山西地区耳聋流行病学调查及分子病因学分析

发布时间：2017-05-13 21:00

  本文关键词：山西地区耳聋流行病学调查及分子病因学分析，由笔耕文化传播整理发布。

【摘要】：目的:对山西地区各地市特殊教育学校的1011例非综合征性耳聋患者进行GJB2基因及mt DNA 12Sr RNA基因1555位点突变的筛查,探讨山西地区GJB2基因及mt DNA1555位点的突变发生率及热点突变,为该地区今后的基因治疗以及耳聋预防提供依据。抽取20例进行基因芯片检测,采用芯片技术筛查山西地区耳聋患者基因突变热点。方法;1、收集并整理山西地区所有耳聋患者的临床症状,挑选符合非综合征性耳聋的患者标本,标号并提取相应基因组DNA;2、针对GJB2基因及mt DNA 12S r RNA基因1555位点设计特异性引物,并同时进行体外扩增、酶切及测序,然后与相应正常基因序列进行比对,从而得到该地区耳聋患者的突变位点信息。3、从1011例标本中随机抽取20例,通过Affynetrix公司Cyto Scan 750K基因芯片技术进行耳聋基因诊断。结果;1、1011例患者中,有232例检测到GJB2基因突变,突变率达22.95%。共35个突变位点:c.IVS1-35、c.21G-T、c.30-35del C、c.35del G、c.54C-A、c.79G-A、c.88A-G、c.109G-A、c.127G-C、c.139G-T、c.167del T、c.176-191del16、c.186C-T、c.187C-T、c.199C-T、c.223C-T、c.226C-A、c.235del C、c.253T-C、c.270A-C、c.271G-C、c.277A-G、c.283G-A、c.299-300del AT、c.319A-G、c.328del G、c.336G-T、c.341 A-G、c.368C-A、c.457G-A、c.512-513ins AACG、c.553C-T、c.558G-A、c.608T-C、c.765T-C。c.79G-A、c.341A-G、c.457G-A、c.608T-C、c.765T-C属于多态位点,突变率分别为32.15%、28.39%、0.10%、2.67%、6.82%;新发现突变位点11例为c.IVS1-35、c.127G-C、c.558G-A、c.512-513ins AACG、c.512-513ins AACG、c.88A-G、c.186C-T、c.187C-T、c.199C-T、c.277A-G、c.319A-G。所有突变位点中,c.235del C比率最高,为13.06%;依次是c.299-300del AT(3.17%)、c.109G-A(2.47%)、c.368C-A(1.38%)、c.176-191del16(1.19%)。2、1011例患者中15例患者被检出线粒体基因1555A-G突变,突变率为1.5%(15/1011)。3、20例标本中18例进行Affynetrix公司Cyto Scan 750K芯片检测,被测样本并未发现与数据库中已知耳聋基因关联的变异,发现7、9和11号3个样本有相似的重复,4号标本有较大缺失,且在Y染色体上有大的重复,其他样本还显示到一些重复或缺失。结论:1、山西地区耳聋基因突变以GJB2基因突变率最高,与戴朴等在全国范围开展的耳聋流行病学调查结果相一致;2、山西地区耳聋基因突变筛查和统计的完成,为该地区耳聋的早期诊断与治疗提供了理论依据,为今后临床治疗工作的开展提供可靠的理论基础,该地区耳聋基因突变资料库的建立将为山西其他地区耳聋患者突变数据库的建立奠定了坚实的基础,同时也丰富了我国耳聋资料库。3、采用基因芯片对18例患者进行耳聋相关基因突变位点检测,检出率低,可能由于基因芯片检测成本极高,本次检测标本数少等原因而导致检测结果不准确,有待于扩大样本进一步探讨。
【关键词】：耳聋 基因突变 GJB2 mt DNA 12S rRNA 1555 基因芯片
【学位授予单位】：山西医科大学
【学位级别】：硕士
【学位授予年份】：2015
【分类号】：R764.43
【目录】：

• 摘要6-8
• Abstract8-11
• 前言11-13
• 第一部分 山西地区耳聋患者GJB2 基因分子流行病学研究13-24
• 1 材料与方法13-18
• 1.1 实验材料13-14
• 1.2 实验方法14-18
• 2 结果18-22
• 2.1 全血基因组DNA制备结果18
• 2.2 GJB2 基因目的片段扩增结果18
• 2.3 GJB2 基因目的片段测序结果18-22
• 3 讨论22-24
• 第二部分 山西地区耳聋患者MTDNA 12SRRNA基因分子流行病学研究24-30
• 1 材料与方法24-27
• 1.1 实验材料24-25
• 1.2 实验方法25-27
• 2 结果27-29
• 2.1 MTDNA 12SRRNA基因目的片段扩增结果27
• 2.2 限制性内切酶Alw26I酶切分析结果27
• 2.3 mtDNA 12SrRNA基因目的片段测序结果27-29
• 3 讨论29-30
• 第三部分 基因芯片检测耳聋基因热点突变30-38
• 1 材料与方法30-35
• 1.1 实验材料30-31
• 1.2 实验方法31-35
• 2 结果35-37
• 2.1 基因组DNA电泳检测结果35
• 2.2 PCR产物检测结果35
• 2.3 片段质量化控制35-36
• 2.4 芯片检测结果36-37
• 3 讨论37-38
• 结论38-39
• 参考文献39-41
• 综述41-50
• 参考文献47-50
• 致谢50-51
• 在学期间承担/参与的科研课题与研究成果51-52
• 个人简历52

【参考文献】

中国期刊全文数据库 前8条

1 李磊;杨涛;吴皓;;耳聋基因的筛查与诊断[J];诊断学理论与实践;2010年05期

2 戴朴,于飞,康东洋,张昕,刘新,米文宗,曹菊阳,袁慧军,杨伟炎,吴柏林,韩东一;线粒体DNA1555位点和GJB2基因及SLC26A4基因的诊断方法及临床应用[J];中华耳鼻咽喉头颈外科杂志;2005年10期

3 戴朴;刘新;于飞;朱庆文;袁永一;杨淑芝;孙R，

本文编号：363578