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三个中国视网膜色素变性家系临床及分子遗传学研究

发布时间:2017-09-25 18:15

  本文关键词:三个中国视网膜色素变性家系临床及分子遗传学研究


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【摘要】:目的研究三个中国视网膜色素变性(retinitis pigmentosa,RP)家系RP-01、RP-02及RP-03的临床表型特征及其遗传学病因。对其中两个X连锁视网膜色素变性家系RP-01、RP-02进行RP2、RPGR基因突变筛查,对常染色体显性遗传视网膜色素变性家系RP-03进行全外显子测序,以筛查其致病突变。方法1.临床研究:获取知情同意后,对三个家系进行病史采集及临床检查,包括:视力、屈光状态、眼前节裂隙灯检查、直接及间接眼底镜检查、眼底照相、视网膜电图(ERG)、视野检查等。2.分子遗传学研究:2.1抽取家系成员外周静脉血5ml,采用美国Roche公司的DNA分离试剂盒进行基因组DNA提取。2.2对RP-01及RP-02家系中全部患者进行RP2、RPGR基因序列分析,将其外显子扩增后进行直接双向测序;对RP-03家系进行全外显子测序,筛出候选致病基因,并对候选基因进行直接测序,验证候选基因突变结果是否全外显子测序结果一致。结果1、RP-01家系共3代,16名家系成员,7例患者,其中男性3例,女性4例。通过对该家系进行RPGR基因测序分析,发现其外显子ORF15 c DNA第2002出现一个C碱基的插入突变c.2002dup C(p.H668Pfs X4),该突变可产生一个含671个氨基酸的截短蛋白,100例正常人对照未检测出此突变。2、RP-02家系共4代,14名家系成员,5例患者,其中男性2例,女性3例。对RPGR基因进行突变筛查,发现在外显子ORF15 c DNA第2899位均出现一个G碱基的缺失突变c.2899del G(p.F967Lfs X121),该突变产生一个含1087个氨基酸的截短蛋白,100例正常人对照未检测出此突变。3、RP-03家系共3代29人,5例患者,均为女性。其致病突变发生在TOPORS基因第2外显子,在c DNA第2371位出现一个无义突变,c.2371AT(p.K791X),该突变可产生一个含790个氨基酸的截短蛋白。100例正常人对照未检测出此突变。结论1、RPGR基因exon ORF15 c.2002dup C突变是引起RP-01家系发生X连锁视网膜色素变性的主要原因;RPGR基因exon ORF15 c.2899del G突变是引起RP-02家系致发生X连锁视网膜色素变性的主要原因;TOPORS基因exon 2c.2371AT突变是引起RP-03家系发生常染色体显性遗传视网膜色素变性的主要原因。2、3个家系所发生突变均为新突变,在国内外未曾报导过。
【关键词】:视网膜色素变性 RP2 RPGR ORF15 TOPORS 突变 全外显子测序
【学位授予单位】:天津医科大学
【学位级别】:硕士
【学位授予年份】:2016
【分类号】:R774.1
【目录】:
  • 中文摘要4-6
  • Abstract6-10
  • 缩略语10-11
  • 前言11-13
  • 研究现状、成果11-12
  • 研究目的、方法12-13
  • 一、两个X连锁视网膜色素变性家系致病基因的研究13-26
  • 1.1 对象和方法13-17
  • 1.1.1 研究对象13-14
  • 1.1.2 仪器设备及试剂耗材14-15
  • 1.1.3 基因组DNA提取15
  • 1.1.4 基因突变筛查15-16
  • 1.1.5 DNA序列分析16-17
  • 1.2 结果17-22
  • 1.2.1 RP-01家系临床表型及基因突变筛查结17-19
  • 1.2.2 RP-02家系临床表型及基因突变筛查结果19-22
  • 1.3 讨论22-25
  • 1.3.1 XLRP有关的遗传位点22-23
  • 1.3.2 RPGR基因的相关研究23-25
  • 1.4 小结25-26
  • 二、全外显子测序法对一个adRP家系进行致病基因筛查26-36
  • 2.1 对象和方法26-31
  • 2.1.1 研究对象26
  • 2.1.2 仪器设备和试剂耗材26
  • 2.1.3 基因组DNA提取26-27
  • 2.1.4 全外显子测序27-31
  • 2.2 结果31-33
  • 2.2.1 RP-03家系部分成员临床表型31
  • 2.2.2 RP-03家系基因突变筛查结果31-33
  • 2.3 讨论33-35
  • 2.3.1 TOPORS基因的结构及功能33-34
  • 2.3.2 TOPORS基因突变引起RP的发病机制34-35
  • 2.4 小结35-36
  • 结论36-37
  • 参考文献37-42
  • 发表论文和参加科研情况说明42-43
  • 附录43-48
  • 综述 视网膜色素变性相关基因的研究进展48-56
  • 综述参考文献51-56
  • 致谢56-57
  • 个人简历57

【参考文献】

中国期刊全文数据库 前6条

1 邢东军;黄秀峰;金子兵;;视网膜色素变性的基因诊断技术历史与进展[J];分子诊断与治疗杂志;2014年01期

2 夏小平;赵丽娜;朱鹏宇;田东华;宋国祥;;一个中国视网膜色素变性家系的RP3基因突变[J];眼科研究;2008年08期

3 张馨方;盛迅伦;;视网膜色素变性的相关基因研究进展[J];国际眼科杂志;2006年03期

4 陆莎莎,赵晨,崔云,李宁东,张秀梅,赵堪兴;我国常染色体显性遗传视网膜色素变性家系中PRPF31基因新的剪切位点突变[J];中华眼科杂志;2005年04期

5 李宁东;视网膜色素变性的分子发病机制[J];国外医学.眼科学分册;2003年06期

6 张丰生,张清炯,申煌煊,黎仕强,肖学珊;视网膜色素变性中视紫红质与Peripherin/RDS基因的突变筛查[J];眼科学报;1998年04期



本文编号:918854

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