共聚焦显微内镜诊断胰胆管狭窄的荟萃分析及胆管癌的加权基因共表达模块构建

发布时间：2020-04-17 22:33

【摘要】：目的:狭窄性病变是胆胰系统的常见疾病,包括良性和恶性两类,其中恶性狭窄的常见原因为胆管癌(cholangiocarcinoma,CCA),独特的生物学特性常使其难以和良性狭窄鉴别开。传统诊断方式如组织取样的敏感度较低,无法准确诊断胰胆管狭窄病人。共聚焦显微内镜(confocal laser endomicroscopy,CLE)作为一种新型内镜技术,能为检查者提供病变组织的实时显微信息,近年来已应用于胰胆管狭窄的诊断,但各研究间的诊断结果存在着较大的差异。本研究第一部分利用荟萃分析的方式评估CLE、组织取样、CLE联合组织取样三种方法对未确定性质的胰胆管狭窄的诊断效能,以期为建立准确有效的诊断方案提供依据。此外,随着CLE研究的深入,CLE分子成像诊断研究逐渐成为热点,而疾病特异靶点的选择是影响CLE分子成像的关键因素之一。本研究第二部分采用加权基因共表达网络分析(weighted gene coexpression network analysis,WGCNA)的方式识别与CCA相关的模块与关键基因,以期为CLE分子成像应用于CCA的诊断研究奠定基础,并为更深层次了解CCA的病因病机提供线索。方法:1.搜索Pubmed,Cochrane Library,Embase数据库中使用CLE诊断未确定性质的胰胆管狭窄的文献。纳入研究在经过质量评估后,对研究中诊断效应值进行合并。在构建汇总受试者工作曲线后,进一步借助软件分别计算三种方法的曲线下面积,并使用回归分析、敏感性分析、亚组分析来进一步分析CLE的诊断效果。2.选择来源于基因表达综合数据库的CCA基因表达谱数据GSE89747进行分析。在对数据进行预处理后,使用WGCNA分别建立肿瘤和肿瘤-正常样本共表达模块,并对其中含基因较多的模块完成富集分析。在识别出与CCA肿瘤发生最相关的模块后,进一步构建了蛋白-蛋白互作网络,并最终鉴别出与CCA发生相关的枢纽基因。结果:1.纳入12篇文献,涉及591位患者。这些文献中有9篇同时评估了组织取样方法的诊断价值,4篇评估了CLE联合组织取样方法的诊断效能。其中CLE的汇总敏感度、特异度、曲线下面积分别为87%(95%CI,83-91%),76%(95%CI,70-81%),0.8705;组织取样方法对应的三个值分别为64%(95%CI,57-70%),94%(95%CI,90-97%),0.8040;联合诊断对应的三个值分别为93%(95%CI,88-96%),82%(95%CI,74-89%),0.9377。敏感性分析示CLE对胰胆管狭窄的诊断结果稳定性良好。亚组分析结果表明,使用巴黎分类标准组中CLE的汇总特异性高于使用迈阿密分类标准组(79%VS 70%),使用导管组的汇总特异性高于使用胆管镜通道组(71%VS 68%)。回归分析结果显示,纳入各项对CLE诊断胰胆管狭窄结果的异质性均无显著影响,在绘制漏斗图后发现无发表偏倚(P=0.9360.05)。2.通过对CCA肿瘤样本表达谱进行共表达模块构建后,最终获得36个显示生物学意义的CCA共表达模块。对包含基因数目排列前五的模块行富集分析后发现,基因主要在泛素介导的蛋白水解、胆汁分泌、补体系统、m TOR信号、PI3KAkt信号等通路显著富集。在对肿瘤和正常组织样本进行联合共表达模块构建后,获得2个与肿瘤发生显著相关的模块,其中tan模块相关程度最高(cor=-0.74,P=2e-9)。在计算tan模块的模块隶属度(module membership,MM)和基因显著性(gene significance,GS)后,选择该模块中具有高模块连通度(MM绝对值0.8)和临床特征关联紧密(GS绝对值0.2)的基因作为候选枢纽基因。通过对tan模块中基因构建蛋白-蛋白互作网络(包含133个节点和409个边界),提取其中62个连通度≥4的节点作为候选枢纽基因。最后定义两组候选枢纽基因的共同部分为关键基因,包括IL6,SELE,BDKRB1,CD79A,IGJ,CTSG,FOSB,IL1R1,NAMPT,C5AR1,S100A8,CCL19,SOCS3,THBS1,ADAMTS1。结论:1.通过荟萃分析的方式评估CLE、组织取样、CLE联合组织取样三种方式对未确定性质的胰胆管狭窄的诊断效能。和组织取样方法相比,CLE可提高鉴别胰胆管狭窄性质的敏感度;使用CLE+组织取样方法联合诊断胰胆管狭窄可能具有良好的诊断效能,未来需要更多研究来验证该种方式的诊断效能。2.通过WGCNA构建CCA的基因共表达模块,鉴别出的模块和关键基因可为CLE分子成像应用于CCA的诊断研究奠定基础,并为进一步理解CCA的分子机制提供帮助。
【图文】：

流程图,文献,流程

文献筛选流程

工作曲线,似然比,比值比,效能

22F图2 共聚焦显微内镜诊断效能的分析结果 (A) 汇总敏感度；（B）汇总特异度；（C）汇总阳性似然比；（D）汇总阴性似然比；（E）诊断比值比；（F）汇总受试者工作曲线Fig 2 Analysis of the diagnostic efficacy results of CLE. (A) Pooled sensitivity; (B)pooled specificity; (C) pooled positive-likelihood ratio (LR); (D) pooled negative LR;(E) diagnostic odds ratio (DOR); (F) the summary receiver-operating characteristic(SROC) curve and area under the curve (AUC).3.2.2 组织取样方法诊断未确定性质的胰胆管狭窄的结果纳入文献中共有 9项研究[16-21,24-26]也同时使用了组织取样方法用以诊断未确定性质的胰胆管狭窄，，总共含有 447个胰胆管狭窄病人。如图 3 所示，组织取样
【学位授予单位】：安徽医科大学
【学位级别】：硕士
【学位授予年份】：2019
【分类号】：R735.8;R575.7

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