乙肝母婴阻断母子血清HBV DNA检测与序列分析
发布时间:2020-05-18 09:26
【摘要】: 目的:分析血清标本检测中HBsAg阴性,HBV DNA阳性结果的可能原因,完善乙肝母婴阻断措施评价检测指标;描述氨基酸位点置换在母婴阻断成功和失败儿童及母亲中的分布,探讨S区、C区氨基酸置换与母婴阻断效果的关系,推测可能与母婴阻断失败相关的HBV氨基酸变异的位点。 方法:本次研究血清来自北京、兰州、宁波三地进行乙肝母婴阻断研究所收集的血清标本,采用酶联免疫吸附法检测乙肝病毒感染的血清学指标。血清HBsAg阳性,抗-HBs阴性儿童定义为母婴阻断失败儿童,其母亲为母婴阻断失败母亲。经QIAamp DNA Blood Mini Kit提取HBV DNA,采用巢式PCR法扩增HBV DNA S区基因片段,半巢式PCR法扩增HBV DNA C区基因片段,分别纯化测序。利用生物信息软件DNA STAR将核苷酸序列与HBVA-H各基因型标准序列比对分析,进行基因分型。利用软件将核苷酸序列推导出氨基酸序列,进行氨基酸位点变异分析。应用SAS9.0整理实验结果,并将符合分析要求的S区、C区序列数据,以每个氨基酸位点为变量,结合HBV的分子生物学特点进行分析。 结果:1、母婴阻断成功母亲血清标本273份,母婴阻断失败母亲血清标本72份,两组HBV DNA阳性数分别为123份、60份,HBV DNA检出率分别为45.05%、83.33%;母婴阻断成功儿童血清标本149份,母婴阻断失败儿童血清标本79份,HBV DNA阳性数分别为18份、69份,HBV DNA检出率分别为12.08%、87.34%。2、HBV DNA检测阳性标本中221份测序得到S基因片段。HBV DNA检测阳性儿童均列为母婴阻断失败儿童,共72份,基因型分别为A型、B型、C型、D型。母婴阻断成功母亲87例,母婴阻断失败母亲62例,两组基因型均为B型、C型、D型构成;在兰州地区B型和C型母亲母婴阻断成功率比较,差异无统计学意义,P=0.8682,。3、共得到179份S基因片段氨基酸序列,其中儿童序列63份,母婴阻断成功14份,母婴阻断失败49份;母亲序列116份,母婴阻断成功69份,母婴阻断失败47份。138份C基因片段氨基酸序列可进行氨基酸位点分析,其中儿童序列42份,母婴阻断成功10份,母婴阻断失败32份;母亲序列96份,母婴阻断成功62份,母婴阻断失败34份。在S区氨基酸位点分析结果显示,母婴阻断儿童中有60.3%(38/63)序列发生氨基酸位点置换,母婴阻断成功母亲和失败母亲分别为72.5%(50/69)、74.5%(35/47),三者差异无统计学意义。4、在母婴阻断成功与失败儿童中,单个氨基酸位点置换率比较有差异的氨基酸位点(OR值95%可信区间不包括1的位点)有,preS区第27、38、65、87、88、114位氨基酸位点,S区第46、122、133、159位氨基酸位点,C区第15、30、33、86、109位氨基酸位点;在母婴阻断成功与失败母亲中,单个氨基酸位点置换比较,在母婴阻断成功组和失败组中有差异的氨基酸位点有,preS区第35、39、45、48、51、54、57、115、121、138、148、152、154位氨基酸位点,S区第5、8、24、56、57、59、64、85、143、161位氨基酸位点。C区第61、80位氨基酸位点。其中某些位点在阻断成功或失败对象中有置换率为0的项。 结论:结合血清中HBV DNA检测指标共同评价母婴阻断措施效果;母婴传播与母亲体内HBV载量成正相关;B型和C型HBV的母亲,母婴阻断成功率无差别,还不能得出基因型与母婴传播及其阻断效果的关系;在母婴阻断成功儿童(HBsAg阴性)和阻断失败儿童(HBsAg阳性)中氨基酸位点置换率无明显差别,母亲体内HBV DNA preS和S区氨基酸位点置换可能与母婴阻断效果有关。
【图文】:
3.2母婴阻断儿童及母亲基因型构成分布72例儿童基因型分布为A、B、C、D四个基因型,B型、C型较多;母婴阻断成功母亲87例,母婴阻断失败母亲62例,两者基因型分布均为B、C、D型,,且B、c型较多(图4)。儿童.卜、匕72例阻断成功母亲阻断失败母亲87例62例图4母婴阻断母亲和儿童基因型构成图 Fig4ThedistributionofgenotyPesinmothersandehildern
【学位授予单位】:中国疾病预防控制中心
【学位级别】:硕士
【学位授予年份】:2008
【分类号】:R512.62;R450
【图文】:
3.2母婴阻断儿童及母亲基因型构成分布72例儿童基因型分布为A、B、C、D四个基因型,B型、C型较多;母婴阻断成功母亲87例,母婴阻断失败母亲62例,两者基因型分布均为B、C、D型,,且B、c型较多(图4)。儿童.卜、匕72例阻断成功母亲阻断失败母亲87例62例图4母婴阻断母亲和儿童基因型构成图 Fig4ThedistributionofgenotyPesinmothersandehildern
【学位授予单位】:中国疾病预防控制中心
【学位级别】:硕士
【学位授予年份】:2008
【分类号】:R512.62;R450
【参考文献】
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1 张权一,张兴义,叶世德,王庭志,徐桂珍,贾国富,田春生,宋益贵,任贵方,朱既明;乙型肝炎病毒基因重组疫苗免疫儿童成人效果及阻断母婴传播的研究[J];病毒学报;1991年S1期
2 刘海英,马玉燕,崔保霞,戴e
本文编号:2669514
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