4.1-001在芯片结果中表达上调5.26倍(P=0.002),AC026166.2-001在芯片表达谱中表达下调13.01倍(P=0.008)。3.RP11-169D4.1-001在喉癌组织中显著低表达(P0.001),且在转移淋巴结中显著低表达(P0.05)。伴随淋巴结转移患者RP11-169D4.1-001表达水平显著低于不伴淋巴结转移患者(P=0.007)。RP11-169D4.1-001在肿瘤组织中的表达水平和年龄、肿瘤位置、病理类型、吸烟史无显著相关性。4.与癌旁正常组织比较发现,AC026166.2-001在喉癌组织中显著低表达(P0.05),且在转移淋巴结中显著低表达(P0.001)。AC026166.2-001在肿瘤组织中的表达水平和年龄、肿瘤位置、病理类型、淋巴结转移、吸烟史无显著相关性。5.结合生存曲线分析,RP11-169D4.1-001、AC026166.2-001在肿瘤组织中的表达水平和生存时间相关(P0.05)。结论本研究是国内外首个较系统研究喉鳞状细胞癌相关lnc RNA表达谱的研究。RP11-169D4.1-001、AC026166.2-001在喉癌发生发展过程中可能起重要作用,为喉癌的诊断和靶向治疗提供思路,并为喉鳞状细胞癌的预后判断提供新线索。
【关键词】：喉癌 长链非编码RNA 表达谱 RP11-169D4.1-001 AC026166.2-001
【学位授予单位】：宁波大学
【学位级别】：硕士
【学位授予年份】：2015
【分类号】：R739.65
【目录】：

• 摘要5-7
• Abstract7-11
• 引言11-13
• 1 研究内容和技术路线13-15
• 1.1 研究内容13-14
• 1.1.1 建立喉鳞状细胞癌相关lnc RNA的表达谱13
• 1.1.2 基因克隆测序技术验证q RT-PCR产物13
• 1.1.3 分析喉癌组织中RP11-169D4.1-001的表达水平与临床意义13
• 1.1.4 分析喉癌组织中AC026166.2-001的表达水平与临床意义13-14
• 1.2 技术路线14-15
• 2 材料与方法15-23
• 2.1 材料15-17
• 2.1.1 主要仪器设备15
• 2.1.2 主要试剂15-16
• 2.1.3 入组的患者情况16-17
• 2.1.4 患者知情同意情况17
• 2.2 方法17-23
• 2.2.1 组织样本的收取与保存17-18
• 2.2.2 总RNA定量与纯度分析18
• 2.2.3 lnc RNA表达芯片分析18
• 2.2.4 研究差异表达lnc RNA所涉及的GO条目分析18
• 2.2.5 实时定量RT-PCR引物合成18-19
• 2.2.6 q RT-PCR技术检测lnc RNA的水平19-21
• 2.2.7 PCR产物纯化21-22
• 2.2.8 克隆测序22
• 2.2.9 统计分析22-23
• 3 实验结果23-37
• 3.1 建立喉鳞状细胞癌相关的lnc RNA的表达谱23-26
• 3.2 差异表达lnc RNA所涉及的GO条目分析26-27
• 3.3 RP11-169D4.1-001在喉癌芯片表达谱中的表达情况27-28
• 3.4 RP11-169D4.1-001在喉癌组织大样本中的表达水平28-29
• 3.5 AC026166.2-001喉癌芯片表达谱中的表达情况29-30
• 3.6 AC026166.2-001在喉癌组织大样本中的表达水平30-31
• 3.7 对RP11-169D4.1-001、AC026166.2-001的PCR产物进行测序31-32
• 3.8 RP11-169D4.1-001、AC026166.2-001的表达水平与喉癌患者临床病理因素的关系32-34
• 3.9 RP11-169D4.1-001和AC026166.2-001的表达水平和生存时间的关系34-37
• 4 讨论37-40
• 5 结论40-41
• 参考文献41-43
• 附录A 综述43-60
• 参考文献54-60
• 附录B 缩略词60-61
• 在学 研究成果61-62
• 致谢62

【参考文献】

中国期刊全文数据库 前1条

1 胡安;金晓杰;;mir-21与mir-375在喉鳞状细胞癌中的表达[J];临床耳鼻咽喉头颈外科杂志;2012年18期

  本文关键词：RP11-169D4.1-001、AC026166.2-001在喉癌中的表达及其临床意义分析，由笔耕文化传播整理发布。

本文编号：349173