慢性胰腺炎miRNA-mRNA调控网络分析和miRNA早期诊断标志物的筛选与鉴定

发布时间：2017-12-08 20:02

  本文关键词：慢性胰腺炎miRNA-mRNA调控网络分析和miRNA早期诊断标志物的筛选与鉴定

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【摘要】：第一部分 慢性胰腺炎miRNA-mRNA调控网络的分析目的:探索慢性胰腺炎潜在的分子机制和生物标志物,构建miRNA-mRNA调控网络,以期指导临床实践中对该疾病的诊断和治疗。方法:从Gene Expression Atlas收集慢性胰腺炎患者和健康人群的miRNA和mRNA表达谱,并筛查差异表达的miRNAs和基因,分析其功能特点和信号通路,最终构建慢性胰腺炎miRNA-mRNA调控网络。结果:共筛选出44个miRNA相关风险基因通路,基于ABL1、MYC和ANAPC13三个对慢性胰腺炎影响程度最大的基因构建调控网络。另外,发现NOTCH3、COX5A、THBS1和KARS四个风险基因和hsa-miR-324-5p这一风险miRNA具有对慢性胰腺炎较高的预测准确度。结论:本研究分析了慢性胰腺炎中miRNA和mRNA表达谱,并筛选出具有较高预测准确度的1个风险miRNA(hsa-miR-324-5p)和4个风险基因(NOTCH3、COX5A、THBS1和KARS),并将其作为慢性胰腺炎的生物标志物,同时进一步深入探讨了慢性胰腺炎的发病机理,为疾病的靶向诊治提供了新的思路。第二部分 慢性胰腺炎早期诊断血清miRNA生物标志物的筛选与鉴定目的:慢性胰腺炎以不可逆的形态学损伤和纤维化为特征,早期诊断和治疗可以最大程度地改善胰腺功能、提高生活质量。作为重要的标志物,miRNA已应用于其它脏器的诊断和预后评估,但目前尚未作为生物标志物应用于早期慢性胰腺炎的诊断。本研究的目的在于探索慢性胰腺炎血清中特异性miRNA,以期通过miRNA血清生物标志物对慢性胰腺炎进行早期诊断。方法:通过生物信息学方法收集Gene Expression Omnibus中慢性胰腺炎患者差异表达的miRNA,并采取10位早期CP患者、10位晚期CP患者和18位健康对照者的血清进行验证。同时,用基因芯片比较早期慢性胰腺炎患者和晚期患者血清中miRNA的差异表达。结果:从Gene Expression Omnibus中获取了在慢性胰腺炎中差异表达的hsa-miR-320a、hsa-miR-320b、hsa-miR-320c和hsa-miR-320d四个miRNA,其主要用于预测晚期慢性胰腺炎。基因芯片结果显示,早期慢性胰腺炎患者的hsa-miR-221和hsa-miR-130a差异表达,其预测准确度分别为100%和87.5%。联合以上6种miRNA,可以提高诊断慢性胰腺炎的敏感性和特异性。另外,早期慢性胰腺炎和晚期慢性胰腺炎患者的miRNA表达谱存在差异。整合分析和功能对比显示,慢性胰腺炎不同病程阶段的生物学进程和信号通路不尽相同。结论:慢性胰腺炎不同病程阶段的生物标志物存在差异。作为预测和早期诊断CP的生物标志物,联合以上6种血清miRNA具有临床应用前景。
【学位授予单位】：第二军医大学
【学位级别】：硕士
【学位授予年份】：2016
【分类号】：R576

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本文编号：1267629